MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_016831	GC	4	8	516494	516501	0 %	0 %	50 %	50 %	378954240
11002	NC_016831	CCAA	2	8	516518	516525	50 %	0 %	0 %	50 %	378954240
11003	NC_016831	CTT	2	6	516633	516638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954240
11004	NC_016831	GGCACC	2	12	516640	516651	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378954240
11005	NC_016831	TTG	2	6	516665	516670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954240
11006	NC_016831	TAT	2	6	516718	516723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954240
11007	NC_016831	GAT	2	6	516732	516737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954240
11008	NC_016831	TTTG	2	8	517076	517083	0 %	75 %	25 %	0 %	378954240
11009	NC_016831	TGCG	2	8	517178	517185	0 %	25 %	50 %	25 %	378954240
11010	NC_016831	GT	3	6	517222	517227	0 %	50 %	50 %	0 %	378954240
11011	NC_016831	GCT	3	9	517323	517331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954240
11012	NC_016831	AT	3	6	517413	517418	50 %	50 %	0 %	0 %	378954240
11013	NC_016831	TAA	2	6	517431	517436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954240
11014	NC_016831	GCTG	2	8	517544	517551	0 %	25 %	50 %	25 %	378954240
11015	NC_016831	GAC	2	6	517620	517625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954240
11016	NC_016831	TGC	2	6	517634	517639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954240
11017	NC_016831	GCGCG	2	10	517668	517677	0 %	0 %	60 %	40 %	378954240
11018	NC_016831	CGA	2	6	517752	517757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954240
11019	NC_016831	ATG	2	6	517765	517770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954240
11020	NC_016831	CGG	2	6	517871	517876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954240
11021	NC_016831	GCT	2	6	517917	517922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954240
11022	NC_016831	TCA	2	6	517988	517993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954240
11023	NC_016831	GAA	2	6	518005	518010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954240
11024	NC_016831	TC	3	6	518018	518023	0 %	50 %	0 %	50 %	378954240
11025	NC_016831	TGA	2	6	518085	518090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954240
11026	NC_016831	CAT	2	6	518142	518147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954240
11027	NC_016831	GTT	2	6	518159	518164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954240
11028	NC_016831	GAT	2	6	518199	518204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954240
11029	NC_016831	AGCGAA	2	12	518226	518237	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378954240
11030	NC_016831	CGT	2	6	518247	518252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954240
11031	NC_016831	TTG	2	6	518261	518266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954240
11032	NC_016831	GCC	2	6	518333	518338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954240
11033	NC_016831	A	7	7	518366	518372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_016831	AAT	2	6	518537	518542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954241
11035	NC_016831	GA	3	6	518605	518610	50 %	0 %	50 %	0 %	378954241
11036	NC_016831	CAT	2	6	518636	518641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954241
11037	NC_016831	AGA	2	6	518737	518742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954241
11038	NC_016831	AACC	2	8	518781	518788	50 %	0 %	0 %	50 %	378954241
11039	NC_016831	CGC	2	6	518849	518854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954241
11040	NC_016831	GAA	2	6	518906	518911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954241
11041	NC_016831	TTC	2	6	518948	518953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954241
11042	NC_016831	CGC	2	6	519101	519106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954241
11043	NC_016831	ACA	2	6	519238	519243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954241
11044	NC_016831	GAA	3	9	519341	519349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954241
11045	NC_016831	GAA	2	6	519473	519478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954241
11046	NC_016831	T	7	7	519532	519538	0 %	100 %	0 %	0 %	378954241
11047	NC_016831	GCT	2	6	519545	519550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954241
11048	NC_016831	CAG	2	6	519554	519559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954241
11049	NC_016831	CAA	2	6	519571	519576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954241
11050	NC_016831	AC	4	8	519688	519695	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11051	NC_016831	TAA	2	6	519698	519703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_016831	TGA	2	6	519711	519716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_016831	TACTG	2	10	519748	519757	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11054	NC_016831	ATGAAA	2	12	519761	519772	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_016831	GTC	2	6	519826	519831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11056	NC_016831	TGAC	2	8	519957	519964	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11057	NC_016831	AGC	2	6	519980	519985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_016831	GCG	2	6	519992	519997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11059	NC_016831	GTG	2	6	520118	520123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_016831	ATC	2	6	520262	520267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_016831	TTA	2	6	520337	520342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_016831	CGC	2	6	520395	520400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11063	NC_016831	CGG	2	6	520427	520432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11064	NC_016831	GCT	2	6	520453	520458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_016831	TC	3	6	520478	520483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11066	NC_016831	GCC	2	6	520555	520560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11067	NC_016831	CGA	2	6	520574	520579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11068	NC_016831	CGG	2	6	520629	520634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11069	NC_016831	CAA	2	6	520642	520647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_016831	ATG	2	6	520714	520719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_016831	CCG	2	6	520724	520729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11072	NC_016831	CGG	2	6	520730	520735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11073	NC_016831	GCG	2	6	520813	520818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_016831	TCC	2	6	520858	520863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11075	NC_016831	GGT	2	6	520890	520895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_016831	GCA	2	6	520940	520945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11077	NC_016831	TGC	2	6	520952	520957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11078	NC_016831	TGA	2	6	521006	521011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_016831	TGC	2	6	521018	521023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11080	NC_016831	GCGCTG	2	12	521038	521049	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11081	NC_016831	ACGCT	2	10	521075	521084	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11082	NC_016831	GCG	2	6	521106	521111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11083	NC_016831	GTC	2	6	521146	521151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11084	NC_016831	CAG	2	6	521249	521254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11085	NC_016831	TGA	2	6	521264	521269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954242
11086	NC_016831	GAT	2	6	521295	521300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954242
11087	NC_016831	GAT	2	6	521364	521369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954242
11088	NC_016831	CCA	2	6	521386	521391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954242
11089	NC_016831	ACC	2	6	521446	521451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954242
11090	NC_016831	AGT	2	6	521457	521462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954242
11091	NC_016831	ATC	2	6	521470	521475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954242
11092	NC_016831	GCC	2	6	521561	521566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954242
11093	NC_016831	TC	3	6	521591	521596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11094	NC_016831	GAA	2	6	521682	521687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_016831	T	6	6	521693	521698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_016831	GCC	2	6	521743	521748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954243
11097	NC_016831	TCT	2	6	521782	521787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954243
11098	NC_016831	GCA	2	6	521840	521845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954243
11099	NC_016831	CG	3	6	521884	521889	0 %	0 %	50 %	50 %	378954243
11100	NC_016831	TTCA	2	8	521895	521902	25 %	50 %	0 %	25 %	378954243
11101	NC_016831	CGG	2	6	521927	521932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954243
11102	NC_016831	CGC	2	6	521967	521972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954243
11103	NC_016831	GCCC	2	8	522017	522024	0 %	0 %	25 %	75 %	378954243
11104	NC_016831	GCG	2	6	522029	522034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954243
11105	NC_016831	CAG	2	6	522075	522080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954243
11106	NC_016831	TGA	2	6	522121	522126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954243
11107	NC_016831	TCC	2	6	522148	522153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378954243
11108	NC_016831	GCG	2	6	522263	522268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954243
11109	NC_016831	TCGGGA	2	12	522271	522282	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378954243
11110	NC_016831	TGG	2	6	522410	522415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954243
11111	NC_016831	GAT	2	6	522417	522422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954243
11112	NC_016831	TCA	2	6	522427	522432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954243
11113	NC_016831	A	6	6	522442	522447	100 %	0 %	0 %	0 %	378954243
11114	NC_016831	CGG	3	9	522489	522497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954243
11115	NC_016831	ATT	2	6	522504	522509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954243
11116	NC_016831	CG	3	6	522543	522548	0 %	0 %	50 %	50 %	378954243
11117	NC_016831	GCA	2	6	522551	522556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954243
11118	NC_016831	CGC	2	6	522632	522637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954243
11119	NC_016831	CGA	2	6	522649	522654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954243
11120	NC_016831	TG	3	6	522663	522668	0 %	50 %	50 %	0 %	378954243
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11122	NC_016831	ATA	2	6	522849	522854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11228	NC_016831	A	6	6	527563	527568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11231	NC_016831	ATCG	2	8	527719	527726	25 %	25 %	25 %	25 %	378954248
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11245	NC_016831	TGG	2	6	528449	528454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954248
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11247	NC_016831	GC	3	6	528481	528486	0 %	0 %	50 %	50 %	378954248
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11260	NC_016831	ACTTAC	2	12	529081	529092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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