MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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65502	NC_016831	GCC	2	6	3099687	3099692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956703
65503	NC_016831	GT	3	6	3099696	3099701	0 %	50 %	50 %	0 %	378956703
65504	NC_016831	ATG	2	6	3099758	3099763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956703
65505	NC_016831	CGA	2	6	3099814	3099819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956703
65506	NC_016831	AT	3	6	3099852	3099857	50 %	50 %	0 %	0 %	378956703
65507	NC_016831	CGA	2	6	3099924	3099929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956703
65508	NC_016831	TAT	2	6	3100037	3100042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378956703
65509	NC_016831	CGC	2	6	3100108	3100113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956703
65510	NC_016831	ATT	2	6	3100145	3100150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378956703
65511	NC_016831	AAC	2	6	3100168	3100173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378956703
65512	NC_016831	CAA	2	6	3100195	3100200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378956703
65513	NC_016831	TTAAAT	2	12	3100209	3100220	50 %	50 %	0 %	0 %	378956703
65514	NC_016831	ATT	2	6	3100246	3100251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65515	NC_016831	AAT	2	6	3100337	3100342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65516	NC_016831	CTG	3	9	3100430	3100438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956704
65517	NC_016831	GCA	2	6	3100519	3100524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956704
65518	NC_016831	AAG	2	6	3100662	3100667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378956704
65519	NC_016831	CGGCAT	2	12	3100700	3100711	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378956704
65520	NC_016831	CGT	2	6	3100712	3100717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956704
65521	NC_016831	CAG	2	6	3100802	3100807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956704
65522	NC_016831	ACG	2	6	3100814	3100819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956704
65523	NC_016831	GCA	2	6	3100849	3100854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956704
65524	NC_016831	TCG	2	6	3100947	3100952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956704
65525	NC_016831	GC	3	6	3101037	3101042	0 %	0 %	50 %	50 %	378956704
65526	NC_016831	AGCG	2	8	3101124	3101131	25 %	0 %	50 %	25 %	378956704
65527	NC_016831	GC	4	8	3101182	3101189	0 %	0 %	50 %	50 %	378956704
65528	NC_016831	CAG	2	6	3101200	3101205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956704
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65531	NC_016831	CG	3	6	3101499	3101504	0 %	0 %	50 %	50 %	378956704
65532	NC_016831	CCA	2	6	3101611	3101616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956704
65533	NC_016831	GCA	2	6	3101620	3101625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956704
65534	NC_016831	CGC	2	6	3101633	3101638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956704
65535	NC_016831	CGC	2	6	3101659	3101664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956704
65536	NC_016831	GGA	2	6	3101666	3101671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378956704
65537	NC_016831	CGCA	2	8	3101705	3101712	25 %	0 %	25 %	50 %	378956704
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65541	NC_016831	CG	3	6	3102136	3102141	0 %	0 %	50 %	50 %	378956704
65542	NC_016831	CGT	2	6	3102223	3102228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956704
65543	NC_016831	AGT	2	6	3102229	3102234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956704
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65545	NC_016831	GCA	2	6	3102265	3102270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956704
65546	NC_016831	CCT	2	6	3102301	3102306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65547	NC_016831	GTA	2	6	3102316	3102321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65548	NC_016831	CTG	2	6	3102334	3102339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65549	NC_016831	GTC	2	6	3102362	3102367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65550	NC_016831	TTA	2	6	3102389	3102394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378956705
65551	NC_016831	ACT	2	6	3102413	3102418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956705
65552	NC_016831	AAC	2	6	3102440	3102445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378956705
65553	NC_016831	CAG	2	6	3102466	3102471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956705
65554	NC_016831	GC	3	6	3102701	3102706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65555	NC_016831	CAG	2	6	3102728	3102733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65556	NC_016831	GCC	2	6	3102769	3102774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65557	NC_016831	GAA	2	6	3102833	3102838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65558	NC_016831	CGT	2	6	3102841	3102846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65559	NC_016831	CG	3	6	3102863	3102868	0 %	0 %	50 %	50 %	378956706
65560	NC_016831	A	7	7	3102893	3102899	100 %	0 %	0 %	0 %	378956706
65561	NC_016831	A	7	7	3102979	3102985	100 %	0 %	0 %	0 %	378956706
65562	NC_016831	GAA	2	6	3103000	3103005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378956706
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65565	NC_016831	CTAA	2	8	3103132	3103139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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65570	NC_016831	GCA	2	6	3103726	3103731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956707
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65593	NC_016831	TTCAGT	2	12	3104512	3104523	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65594	NC_016831	CAT	2	6	3104524	3104529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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65597	NC_016831	TAT	2	6	3104667	3104672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65598	NC_016831	AAT	2	6	3104687	3104692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65599	NC_016831	TAG	2	6	3104705	3104710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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65602	NC_016831	T	6	6	3104855	3104860	0 %	100 %	0 %	0 %	378956708
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65615	NC_016831	GCG	2	6	3105309	3105314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956708
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65968	NC_016831	TTTACC	2	12	3123449	3123460	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378956732
65969	NC_016831	TCT	2	6	3123570	3123575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378956732
65970	NC_016831	ATG	2	6	3123578	3123583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956732
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65975	NC_016831	CTG	2	6	3123854	3123859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956732
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65980	NC_016831	TGA	3	9	3123975	3123983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956732
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65984	NC_016831	TA	3	6	3124298	3124303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65985	NC_016831	A	6	6	3124360	3124365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65986	NC_016831	GCGCC	2	10	3124373	3124382	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
65987	NC_016831	CAC	2	6	3124401	3124406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65988	NC_016831	CGG	2	6	3124419	3124424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65989	NC_016831	GCA	2	6	3124444	3124449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65990	NC_016831	CGCC	3	12	3124453	3124464	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65991	NC_016831	CGC	2	6	3124490	3124495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65992	NC_016831	CTTT	2	8	3124546	3124553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65993	NC_016831	GCG	2	6	3124691	3124696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65994	NC_016831	CGG	2	6	3124766	3124771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65995	NC_016831	GCCAT	2	10	3124965	3124974	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65996	NC_016831	GAA	2	6	3124995	3125000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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65998	NC_016831	TGCC	2	8	3125034	3125041	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65999	NC_016831	ACC	2	6	3125056	3125061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66000	NC_016831	GGC	2	6	3125143	3125148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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