MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
77501	NC_016831	ATG	2	6	3664262	3664267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77502	NC_016831	CGT	2	6	3664271	3664276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77503	NC_016831	GCTGG	2	10	3664309	3664318	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
77504	NC_016831	GCATGG	2	12	3664319	3664330	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77505	NC_016831	CCG	2	6	3664339	3664344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77506	NC_016831	CCG	2	6	3664365	3664370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77507	NC_016831	GGC	2	6	3664421	3664426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77508	NC_016831	GCC	2	6	3664460	3664465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77509	NC_016831	CGC	2	6	3664581	3664586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77510	NC_016831	GCC	2	6	3664628	3664633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77511	NC_016831	ACT	2	6	3664722	3664727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77512	NC_016831	CAAAGC	2	12	3664858	3664869	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77513	NC_016831	GTG	2	6	3664871	3664876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77514	NC_016831	A	7	7	3664963	3664969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77515	NC_016831	TCG	2	6	3664998	3665003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77516	NC_016831	TCCT	2	8	3665036	3665043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77517	NC_016831	GAC	2	6	3665070	3665075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77518	NC_016831	CAT	2	6	3665098	3665103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77519	NC_016831	TCG	2	6	3665104	3665109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77520	NC_016831	ACC	2	6	3665151	3665156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77521	NC_016831	CAC	2	6	3665185	3665190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77522	NC_016831	TGA	2	6	3665245	3665250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77523	NC_016831	CGG	2	6	3665283	3665288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77524	NC_016831	CGG	2	6	3665415	3665420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77525	NC_016831	GCTG	2	8	3665498	3665505	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77526	NC_016831	GTG	2	6	3665577	3665582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77527	NC_016831	CATT	2	8	3665627	3665634	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77528	NC_016831	GGCG	2	8	3665663	3665670	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77529	NC_016831	CGG	2	6	3665725	3665730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77530	NC_016831	CATGT	2	10	3665745	3665754	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77531	NC_016831	TGC	2	6	3665758	3665763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77532	NC_016831	CGC	2	6	3665858	3665863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77533	NC_016831	GCC	2	6	3665886	3665891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77534	NC_016831	GTCGGC	2	12	3665907	3665918	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77535	NC_016831	GGAAGA	2	12	3665930	3665941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77536	NC_016831	ACG	2	6	3665983	3665988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378957226
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77538	NC_016831	GGC	2	6	3666058	3666063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378957226
77539	NC_016831	GGGCT	2	10	3666071	3666080	0 %	20 %	60 %	20 %	378957226
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77543	NC_016831	GAT	2	6	3666227	3666232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378957226
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77545	NC_016831	TCG	2	6	3666261	3666266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378957226
77546	NC_016831	GCG	2	6	3666326	3666331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378957226
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77552	NC_016831	CGG	2	6	3666653	3666658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378957227
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77554	NC_016831	CCG	2	6	3666705	3666710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378957227
77555	NC_016831	GCTG	2	8	3666729	3666736	0 %	25 %	50 %	25 %	378957227
77556	NC_016831	CGCA	2	8	3666782	3666789	25 %	0 %	25 %	50 %	378957227
77557	NC_016831	GTG	2	6	3666796	3666801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378957227
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77559	NC_016831	CG	3	6	3666834	3666839	0 %	0 %	50 %	50 %	378957227
77560	NC_016831	CCG	2	6	3666868	3666873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378957227
77561	NC_016831	CG	3	6	3666893	3666898	0 %	0 %	50 %	50 %	378957227
77562	NC_016831	GCT	2	6	3666915	3666920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378957227
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77564	NC_016831	CTGAA	2	10	3666935	3666944	40 %	20 %	20 %	20 %	378957227
77565	NC_016831	GC	3	6	3667025	3667030	0 %	0 %	50 %	50 %	378957227
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77568	NC_016831	GC	3	6	3667156	3667161	0 %	0 %	50 %	50 %	378957227
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77572	NC_016831	CGA	2	6	3667431	3667436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378957227
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77574	NC_016831	CG	3	6	3667458	3667463	0 %	0 %	50 %	50 %	378957227
77575	NC_016831	GGGGAA	2	12	3667516	3667527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378957227
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77578	NC_016831	TCAT	2	8	3667815	3667822	25 %	50 %	0 %	25 %	378957228
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77589	NC_016831	T	6	6	3668290	3668295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77590	NC_016831	ATC	3	9	3668313	3668321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77591	NC_016831	CAC	2	6	3668331	3668336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77592	NC_016831	TACA	3	12	3668369	3668380	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77593	NC_016831	CGC	2	6	3668441	3668446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378957231
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77607	NC_016831	A	7	7	3669505	3669511	100 %	0 %	0 %	0 %	378957232
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77613	NC_016831	A	6	6	3669755	3669760	100 %	0 %	0 %	0 %	378957233
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