MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
74001	NC_016831	ATT	2	6	3503979	3503984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74002	NC_016831	TCA	2	6	3504014	3504019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74003	NC_016831	T	6	6	3504078	3504083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74004	NC_016831	GCG	2	6	3504162	3504167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74005	NC_016831	CCAG	2	8	3504178	3504185	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74006	NC_016831	AGCCC	2	10	3504286	3504295	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
74007	NC_016831	CAGC	2	8	3504453	3504460	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74008	NC_016831	AAT	2	6	3504526	3504531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74009	NC_016831	ATC	3	9	3504538	3504546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74010	NC_016831	CGCAGG	2	12	3504551	3504562	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74011	NC_016831	CGC	2	6	3504577	3504582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378957088
74012	NC_016831	A	6	6	3504615	3504620	100 %	0 %	0 %	0 %	378957088
74013	NC_016831	TTG	2	6	3504661	3504666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378957088
74014	NC_016831	GCACG	2	10	3504677	3504686	20 %	0 %	40 %	40 %	378957088
74015	NC_016831	CAAAG	2	10	3504761	3504770	60 %	0 %	20 %	20 %	378957088
74016	NC_016831	CG	3	6	3504772	3504777	0 %	0 %	50 %	50 %	378957088
74017	NC_016831	GCG	2	6	3504808	3504813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378957088
74018	NC_016831	TGG	2	6	3504829	3504834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378957088
74019	NC_016831	CGTC	2	8	3504871	3504878	0 %	25 %	25 %	50 %	378957088
74020	NC_016831	TACC	2	8	3504912	3504919	25 %	25 %	0 %	50 %	378957088
74021	NC_016831	GAA	2	6	3505074	3505079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378957089
74022	NC_016831	CGG	2	6	3505127	3505132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378957089
74023	NC_016831	ATT	2	6	3505170	3505175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378957089
74024	NC_016831	TGGC	2	8	3505203	3505210	0 %	25 %	50 %	25 %	378957089
74025	NC_016831	GGC	2	6	3505221	3505226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378957089
74026	NC_016831	CGA	2	6	3505247	3505252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378957089
74027	NC_016831	GCG	2	6	3505270	3505275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378957089
74028	NC_016831	CTG	2	6	3505290	3505295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378957089
74029	NC_016831	GGC	2	6	3505301	3505306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378957089
74030	NC_016831	GCA	2	6	3505310	3505315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378957089
74031	NC_016831	ATTT	2	8	3505343	3505350	25 %	75 %	0 %	0 %	378957089
74032	NC_016831	GCC	2	6	3505400	3505405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74033	NC_016831	CTG	2	6	3505433	3505438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378957090
74034	NC_016831	GCG	2	6	3505444	3505449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378957090
74035	NC_016831	GGC	2	6	3505470	3505475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378957090
74036	NC_016831	GC	3	6	3505513	3505518	0 %	0 %	50 %	50 %	378957090
74037	NC_016831	GAT	2	6	3505599	3505604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378957090
74038	NC_016831	TTC	2	6	3505634	3505639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378957090
74039	NC_016831	GTG	2	6	3505655	3505660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378957090
74040	NC_016831	AGA	2	6	3505732	3505737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378957090
74041	NC_016831	CCA	2	6	3505768	3505773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378957090
74042	NC_016831	TGGT	2	8	3505791	3505798	0 %	50 %	50 %	0 %	378957090
74043	NC_016831	GAA	2	6	3505898	3505903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378957090
74044	NC_016831	TGC	2	6	3506001	3506006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378957090
74045	NC_016831	CGG	2	6	3506066	3506071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378957090
74046	NC_016831	ATC	2	6	3506118	3506123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378957090
74047	NC_016831	CGC	2	6	3506273	3506278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378957090
74048	NC_016831	TAA	2	6	3506440	3506445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378957090
74049	NC_016831	CAG	2	6	3506465	3506470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378957090
74050	NC_016831	CCACGC	2	12	3506480	3506491	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	378957090
74051	NC_016831	TTA	2	6	3506499	3506504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378957090
74052	NC_016831	TGA	2	6	3506536	3506541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378957090
74053	NC_016831	GC	3	6	3506557	3506562	0 %	0 %	50 %	50 %	378957090
74054	NC_016831	CGG	2	6	3506600	3506605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378957090
74055	NC_016831	AGC	2	6	3506693	3506698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378957090
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74057	NC_016831	CAT	2	6	3506795	3506800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378957090
74058	NC_016831	CG	3	6	3506877	3506882	0 %	0 %	50 %	50 %	378957090
74059	NC_016831	AGC	2	6	3506983	3506988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378957090
74060	NC_016831	CAT	2	6	3507053	3507058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378957090
74061	NC_016831	ACGAT	2	10	3507079	3507088	40 %	20 %	20 %	20 %	378957090
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74065	NC_016831	CGG	2	6	3507247	3507252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378957090
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74067	NC_016831	GTC	2	6	3507329	3507334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378957090
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74071	NC_016831	TCG	2	6	3507495	3507500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378957090
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74090	NC_016831	AAAG	2	8	3508146	3508153	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74091	NC_016831	TACA	2	8	3508160	3508167	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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74096	NC_016831	TGAT	2	8	3508320	3508327	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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74102	NC_016831	AATA	2	8	3508674	3508681	75 %	25 %	0 %	0 %	378957091
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74117	NC_016831	CGT	2	6	3509169	3509174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378957091
74118	NC_016831	CTG	2	6	3509223	3509228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378957091
74119	NC_016831	CG	3	6	3509241	3509246	0 %	0 %	50 %	50 %	378957091
74120	NC_016831	GC	3	6	3509338	3509343	0 %	0 %	50 %	50 %	378957092
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74154	NC_016831	ACG	2	6	3510639	3510644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378957093
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74214	NC_016831	A	6	6	3512728	3512733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74215	NC_016831	A	7	7	3512748	3512754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74216	NC_016831	C	6	6	3512780	3512785	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
74217	NC_016831	CGG	2	6	3512814	3512819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378957095
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74219	NC_016831	A	6	6	3512964	3512969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74220	NC_016831	CCG	2	6	3512972	3512977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74221	NC_016831	GA	3	6	3513002	3513007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74222	NC_016831	T	6	6	3513080	3513085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74223	NC_016831	GTG	2	6	3513112	3513117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74224	NC_016831	G	8	8	3513121	3513128	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74225	NC_016831	CCA	2	6	3513292	3513297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74226	NC_016831	ACC	2	6	3513322	3513327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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74228	NC_016831	ATA	2	6	3513448	3513453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74229	NC_016831	TAAA	2	8	3513486	3513493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74230	NC_016831	CAG	2	6	3513598	3513603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378957096
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74232	NC_016831	CTT	2	6	3513741	3513746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378957096
74233	NC_016831	CGA	2	6	3513755	3513760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378957096
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74235	NC_016831	CAAAAT	2	12	3513886	3513897	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378957096
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74354	NC_016831	CGC	2	6	3518318	3518323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378957100
74355	NC_016831	GC	3	6	3518378	3518383	0 %	0 %	50 %	50 %	378957100
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74360	NC_016831	CAT	2	6	3518826	3518831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378957100
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74363	NC_016831	TAGCG	2	10	3518929	3518938	20 %	20 %	40 %	20 %	378957100
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74386	NC_016831	GC	3	6	3519756	3519761	0 %	0 %	50 %	50 %	378957101
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74422	NC_016831	CCAG	2	8	3521429	3521436	25 %	0 %	25 %	50 %	378957103
74423	NC_016831	TCC	2	6	3521455	3521460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378957103
74424	NC_016831	CGC	2	6	3521495	3521500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378957103
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74426	NC_016831	TCC	2	6	3521563	3521568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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74434	NC_016831	CAC	2	6	3521936	3521941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378957104
74435	NC_016831	TACA	2	8	3521969	3521976	50 %	25 %	0 %	25 %	378957104
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74439	NC_016831	GCT	2	6	3522182	3522187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378957104
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74442	NC_016831	CGC	2	6	3522368	3522373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378957104
74443	NC_016831	CCG	2	6	3522406	3522411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378957104
74444	NC_016831	CTG	2	6	3522440	3522445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378957104
74445	NC_016831	CCA	4	12	3522559	3522570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378957104
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74449	NC_016831	TGA	2	6	3522692	3522697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378957105
74450	NC_016831	TCG	2	6	3522725	3522730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378957105
74451	NC_016831	CGG	3	9	3522756	3522764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378957105
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74453	NC_016831	T	6	6	3522808	3522813	0 %	100 %	0 %	0 %	378957105
74454	NC_016831	CGA	2	6	3522837	3522842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378957105
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74456	NC_016831	CAG	2	6	3522863	3522868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378957105
74457	NC_016831	TCG	2	6	3522911	3522916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378957105
74458	NC_016831	GCC	2	6	3522980	3522985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378957105
74459	NC_016831	ACC	2	6	3523019	3523024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378957105
74460	NC_016831	CGT	2	6	3523038	3523043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378957105
74461	NC_016831	CG	3	6	3523052	3523057	0 %	0 %	50 %	50 %	378957105
74462	NC_016831	CTG	2	6	3523075	3523080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378957105
74463	NC_016831	CG	3	6	3523161	3523166	0 %	0 %	50 %	50 %	378957105
74464	NC_016831	ATTC	2	8	3523233	3523240	25 %	50 %	0 %	25 %	378957105
74465	NC_016831	GC	3	6	3523347	3523352	0 %	0 %	50 %	50 %	378957105
74466	NC_016831	CCA	2	6	3523413	3523418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378957105
74467	NC_016831	GCA	2	6	3523431	3523436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378957105
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74469	NC_016831	GCCA	4	16	3523517	3523532	25 %	0 %	25 %	50 %	378957105
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