MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
75001	NC_016831	GCC	2	6	3549346	3549351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75002	NC_016831	TGC	3	9	3549353	3549361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75003	NC_016831	ATT	2	6	3549366	3549371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75004	NC_016831	CTG	2	6	3549392	3549397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75005	NC_016831	TC	3	6	3549405	3549410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75006	NC_016831	AC	3	6	3549492	3549497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75007	NC_016831	CGT	3	9	3549510	3549518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75008	NC_016831	AGC	2	6	3549691	3549696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75009	NC_016831	C	6	6	3549696	3549701	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75010	NC_016831	ACG	2	6	3549745	3549750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75011	NC_016831	TGA	2	6	3549825	3549830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75012	NC_016831	CCG	2	6	3549853	3549858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75013	NC_016831	ACC	2	6	3549940	3549945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75014	NC_016831	CCT	2	6	3550022	3550027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75015	NC_016831	CTC	2	6	3550059	3550064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75016	NC_016831	AGG	2	6	3550076	3550081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75017	NC_016831	CCA	2	6	3550103	3550108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75018	NC_016831	GGT	2	6	3550163	3550168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75019	NC_016831	CAT	2	6	3550358	3550363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75020	NC_016831	GCC	2	6	3550433	3550438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75021	NC_016831	TAA	2	6	3550558	3550563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75022	NC_016831	CAGC	2	8	3550571	3550578	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75023	NC_016831	GACT	2	8	3550589	3550596	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75024	NC_016831	TC	3	6	3550687	3550692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75025	NC_016831	ACC	2	6	3550717	3550722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75026	NC_016831	TCA	2	6	3550816	3550821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75027	NC_016831	AC	4	8	3550857	3550864	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75028	NC_016831	C	6	6	3550917	3550922	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75029	NC_016831	AACG	2	8	3551159	3551166	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75030	NC_016831	CGACT	2	10	3551178	3551187	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
75031	NC_016831	TCGCT	2	10	3551205	3551214	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
75032	NC_016831	CTTT	2	8	3551333	3551340	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75033	NC_016831	ATG	2	6	3551343	3551348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75034	NC_016831	GCT	2	6	3551349	3551354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75035	NC_016831	GTT	2	6	3551439	3551444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75036	NC_016831	ACG	2	6	3551454	3551459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75037	NC_016831	GT	3	6	3551476	3551481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75038	NC_016831	TCGGT	2	10	3551685	3551694	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
75039	NC_016831	CA	3	6	3551869	3551874	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75040	NC_016831	GTAC	2	8	3551899	3551906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75041	NC_016831	GTCA	2	8	3551982	3551989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75042	NC_016831	GGA	2	6	3552005	3552010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75043	NC_016831	C	6	6	3552015	3552020	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75044	NC_016831	CG	3	6	3552107	3552112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75045	NC_016831	AC	3	6	3552134	3552139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75046	NC_016831	CTC	2	6	3552160	3552165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75047	NC_016831	TCGC	2	8	3552171	3552178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75048	NC_016831	TCA	2	6	3552453	3552458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75049	NC_016831	GA	3	6	3552476	3552481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75050	NC_016831	AAC	2	6	3552488	3552493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75051	NC_016831	GTT	2	6	3552498	3552503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75052	NC_016831	TCAC	2	8	3552600	3552607	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75053	NC_016831	CCG	2	6	3552651	3552656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75054	NC_016831	TCA	2	6	3552734	3552739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75055	NC_016831	TG	3	6	3552747	3552752	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75056	NC_016831	CTT	2	6	3552769	3552774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75057	NC_016831	AGG	2	6	3552782	3552787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75058	NC_016831	CTAC	2	8	3552880	3552887	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75059	NC_016831	GT	3	6	3552923	3552928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75060	NC_016831	ACG	2	6	3553024	3553029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75061	NC_016831	GT	3	6	3553092	3553097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75062	NC_016831	ATG	2	6	3553117	3553122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75063	NC_016831	TCC	2	6	3553143	3553148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75064	NC_016831	CAA	2	6	3553195	3553200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75065	NC_016831	GAC	2	6	3553256	3553261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75066	NC_016831	GCA	2	6	3553268	3553273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75067	NC_016831	TTC	2	6	3553314	3553319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75068	NC_016831	TTC	2	6	3553344	3553349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75069	NC_016831	GCC	2	6	3553587	3553592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75070	NC_016831	TCC	2	6	3553607	3553612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75071	NC_016831	C	6	6	3553651	3553656	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75072	NC_016831	TGCG	2	8	3553739	3553746	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75073	NC_016831	GCT	2	6	3553797	3553802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75074	NC_016831	CTT	2	6	3553822	3553827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75075	NC_016831	TGC	2	6	3553845	3553850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75076	NC_016831	TTA	2	6	3553853	3553858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75077	NC_016831	TCC	2	6	3553871	3553876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75078	NC_016831	CTT	2	6	3553906	3553911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75079	NC_016831	CTG	2	6	3553965	3553970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75080	NC_016831	TCG	2	6	3554040	3554045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75081	NC_016831	CAA	2	6	3554068	3554073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75082	NC_016831	AGT	2	6	3554165	3554170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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75084	NC_016831	GCT	2	6	3554239	3554244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75085	NC_016831	GCC	2	6	3554279	3554284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75086	NC_016831	CA	3	6	3554433	3554438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75087	NC_016831	CGG	2	6	3554585	3554590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75088	NC_016831	TG	3	6	3554593	3554598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75089	NC_016831	GTT	2	6	3554601	3554606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75090	NC_016831	GTG	2	6	3554615	3554620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75091	NC_016831	AAT	2	6	3554665	3554670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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75099	NC_016831	CATT	2	8	3555092	3555099	25 %	50 %	0 %	25 %	378957126
75100	NC_016831	GC	3	6	3555106	3555111	0 %	0 %	50 %	50 %	378957126
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75104	NC_016831	CAC	2	6	3555220	3555225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378957126
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75106	NC_016831	AT	4	8	3555403	3555410	50 %	50 %	0 %	0 %	378957126
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75110	NC_016831	C	6	6	3555733	3555738	0 %	0 %	0 %	100 %	378957127
75111	NC_016831	CGC	2	6	3555792	3555797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378957127
75112	NC_016831	GC	3	6	3555905	3555910	0 %	0 %	50 %	50 %	378957127
75113	NC_016831	GAT	2	6	3555937	3555942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378957127
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75121	NC_016831	CGCC	2	8	3556342	3556349	0 %	0 %	25 %	75 %	378957127
75122	NC_016831	TCATC	2	10	3556405	3556414	20 %	40 %	0 %	40 %	378957127
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75239	NC_016831	TCC	2	6	3562381	3562386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75240	NC_016831	TAGCA	2	10	3562414	3562423	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75241	NC_016831	ACGA	2	8	3562424	3562431	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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