MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016831	TGA	2	6	610467	610472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_016831	TCA	2	6	610512	610517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954324
13003	NC_016831	TCTT	2	8	610532	610539	0 %	75 %	0 %	25 %	378954324
13004	NC_016831	TGC	2	6	610558	610563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954324
13005	NC_016831	GGTT	2	8	610579	610586	0 %	50 %	50 %	0 %	378954324
13006	NC_016831	CG	3	6	610603	610608	0 %	0 %	50 %	50 %	378954324
13007	NC_016831	TCGG	2	8	610645	610652	0 %	25 %	50 %	25 %	378954324
13008	NC_016831	CCGC	2	8	610655	610662	0 %	0 %	25 %	75 %	378954324
13009	NC_016831	TTC	2	6	610699	610704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954324
13010	NC_016831	ATTTTT	2	12	610792	610803	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	378954324
13011	NC_016831	CTGG	2	8	610810	610817	0 %	25 %	50 %	25 %	378954324
13012	NC_016831	TGGAC	2	10	610847	610856	20 %	20 %	40 %	20 %	378954324
13013	NC_016831	CG	3	6	610860	610865	0 %	0 %	50 %	50 %	378954324
13014	NC_016831	CGC	2	6	610870	610875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954324
13015	NC_016831	TGC	2	6	611125	611130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954325
13016	NC_016831	TGC	2	6	611192	611197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954325
13017	NC_016831	TGG	3	9	611225	611233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954325
13018	NC_016831	CGG	2	6	611334	611339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954325
13019	NC_016831	CCG	2	6	611413	611418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954325
13020	NC_016831	TGC	3	9	611447	611455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954325
13021	NC_016831	GTG	2	6	611494	611499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954325
13022	NC_016831	GCA	3	9	611615	611623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_016831	ACC	2	6	611668	611673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13024	NC_016831	ATC	2	6	611743	611748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954326
13025	NC_016831	TGA	2	6	611750	611755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954326
13026	NC_016831	GTT	2	6	611832	611837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954326
13027	NC_016831	AAC	2	6	611851	611856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954326
13028	NC_016831	CGC	2	6	611963	611968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954326
13029	NC_016831	ACC	2	6	611986	611991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954326
13030	NC_016831	CAT	2	6	612158	612163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954326
13031	NC_016831	GC	4	8	612210	612217	0 %	0 %	50 %	50 %	378954326
13032	NC_016831	ACC	2	6	612355	612360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954326
13033	NC_016831	TAT	2	6	612383	612388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954326
13034	NC_016831	GAA	2	6	612405	612410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954326
13035	NC_016831	TCG	2	6	612412	612417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954326
13036	NC_016831	CAC	2	6	612441	612446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954326
13037	NC_016831	A	6	6	612457	612462	100 %	0 %	0 %	0 %	378954326
13038	NC_016831	GCGA	2	8	612466	612473	25 %	0 %	50 %	25 %	378954326
13039	NC_016831	ACCG	2	8	612501	612508	25 %	0 %	25 %	50 %	378954326
13040	NC_016831	GGT	2	6	612522	612527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954326
13041	NC_016831	CTG	2	6	612645	612650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954326
13042	NC_016831	TCT	2	6	612694	612699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954326
13043	NC_016831	ACCG	2	8	612708	612715	25 %	0 %	25 %	50 %	378954326
13044	NC_016831	TGG	2	6	612733	612738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954326
13045	NC_016831	CGG	2	6	612782	612787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954326
13046	NC_016831	CG	3	6	612805	612810	0 %	0 %	50 %	50 %	378954326
13047	NC_016831	CTG	2	6	612822	612827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954326
13048	NC_016831	GC	3	6	612974	612979	0 %	0 %	50 %	50 %	378954326
13049	NC_016831	ACGT	2	8	612997	613004	25 %	25 %	25 %	25 %	378954326
13050	NC_016831	ACTTTG	2	12	613033	613044	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378954326
13051	NC_016831	GCG	3	9	613057	613065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954326
13052	NC_016831	TTC	2	6	613126	613131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954326
13053	NC_016831	CGC	3	9	613189	613197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954326
13054	NC_016831	TGG	2	6	613294	613299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954326
13055	NC_016831	CGA	2	6	613303	613308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954326
13056	NC_016831	TAC	2	6	613323	613328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954326
13057	NC_016831	GCA	2	6	613342	613347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954326
13058	NC_016831	GCA	2	6	613394	613399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954326
13059	NC_016831	GTA	2	6	613453	613458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954326
13060	NC_016831	CAA	2	6	613505	613510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954327
13061	NC_016831	CAC	2	6	613571	613576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954327
13062	NC_016831	GCG	2	6	613592	613597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954327
13063	NC_016831	AGC	2	6	613626	613631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954327
13064	NC_016831	GCGA	2	8	613688	613695	25 %	0 %	50 %	25 %	378954327
13065	NC_016831	CGGT	2	8	613740	613747	0 %	25 %	50 %	25 %	378954327
13066	NC_016831	GTG	2	6	613775	613780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954327
13067	NC_016831	A	7	7	613821	613827	100 %	0 %	0 %	0 %	378954327
13068	NC_016831	GAC	2	6	613849	613854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954327
13069	NC_016831	GCT	2	6	613873	613878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954327
13070	NC_016831	CTG	2	6	613885	613890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954327
13071	NC_016831	ATG	2	6	613919	613924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954327
13072	NC_016831	TGA	2	6	613927	613932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954327
13073	NC_016831	ACT	2	6	613972	613977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954327
13074	NC_016831	CTGG	2	8	614061	614068	0 %	25 %	50 %	25 %	378954328
13075	NC_016831	GC	3	6	614099	614104	0 %	0 %	50 %	50 %	378954328
13076	NC_016831	GCG	3	9	614174	614182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954328
13077	NC_016831	CTG	2	6	614248	614253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954328
13078	NC_016831	CTG	2	6	614296	614301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954328
13079	NC_016831	AAC	2	6	614306	614311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954328
13080	NC_016831	CTG	2	6	614320	614325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954328
13081	NC_016831	GCG	2	6	614387	614392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954328
13082	NC_016831	AT	3	6	614394	614399	50 %	50 %	0 %	0 %	378954328
13083	NC_016831	GCT	2	6	614451	614456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954328
13084	NC_016831	GAA	2	6	614533	614538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954328
13085	NC_016831	GCC	2	6	614564	614569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954328
13086	NC_016831	GCC	2	6	614589	614594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954328
13087	NC_016831	TG	3	6	614632	614637	0 %	50 %	50 %	0 %	378954328
13088	NC_016831	GAA	2	6	614757	614762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954328
13089	NC_016831	CAC	2	6	614790	614795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954328
13090	NC_016831	CG	4	8	614796	614803	0 %	0 %	50 %	50 %	378954328
13091	NC_016831	GGCGG	2	10	614866	614875	0 %	0 %	80 %	20 %	378954328
13092	NC_016831	GCAG	2	8	614938	614945	25 %	0 %	50 %	25 %	378954328
13093	NC_016831	GC	4	8	615093	615100	0 %	0 %	50 %	50 %	378954328
13094	NC_016831	GC	3	6	615182	615187	0 %	0 %	50 %	50 %	378954328
13095	NC_016831	GAA	2	6	615238	615243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954328
13096	NC_016831	AGC	2	6	615260	615265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954328
13097	NC_016831	TGTC	2	8	615424	615431	0 %	50 %	25 %	25 %	378954329
13098	NC_016831	GCC	2	6	615491	615496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954329
13099	NC_016831	GCCA	2	8	615564	615571	25 %	0 %	25 %	50 %	378954329
13100	NC_016831	GAC	2	6	615595	615600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954329
13101	NC_016831	GAA	2	6	615601	615606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954329
13102	NC_016831	GTG	2	6	615628	615633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954329
13103	NC_016831	TGA	2	6	615641	615646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954329
13104	NC_016831	ACC	2	6	615650	615655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954329
13105	NC_016831	TGA	2	6	615713	615718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954329
13106	NC_016831	TC	3	6	615788	615793	0 %	50 %	0 %	50 %	378954329
13107	NC_016831	TG	3	6	615826	615831	0 %	50 %	50 %	0 %	378954329
13108	NC_016831	TAC	2	6	615835	615840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954329
13109	NC_016831	GC	3	6	615878	615883	0 %	0 %	50 %	50 %	378954329
13110	NC_016831	CAG	2	6	616042	616047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954329
13111	NC_016831	ACT	2	6	616133	616138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954329
13112	NC_016831	GGCTAT	2	12	616162	616173	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378954329
13113	NC_016831	CGA	2	6	616218	616223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954329
13114	NC_016831	TCA	2	6	616226	616231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954329
13115	NC_016831	GCG	2	6	616261	616266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954329
13116	NC_016831	GAA	2	6	616284	616289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954329
13117	NC_016831	ATCGGT	2	12	616294	616305	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378954329
13118	NC_016831	TGGT	2	8	616349	616356	0 %	50 %	50 %	0 %	378954329
13119	NC_016831	CG	4	8	616380	616387	0 %	0 %	50 %	50 %	378954329
13120	NC_016831	TGC	2	6	616421	616426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954329
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13240	NC_016831	CCA	2	6	621407	621412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954334
13241	NC_016831	GCG	2	6	621463	621468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954334
13242	NC_016831	TGA	2	6	621479	621484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954334
13243	NC_016831	TTC	2	6	621493	621498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954334
13244	NC_016831	GCT	2	6	621504	621509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954334
13245	NC_016831	GAACA	2	10	621550	621559	60 %	0 %	20 %	20 %	378954334
13246	NC_016831	TGG	2	6	621614	621619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954334
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13259	NC_016831	AACTG	2	10	621921	621930	40 %	20 %	20 %	20 %	378954334
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13261	NC_016831	TGGCTG	2	12	622003	622014	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378954334
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13263	NC_016831	CTG	2	6	622063	622068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954334
13264	NC_016831	TGG	2	6	622075	622080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954334
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13268	NC_016831	AAT	2	6	622380	622385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13269	NC_016831	GAT	2	6	622491	622496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13270	NC_016831	TG	3	6	622554	622559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13271	NC_016831	TTA	2	6	622634	622639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954335
13272	NC_016831	CGG	2	6	622666	622671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954335
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13339	NC_016831	TGA	2	6	625673	625678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13342	NC_016831	AAC	2	6	625980	625985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13343	NC_016831	ATT	2	6	626111	626116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13344	NC_016831	CGG	2	6	626125	626130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13345	NC_016831	ATA	2	6	626134	626139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13346	NC_016831	TGG	2	6	626189	626194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13347	NC_016831	TA	3	6	626245	626250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13352	NC_016831	ATT	2	6	626413	626418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13353	NC_016831	ATA	2	6	626438	626443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13354	NC_016831	TGT	2	6	626538	626543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954338
13355	NC_016831	TGGG	2	8	626544	626551	0 %	25 %	75 %	0 %	378954338
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