MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
68001	NC_016831	GCG	3	9	3220529	3220537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956825
68002	NC_016831	TGC	2	6	3220568	3220573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956825
68003	NC_016831	GAT	2	6	3220656	3220661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68004	NC_016831	GGT	2	6	3220701	3220706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378956826
68005	NC_016831	GTT	2	6	3220721	3220726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378956826
68006	NC_016831	TAAAGA	2	12	3220739	3220750	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	378956826
68007	NC_016831	CGC	2	6	3220771	3220776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956826
68008	NC_016831	CAG	2	6	3220800	3220805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956826
68009	NC_016831	GAA	2	6	3220848	3220853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378956826
68010	NC_016831	GC	3	6	3220977	3220982	0 %	0 %	50 %	50 %	378956826
68011	NC_016831	TC	3	6	3221053	3221058	0 %	50 %	0 %	50 %	378956826
68012	NC_016831	GCC	2	6	3221106	3221111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956826
68013	NC_016831	ACC	2	6	3221238	3221243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956826
68014	NC_016831	GCG	2	6	3221281	3221286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956826
68015	NC_016831	TGA	2	6	3221380	3221385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956826
68016	NC_016831	GCC	2	6	3221397	3221402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956826
68017	NC_016831	CAT	2	6	3221490	3221495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956826
68018	NC_016831	CGG	2	6	3221506	3221511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956826
68019	NC_016831	TGATC	2	10	3221597	3221606	20 %	40 %	20 %	20 %	378956826
68020	NC_016831	GCTG	2	8	3221764	3221771	0 %	25 %	50 %	25 %	378956826
68021	NC_016831	CGA	2	6	3221803	3221808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956826
68022	NC_016831	GGT	2	6	3221813	3221818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378956826
68023	NC_016831	GAG	2	6	3221850	3221855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378956826
68024	NC_016831	CGA	2	6	3221865	3221870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956826
68025	NC_016831	CGC	2	6	3222004	3222009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68026	NC_016831	ATC	2	6	3222024	3222029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956827
68027	NC_016831	AGA	2	6	3222030	3222035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378956827
68028	NC_016831	AAC	2	6	3222037	3222042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378956827
68029	NC_016831	GCC	2	6	3222053	3222058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956827
68030	NC_016831	CCA	2	6	3222138	3222143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956827
68031	NC_016831	CAT	3	9	3222235	3222243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956827
68032	NC_016831	GGC	2	6	3222274	3222279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956827
68033	NC_016831	ATC	2	6	3222397	3222402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956827
68034	NC_016831	GC	4	8	3222411	3222418	0 %	0 %	50 %	50 %	378956827
68035	NC_016831	CGG	2	6	3222441	3222446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956827
68036	NC_016831	ACC	2	6	3222467	3222472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956827
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68038	NC_016831	CAG	2	6	3222559	3222564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956827
68039	NC_016831	GCGG	2	8	3222612	3222619	0 %	0 %	75 %	25 %	378956827
68040	NC_016831	CCG	2	6	3222649	3222654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956827
68041	NC_016831	CAC	2	6	3222664	3222669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956827
68042	NC_016831	CAC	2	6	3222697	3222702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956827
68043	NC_016831	CAG	2	6	3222736	3222741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956827
68044	NC_016831	AAT	2	6	3222751	3222756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378956827
68045	NC_016831	CAG	2	6	3222826	3222831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956827
68046	NC_016831	TCA	2	6	3222846	3222851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956827
68047	NC_016831	AT	3	6	3222905	3222910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68048	NC_016831	A	6	6	3222924	3222929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68049	NC_016831	ATT	2	6	3222936	3222941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68050	NC_016831	ATT	2	6	3222956	3222961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378956828
68051	NC_016831	AAT	2	6	3222971	3222976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378956828
68052	NC_016831	CGC	2	6	3222989	3222994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956828
68053	NC_016831	GC	4	8	3222993	3223000	0 %	0 %	50 %	50 %	378956828
68054	NC_016831	AGC	2	6	3223056	3223061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956828
68055	NC_016831	CGCC	2	8	3223104	3223111	0 %	0 %	25 %	75 %	378956828
68056	NC_016831	CAT	2	6	3223168	3223173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956828
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68058	NC_016831	CCTG	2	8	3223312	3223319	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68059	NC_016831	TAT	2	6	3223361	3223366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68060	NC_016831	TAAA	2	8	3223379	3223386	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68061	NC_016831	CGA	2	6	3223540	3223545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956829
68062	NC_016831	CTGG	2	8	3223655	3223662	0 %	25 %	50 %	25 %	378956829
68063	NC_016831	TATCGC	2	12	3223667	3223678	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378956829
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68065	NC_016831	TGGC	2	8	3223789	3223796	0 %	25 %	50 %	25 %	378956829
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68072	NC_016831	CG	3	6	3224124	3224129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68073	NC_016831	CCA	2	6	3224138	3224143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68074	NC_016831	TGC	2	6	3224184	3224189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68075	NC_016831	TGT	2	6	3224205	3224210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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68077	NC_016831	ATG	2	6	3224249	3224254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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68083	NC_016831	CAT	2	6	3224439	3224444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956830
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68085	NC_016831	CGC	2	6	3224483	3224488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956830
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68089	NC_016831	CGC	2	6	3224606	3224611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956830
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68101	NC_016831	GCC	2	6	3225103	3225108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956830
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68103	NC_016831	TTGG	2	8	3225204	3225211	0 %	50 %	50 %	0 %	378956830
68104	NC_016831	T	6	6	3225222	3225227	0 %	100 %	0 %	0 %	378956830
68105	NC_016831	GTC	2	6	3225228	3225233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956830
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68107	NC_016831	AGC	3	9	3225422	3225430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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68116	NC_016831	GGC	2	6	3225859	3225864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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68118	NC_016831	GAA	2	6	3225938	3225943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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68471	NC_016831	GCC	2	6	3241924	3241929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956844
68472	NC_016831	AAGTG	2	10	3241949	3241958	40 %	20 %	40 %	0 %	378956844
68473	NC_016831	GCG	2	6	3241970	3241975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956844
68474	NC_016831	A	6	6	3241984	3241989	100 %	0 %	0 %	0 %	378956844
68475	NC_016831	GCA	2	6	3242013	3242018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956844
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68479	NC_016831	AC	3	6	3242243	3242248	50 %	0 %	0 %	50 %	378956844
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68481	NC_016831	CGC	2	6	3242551	3242556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68482	NC_016831	GCA	2	6	3242719	3242724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68483	NC_016831	A	6	6	3242726	3242731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68484	NC_016831	CATGT	2	10	3242732	3242741	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68485	NC_016831	GC	4	8	3242793	3242800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68486	NC_016831	GCCT	2	8	3242837	3242844	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68487	NC_016831	CTG	3	9	3242855	3242863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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68491	NC_016831	CG	3	6	3243252	3243257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68492	NC_016831	GC	3	6	3243258	3243263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68493	NC_016831	CGG	2	6	3243432	3243437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68494	NC_016831	TG	3	6	3243573	3243578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68495	NC_016831	TTG	2	6	3243636	3243641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68496	NC_016831	T	10	10	3243712	3243721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68497	NC_016831	ATG	2	6	3243734	3243739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956845
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