MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_016831	TGC	2	6	330298	330303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954092
7002	NC_016831	GAAT	2	8	330313	330320	50 %	25 %	25 %	0 %	378954092
7003	NC_016831	ATT	2	6	330333	330338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954092
7004	NC_016831	TGC	2	6	330346	330351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954092
7005	NC_016831	GCT	2	6	330368	330373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954092
7006	NC_016831	T	6	6	330380	330385	0 %	100 %	0 %	0 %	378954092
7007	NC_016831	CGT	2	6	330393	330398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954092
7008	NC_016831	GAA	2	6	330416	330421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954092
7009	NC_016831	TCT	2	6	330516	330521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954093
7010	NC_016831	TTC	2	6	330522	330527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954093
7011	NC_016831	GCG	2	6	330529	330534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954093
7012	NC_016831	TGA	2	6	330569	330574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954093
7013	NC_016831	GGAAGG	2	12	330592	330603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378954093
7014	NC_016831	CTC	2	6	330617	330622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378954093
7015	NC_016831	CCG	2	6	330631	330636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954093
7016	NC_016831	GCTTCC	2	12	330660	330671	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378954093
7017	NC_016831	CTTTT	2	10	330674	330683	0 %	80 %	0 %	20 %	378954093
7018	NC_016831	CCA	2	6	330697	330702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954093
7019	NC_016831	CATAAG	2	12	330733	330744	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378954093
7020	NC_016831	CG	3	6	330756	330761	0 %	0 %	50 %	50 %	378954093
7021	NC_016831	GCT	2	6	330814	330819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954093
7022	NC_016831	GGC	2	6	330905	330910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954093
7023	NC_016831	CAT	2	6	330962	330967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954093
7024	NC_016831	AGCG	2	8	330979	330986	25 %	0 %	50 %	25 %	378954093
7025	NC_016831	CCG	2	6	330987	330992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954093
7026	NC_016831	CGGT	2	8	331017	331024	0 %	25 %	50 %	25 %	378954093
7027	NC_016831	CAT	2	6	331058	331063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954093
7028	NC_016831	CGC	2	6	331127	331132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954093
7029	NC_016831	CAG	2	6	331133	331138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954093
7030	NC_016831	T	6	6	331163	331168	0 %	100 %	0 %	0 %	378954093
7031	NC_016831	ATC	2	6	331241	331246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954093
7032	NC_016831	A	6	6	331308	331313	100 %	0 %	0 %	0 %	378954093
7033	NC_016831	AGC	2	6	331317	331322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954093
7034	NC_016831	GCG	2	6	331323	331328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954093
7035	NC_016831	TAT	2	6	331336	331341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954093
7036	NC_016831	CGT	2	6	331342	331347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954093
7037	NC_016831	TGA	2	6	331474	331479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954093
7038	NC_016831	CAG	2	6	331487	331492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954093
7039	NC_016831	CGT	2	6	331493	331498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954093
7040	NC_016831	T	6	6	331505	331510	0 %	100 %	0 %	0 %	378954093
7041	NC_016831	ATC	2	6	331511	331516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954093
7042	NC_016831	ACG	2	6	331575	331580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954093
7043	NC_016831	AAC	2	6	331773	331778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954093
7044	NC_016831	CTG	2	6	331835	331840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954093
7045	NC_016831	T	6	6	331865	331870	0 %	100 %	0 %	0 %	378954093
7046	NC_016831	GCT	2	6	331992	331997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954093
7047	NC_016831	CAG	3	9	332000	332008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954093
7048	NC_016831	TAAT	2	8	332031	332038	50 %	50 %	0 %	0 %	378954093
7049	NC_016831	T	6	6	332045	332050	0 %	100 %	0 %	0 %	378954093
7050	NC_016831	TGC	2	6	332103	332108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954094
7051	NC_016831	TCG	2	6	332231	332236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_016831	C	6	6	332269	332274	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7053	NC_016831	AGA	2	6	332293	332298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_016831	GA	3	6	332300	332305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_016831	ATG	2	6	332309	332314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954095
7056	NC_016831	ACT	2	6	332362	332367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954095
7057	NC_016831	GC	3	6	332369	332374	0 %	0 %	50 %	50 %	378954095
7058	NC_016831	AT	3	6	332403	332408	50 %	50 %	0 %	0 %	378954095
7059	NC_016831	CGG	2	6	332517	332522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954095
7060	NC_016831	GCG	2	6	332631	332636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954095
7061	NC_016831	CGG	2	6	332667	332672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954095
7062	NC_016831	ATG	2	6	332711	332716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954095
7063	NC_016831	TCT	2	6	332729	332734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954095
7064	NC_016831	CCA	2	6	332761	332766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954095
7065	NC_016831	CTG	2	6	332795	332800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954095
7066	NC_016831	CTGGCG	2	12	332846	332857	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378954095
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7069	NC_016831	CT	3	6	333065	333070	0 %	50 %	0 %	50 %	378954095
7070	NC_016831	TCA	2	6	333154	333159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954095
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7072	NC_016831	ACC	2	6	333198	333203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954095
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7074	NC_016831	GCG	2	6	333230	333235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954095
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7080	NC_016831	TCG	2	6	333597	333602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954095
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7087	NC_016831	TC	3	6	333829	333834	0 %	50 %	0 %	50 %	378954095
7088	NC_016831	CGG	2	6	333862	333867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954095
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7091	NC_016831	CGA	2	6	333997	334002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954095
7092	NC_016831	CG	3	6	334019	334024	0 %	0 %	50 %	50 %	378954095
7093	NC_016831	GAA	2	6	334052	334057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954095
7094	NC_016831	TC	3	6	334063	334068	0 %	50 %	0 %	50 %	378954095
7095	NC_016831	CTG	2	6	334121	334126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954095
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7097	NC_016831	A	6	6	334251	334256	100 %	0 %	0 %	0 %	378954095
7098	NC_016831	CCTT	2	8	334257	334264	0 %	50 %	0 %	50 %	378954095
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7109	NC_016831	TTG	2	6	334784	334789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954095
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7111	NC_016831	CGTG	2	8	334876	334883	0 %	25 %	50 %	25 %	378954095
7112	NC_016831	CTGGC	2	10	334946	334955	0 %	20 %	40 %	40 %	378954095
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7119	NC_016831	CTGG	2	8	335183	335190	0 %	25 %	50 %	25 %	378954095
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7122	NC_016831	ATG	2	6	335340	335345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954095
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7488	NC_016831	TGG	2	6	353353	353358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954109
7489	NC_016831	CAT	2	6	353371	353376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954109
7490	NC_016831	GAG	2	6	353467	353472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378954110
7491	NC_016831	GGC	3	9	353558	353566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954110
7492	NC_016831	GGT	2	6	353600	353605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954110
7493	NC_016831	CTG	2	6	353673	353678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954110
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7496	NC_016831	GCTG	2	8	353873	353880	0 %	25 %	50 %	25 %	378954110
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