MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_016831	GCA	2	6	541091	541096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954259
11502	NC_016831	AGT	2	6	541130	541135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954259
11503	NC_016831	TAA	2	6	541148	541153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954259
11504	NC_016831	CTG	2	6	541185	541190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954259
11505	NC_016831	AAAT	2	8	541230	541237	75 %	25 %	0 %	0 %	378954259
11506	NC_016831	TAA	2	6	541273	541278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954259
11507	NC_016831	AT	3	6	541289	541294	50 %	50 %	0 %	0 %	378954259
11508	NC_016831	ATA	2	6	541330	541335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954259
11509	NC_016831	GAT	2	6	541358	541363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954259
11510	NC_016831	AGA	2	6	541370	541375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954259
11511	NC_016831	GAAT	2	8	541420	541427	50 %	25 %	25 %	0 %	378954259
11512	NC_016831	TAA	2	6	541461	541466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954259
11513	NC_016831	ACA	2	6	541478	541483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954259
11514	NC_016831	TAT	2	6	541534	541539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954259
11515	NC_016831	AG	3	6	541541	541546	50 %	0 %	50 %	0 %	378954259
11516	NC_016831	ATT	2	6	541562	541567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954259
11517	NC_016831	TA	3	6	541570	541575	50 %	50 %	0 %	0 %	378954259
11518	NC_016831	AGT	2	6	541737	541742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954259
11519	NC_016831	ATA	2	6	541815	541820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954259
11520	NC_016831	ACT	2	6	541865	541870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954259
11521	NC_016831	TA	3	6	541879	541884	50 %	50 %	0 %	0 %	378954259
11522	NC_016831	GTA	2	6	541917	541922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954259
11523	NC_016831	ACTC	2	8	541959	541966	25 %	25 %	0 %	50 %	378954259
11524	NC_016831	ATC	2	6	542029	542034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954259
11525	NC_016831	AATA	2	8	542039	542046	75 %	25 %	0 %	0 %	378954259
11526	NC_016831	CAA	2	6	542055	542060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954259
11527	NC_016831	TTTG	2	8	542143	542150	0 %	75 %	25 %	0 %	378954259
11528	NC_016831	ATT	2	6	542165	542170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954259
11529	NC_016831	AT	3	6	542202	542207	50 %	50 %	0 %	0 %	378954259
11530	NC_016831	CAA	2	6	542214	542219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954259
11531	NC_016831	ACCC	2	8	542220	542227	25 %	0 %	0 %	75 %	378954259
11532	NC_016831	AAT	2	6	542231	542236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954259
11533	NC_016831	AAT	2	6	542244	542249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954259
11534	NC_016831	A	7	7	542342	542348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_016831	TAA	2	6	542352	542357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_016831	CAT	2	6	542375	542380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11537	NC_016831	TAT	2	6	542433	542438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_016831	ATT	2	6	542443	542448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_016831	TAA	2	6	542477	542482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_016831	TCT	2	6	542554	542559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11541	NC_016831	GAC	2	6	542574	542579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954260
11542	NC_016831	AG	3	6	542581	542586	50 %	0 %	50 %	0 %	378954260
11543	NC_016831	TGA	2	6	542661	542666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954260
11544	NC_016831	TGG	2	6	542677	542682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954260
11545	NC_016831	CCAT	2	8	542700	542707	25 %	25 %	0 %	50 %	378954260
11546	NC_016831	CAA	2	6	542709	542714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954260
11547	NC_016831	CAT	2	6	542746	542751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954260
11548	NC_016831	AGT	2	6	542764	542769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954260
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11550	NC_016831	CATA	2	8	542868	542875	50 %	25 %	0 %	25 %	378954260
11551	NC_016831	AATG	2	8	542895	542902	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_016831	CGAT	2	8	542919	542926	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11553	NC_016831	AAT	2	6	543024	543029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_016831	AT	3	6	543064	543069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_016831	T	8	8	543168	543175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_016831	G	6	6	543208	543213	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_016831	ATAAA	2	10	543251	543260	80 %	20 %	0 %	0 %	378954261
11558	NC_016831	A	6	6	543258	543263	100 %	0 %	0 %	0 %	378954261
11559	NC_016831	AGT	2	6	543368	543373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954261
11560	NC_016831	CTG	2	6	543392	543397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11561	NC_016831	GAA	2	6	543536	543541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_016831	ACG	2	6	543558	543563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_016831	CGT	2	6	543741	543746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11564	NC_016831	CTGG	2	8	543747	543754	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11565	NC_016831	A	6	6	543838	543843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_016831	TG	3	6	543995	544000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_016831	AGG	2	6	544084	544089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_016831	T	6	6	544140	544145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11570	NC_016831	T	6	6	544213	544218	0 %	100 %	0 %	0 %	378954262
11571	NC_016831	CGC	2	6	544239	544244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954262
11572	NC_016831	CTT	2	6	544254	544259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954262
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11574	NC_016831	GCC	2	6	544324	544329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954262
11575	NC_016831	CGA	2	6	544428	544433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954262
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11581	NC_016831	CCAG	2	8	544540	544547	25 %	0 %	25 %	50 %	378954262
11582	NC_016831	TCA	2	6	544631	544636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954262
11583	NC_016831	AT	3	6	544646	544651	50 %	50 %	0 %	0 %	378954262
11584	NC_016831	CGC	2	6	544663	544668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954262
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11590	NC_016831	CATCG	2	10	544957	544966	20 %	20 %	20 %	40 %	378954262
11591	NC_016831	GAAG	2	8	545024	545031	50 %	0 %	50 %	0 %	378954262
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11593	NC_016831	TCG	2	6	545117	545122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954262
11594	NC_016831	ATG	2	6	545135	545140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954262
11595	NC_016831	CTG	2	6	545145	545150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11596	NC_016831	TAA	2	6	545163	545168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_016831	A	6	6	545211	545216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_016831	GTT	2	6	545268	545273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_016831	ATGG	2	8	545381	545388	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11603	NC_016831	CAACTT	2	12	545544	545555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954263
11604	NC_016831	TGT	2	6	545574	545579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954263
11605	NC_016831	CGGTCG	2	12	545585	545596	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378954263
11606	NC_016831	GAA	2	6	545659	545664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954263
11607	NC_016831	TTC	2	6	545731	545736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954263
11608	NC_016831	TTA	2	6	545746	545751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954263
11609	NC_016831	CG	3	6	546001	546006	0 %	0 %	50 %	50 %	378954263
11610	NC_016831	TGC	2	6	546029	546034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954263
11611	NC_016831	TAT	2	6	546054	546059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954263
11612	NC_016831	TAAA	2	8	546188	546195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_016831	TTA	2	6	546371	546376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954264
11614	NC_016831	GTA	2	6	546502	546507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954264
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11621	NC_016831	GCC	2	6	547129	547134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954264
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11988	NC_016831	TCA	2	6	564297	564302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954284
11989	NC_016831	T	6	6	564352	564357	0 %	100 %	0 %	0 %	378954284
11990	NC_016831	CG	3	6	564371	564376	0 %	0 %	50 %	50 %	378954284
11991	NC_016831	GAC	2	6	564386	564391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954284
11992	NC_016831	GGCG	2	8	564450	564457	0 %	0 %	75 %	25 %	378954284
11993	NC_016831	GCT	2	6	564510	564515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954284
11994	NC_016831	GCT	2	6	564555	564560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954284
11995	NC_016831	GC	3	6	564647	564652	0 %	0 %	50 %	50 %	378954284
11996	NC_016831	GGC	2	6	564654	564659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954284
11997	NC_016831	GAC	2	6	564717	564722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954284
11998	NC_016831	GCT	2	6	564735	564740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954284
11999	NC_016831	GGGCCT	2	12	564834	564845	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378954284
12000	NC_016831	GGC	2	6	565000	565005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954284

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