MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_016831	GCG	2	6	469526	469531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954193
10002	NC_016831	GATG	2	8	469621	469628	25 %	25 %	50 %	0 %	378954193
10003	NC_016831	CA	3	6	469647	469652	50 %	0 %	0 %	50 %	378954193
10004	NC_016831	A	6	6	469707	469712	100 %	0 %	0 %	0 %	378954193
10005	NC_016831	GCC	2	6	469714	469719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954193
10006	NC_016831	GCC	2	6	469760	469765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954193
10007	NC_016831	TG	3	6	469789	469794	0 %	50 %	50 %	0 %	378954193
10008	NC_016831	GTC	2	6	469810	469815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954193
10009	NC_016831	TGC	2	6	469827	469832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954193
10010	NC_016831	GC	3	6	469831	469836	0 %	0 %	50 %	50 %	378954193
10011	NC_016831	GTC	2	6	469879	469884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954193
10012	NC_016831	TGC	2	6	469896	469901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954193
10013	NC_016831	GTA	2	6	469943	469948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954193
10014	NC_016831	CGG	2	6	469959	469964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954193
10015	NC_016831	CG	3	6	470028	470033	0 %	0 %	50 %	50 %	378954193
10016	NC_016831	GCA	2	6	470092	470097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954193
10017	NC_016831	CGC	2	6	470161	470166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954193
10018	NC_016831	CGC	2	6	470182	470187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954193
10019	NC_016831	TGA	2	6	470229	470234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954193
10020	NC_016831	CGC	2	6	470331	470336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954193
10021	NC_016831	TGG	2	6	470388	470393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954193
10022	NC_016831	AC	4	8	470437	470444	50 %	0 %	0 %	50 %	378954193
10023	NC_016831	TGAA	2	8	470449	470456	50 %	25 %	25 %	0 %	378954193
10024	NC_016831	CGATG	2	10	470552	470561	20 %	20 %	40 %	20 %	378954194
10025	NC_016831	CG	4	8	470570	470577	0 %	0 %	50 %	50 %	378954194
10026	NC_016831	GGC	2	6	470642	470647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954194
10027	NC_016831	GCG	2	6	470679	470684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954194
10028	NC_016831	GAA	2	6	470742	470747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954194
10029	NC_016831	GC	3	6	470831	470836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10030	NC_016831	GTC	2	6	470911	470916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_016831	CTG	2	6	471064	471069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_016831	CG	3	6	471084	471089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10033	NC_016831	TCG	2	6	471140	471145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_016831	GTG	2	6	471151	471156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_016831	CAT	2	6	471194	471199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954195
10036	NC_016831	GGT	2	6	471221	471226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954195
10037	NC_016831	TGC	2	6	471235	471240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954195
10038	NC_016831	CAG	2	6	471254	471259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954195
10039	NC_016831	GGC	2	6	471317	471322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954195
10040	NC_016831	CAG	2	6	471336	471341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954195
10041	NC_016831	GC	3	6	471489	471494	0 %	0 %	50 %	50 %	378954195
10042	NC_016831	GTG	2	6	471579	471584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954195
10043	NC_016831	CCA	2	6	471601	471606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954195
10044	NC_016831	CGG	2	6	471610	471615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954195
10045	NC_016831	TAA	2	6	471626	471631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954195
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10047	NC_016831	CGG	2	6	471682	471687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954195
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10049	NC_016831	CTC	2	6	471717	471722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378954195
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10051	NC_016831	CGC	2	6	471737	471742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954195
10052	NC_016831	GTT	2	6	471803	471808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954195
10053	NC_016831	CTG	2	6	471828	471833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954195
10054	NC_016831	GTG	2	6	471834	471839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954195
10055	NC_016831	GGC	2	6	471843	471848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954195
10056	NC_016831	GGT	2	6	471854	471859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954195
10057	NC_016831	GC	3	6	471867	471872	0 %	0 %	50 %	50 %	378954195
10058	NC_016831	TAA	2	6	471881	471886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954195
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10062	NC_016831	CG	3	6	471949	471954	0 %	0 %	50 %	50 %	378954195
10063	NC_016831	AAC	2	6	471990	471995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954195
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10069	NC_016831	TGC	2	6	472120	472125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954195
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10072	NC_016831	CTG	2	6	472236	472241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954195
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10083	NC_016831	GCG	2	6	472657	472662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_016831	CGCC	2	8	472679	472686	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10085	NC_016831	CGC	2	6	472697	472702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10086	NC_016831	GTG	2	6	472735	472740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_016831	TGG	2	6	472745	472750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_016831	TTC	2	6	472825	472830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_016831	GCC	2	6	472850	472855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10090	NC_016831	CAG	2	6	472873	472878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_016831	CTG	2	6	472958	472963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_016831	CGG	2	6	472997	473002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_016831	CTG	2	6	473011	473016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_016831	GTG	2	6	473035	473040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_016831	GGC	3	9	473047	473055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_016831	CCG	2	6	473099	473104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10097	NC_016831	GCA	2	6	473190	473195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_016831	TCG	2	6	473250	473255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10100	NC_016831	GCA	2	6	473374	473379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10103	NC_016831	CGC	2	6	473641	473646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954196
10104	NC_016831	GCG	2	6	473730	473735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954196
10105	NC_016831	GGC	2	6	473753	473758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954196
10106	NC_016831	GGC	2	6	473781	473786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954196
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10109	NC_016831	ACC	2	6	473931	473936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954196
10110	NC_016831	TGC	2	6	474023	474028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954196
10111	NC_016831	GC	3	6	474106	474111	0 %	0 %	50 %	50 %	378954196
10112	NC_016831	ACGCC	2	10	474115	474124	20 %	0 %	20 %	60 %	378954196
10113	NC_016831	GAT	2	6	474158	474163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954196
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10116	NC_016831	CCT	2	6	474232	474237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378954196
10117	NC_016831	CCAG	2	8	474296	474303	25 %	0 %	25 %	50 %	378954196
10118	NC_016831	GCG	2	6	474306	474311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954196
10119	NC_016831	GGCCA	2	10	474327	474336	20 %	0 %	40 %	40 %	378954196
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10240	NC_016831	TGA	2	6	479804	479809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954201
10241	NC_016831	TGG	2	6	479851	479856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954201
10242	NC_016831	AGT	2	6	479858	479863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954201
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10272	NC_016831	GC	3	6	481220	481225	0 %	0 %	50 %	50 %	378954203
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10296	NC_016831	AT	3	6	482615	482620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10297	NC_016831	GCAG	2	8	482638	482645	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10314	NC_016831	TGG	2	6	483327	483332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10347	NC_016831	T	6	6	484635	484640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10348	NC_016831	CTG	2	6	484790	484795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954207
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10351	NC_016831	A	8	8	484998	485005	100 %	0 %	0 %	0 %	378954207
10352	NC_016831	GAT	2	6	485048	485053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954207
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10355	NC_016831	ATG	2	6	485167	485172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954208
10356	NC_016831	TTCTG	2	10	485197	485206	0 %	60 %	20 %	20 %	378954208
10357	NC_016831	GC	4	8	485226	485233	0 %	0 %	50 %	50 %	378954208
10358	NC_016831	T	7	7	485292	485298	0 %	100 %	0 %	0 %	378954208
10359	NC_016831	CGG	2	6	485344	485349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954208
10360	NC_016831	GCGG	2	8	485368	485375	0 %	0 %	75 %	25 %	378954208
10361	NC_016831	GT	3	6	485392	485397	0 %	50 %	50 %	0 %	378954208
10362	NC_016831	GCTG	2	8	485401	485408	0 %	25 %	50 %	25 %	378954208
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10364	NC_016831	GCT	3	9	485501	485509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954208
10365	NC_016831	TCG	2	6	485518	485523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954208
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10367	NC_016831	TTAA	2	8	485621	485628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10368	NC_016831	AAAG	2	8	485631	485638	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10369	NC_016831	GCT	2	6	485696	485701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10487	NC_016831	TGC	2	6	491430	491435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954213
10488	NC_016831	CGCGA	2	10	491436	491445	20 %	0 %	40 %	40 %	378954213
10489	NC_016831	GCG	3	9	491456	491464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954213
10490	NC_016831	CGG	2	6	491542	491547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954213
10491	NC_016831	TGGCGC	2	12	491562	491573	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378954213
10492	NC_016831	GC	5	10	491570	491579	0 %	0 %	50 %	50 %	378954213
10493	NC_016831	CTG	2	6	491603	491608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954213
10494	NC_016831	GC	3	6	491622	491627	0 %	0 %	50 %	50 %	378954213
10495	NC_016831	GAA	2	6	491678	491683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954213
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10497	NC_016831	GTG	3	9	491747	491755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954213
10498	NC_016831	CGG	2	6	491872	491877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954213
10499	NC_016831	GC	3	6	491892	491897	0 %	0 %	50 %	50 %	378954213
10500	NC_016831	GCC	2	6	491976	491981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954213

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