MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
71001	NC_016831	GAT	2	6	3361779	3361784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956961
71002	NC_016831	ATC	2	6	3361788	3361793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956961
71003	NC_016831	GGC	2	6	3361844	3361849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956961
71004	NC_016831	CAT	2	6	3361859	3361864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956961
71005	NC_016831	GTA	2	6	3361875	3361880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956961
71006	NC_016831	TGC	2	6	3361906	3361911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956961
71007	NC_016831	GATGT	2	10	3361945	3361954	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
71008	NC_016831	TGC	3	9	3361972	3361980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71009	NC_016831	T	6	6	3361988	3361993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71010	NC_016831	ACG	2	6	3361995	3362000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71011	NC_016831	CAT	2	6	3362005	3362010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956962
71012	NC_016831	CTT	2	6	3362079	3362084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378956962
71013	NC_016831	GCCA	2	8	3362137	3362144	25 %	0 %	25 %	50 %	378956962
71014	NC_016831	CGC	2	6	3362162	3362167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956962
71015	NC_016831	CGT	2	6	3362179	3362184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956962
71016	NC_016831	TAT	2	6	3362278	3362283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378956962
71017	NC_016831	CAA	2	6	3362287	3362292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378956962
71018	NC_016831	TCG	2	6	3362322	3362327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956962
71019	NC_016831	CGT	2	6	3362467	3362472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956962
71020	NC_016831	ATC	2	6	3362522	3362527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956962
71021	NC_016831	CGG	2	6	3362611	3362616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956962
71022	NC_016831	CT	3	6	3362660	3362665	0 %	50 %	0 %	50 %	378956962
71023	NC_016831	CGC	2	6	3362808	3362813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956962
71024	NC_016831	GCA	2	6	3362821	3362826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956962
71025	NC_016831	CGC	2	6	3362887	3362892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956962
71026	NC_016831	TGATT	2	10	3362914	3362923	20 %	60 %	20 %	0 %	378956962
71027	NC_016831	AAT	2	6	3362933	3362938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378956962
71028	NC_016831	GAT	2	6	3363023	3363028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956962
71029	NC_016831	AGC	2	6	3363030	3363035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956962
71030	NC_016831	ACG	2	6	3363081	3363086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71031	NC_016831	CGT	2	6	3363100	3363105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71032	NC_016831	CGA	2	6	3363107	3363112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71033	NC_016831	CAG	2	6	3363167	3363172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956963
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71035	NC_016831	C	7	7	3363241	3363247	0 %	0 %	0 %	100 %	378956963
71036	NC_016831	GCC	2	6	3363260	3363265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956963
71037	NC_016831	GCA	2	6	3363331	3363336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956963
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71039	NC_016831	TAC	2	6	3363406	3363411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956963
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71042	NC_016831	TG	3	6	3363496	3363501	0 %	50 %	50 %	0 %	378956963
71043	NC_016831	TCG	2	6	3363633	3363638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956963
71044	NC_016831	AT	3	6	3363662	3363667	50 %	50 %	0 %	0 %	378956963
71045	NC_016831	GCA	2	6	3363691	3363696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956963
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71050	NC_016831	CCG	2	6	3364028	3364033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956964
71051	NC_016831	TCA	2	6	3364073	3364078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956964
71052	NC_016831	GCC	2	6	3364099	3364104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956964
71053	NC_016831	CAG	3	9	3364131	3364139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956964
71054	NC_016831	CCA	2	6	3364175	3364180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956964
71055	NC_016831	CCA	2	6	3364259	3364264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956964
71056	NC_016831	CGC	2	6	3364265	3364270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956964
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71058	NC_016831	CGGCG	2	10	3364311	3364320	0 %	0 %	60 %	40 %	378956964
71059	NC_016831	GCA	3	9	3364325	3364333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956964
71060	NC_016831	CCA	2	6	3364337	3364342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956964
71061	NC_016831	GTA	2	6	3364343	3364348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956964
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71065	NC_016831	CGC	2	6	3364488	3364493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956964
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71071	NC_016831	TCAGCG	2	12	3364625	3364636	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378956964
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71082	NC_016831	GCA	3	9	3365030	3365038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956964
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71084	NC_016831	GCCA	2	8	3365065	3365072	25 %	0 %	25 %	50 %	378956964
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71087	NC_016831	ATG	2	6	3365098	3365103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956964
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71091	NC_016831	CAG	2	6	3365301	3365306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956965
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