MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus infantarius subsp. infantarius CJ18 chromosome

Total Repeats: 43343

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_016826	GCAT	2	8	852891	852898	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18502	NC_016826	GAT	2	6	852971	852976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18503	NC_016826	GAT	2	6	853033	853038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18504	NC_016826	GGC	2	6	853201	853206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18505	NC_016826	AGC	2	6	853215	853220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18506	NC_016826	AGC	2	6	853239	853244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18507	NC_016826	TGG	2	6	853266	853271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18508	NC_016826	TC	3	6	853336	853341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18509	NC_016826	TAC	2	6	853405	853410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18510	NC_016826	AC	3	6	853496	853501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18511	NC_016826	TTG	2	6	853502	853507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18512	NC_016826	AAG	2	6	853514	853519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18513	NC_016826	TGG	2	6	853545	853550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18514	NC_016826	TCA	2	6	853640	853645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18515	NC_016826	CTT	2	6	853660	853665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18516	NC_016826	TAA	2	6	853666	853671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18517	NC_016826	TTAT	2	8	853755	853762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18518	NC_016826	GTT	2	6	853960	853965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18519	NC_016826	ATT	2	6	854014	854019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379705183
18520	NC_016826	ATG	2	6	854037	854042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379705183
18521	NC_016826	TCA	2	6	854089	854094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379705183
18522	NC_016826	AGT	2	6	854167	854172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379705183
18523	NC_016826	TA	3	6	854205	854210	50 %	50 %	0 %	0 %	379705183
18524	NC_016826	A	6	6	854246	854251	100 %	0 %	0 %	0 %	379705183
18525	NC_016826	CAG	2	6	854286	854291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379705183
18526	NC_016826	AGA	2	6	854353	854358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379705183
18527	NC_016826	TGA	2	6	854377	854382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379705183
18528	NC_016826	GCT	2	6	854402	854407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379705183
18529	NC_016826	ATT	2	6	854423	854428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379705183
18530	NC_016826	GAA	2	6	854504	854509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379705183
18531	NC_016826	ATA	2	6	854587	854592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379705183
18532	NC_016826	ATGA	2	8	854598	854605	50 %	25 %	25 %	0 %	379705184
18533	NC_016826	TG	3	6	854752	854757	0 %	50 %	50 %	0 %	379705184
18534	NC_016826	GTT	2	6	854814	854819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379705184
18535	NC_016826	ATCA	2	8	854852	854859	50 %	25 %	0 %	25 %	379705184
18536	NC_016826	TGATTT	2	12	854920	854931	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379705184
18537	NC_016826	TTC	2	6	854958	854963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379705184
18538	NC_016826	TGG	2	6	855164	855169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379705184
18539	NC_016826	AGT	2	6	855209	855214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379705184
18540	NC_016826	ATCA	2	8	855281	855288	50 %	25 %	0 %	25 %	379705184
18541	NC_016826	ATG	2	6	855291	855296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379705184
18542	NC_016826	TTC	2	6	855421	855426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379705184
18543	NC_016826	TTGGT	2	10	855475	855484	0 %	60 %	40 %	0 %	379705184
18544	NC_016826	CGT	2	6	855507	855512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379705184
18545	NC_016826	CTT	2	6	855552	855557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379705184
18546	NC_016826	TGG	2	6	855602	855607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379705184
18547	NC_016826	TCAA	2	8	855658	855665	50 %	25 %	0 %	25 %	379705184
18548	NC_016826	TCA	2	6	855694	855699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379705184
18549	NC_016826	TGC	2	6	855701	855706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379705184
18550	NC_016826	TGC	2	6	855803	855808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379705184
18551	NC_016826	ATT	2	6	855809	855814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379705184
18552	NC_016826	TGT	2	6	855818	855823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379705184
18553	NC_016826	A	7	7	855851	855857	100 %	0 %	0 %	0 %	379705184
18554	NC_016826	ATAA	2	8	855871	855878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18555	NC_016826	TGTTT	2	10	855904	855913	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18556	NC_016826	TGA	2	6	855976	855981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379705185
18557	NC_016826	T	6	6	856132	856137	0 %	100 %	0 %	0 %	379705185
18558	NC_016826	GAC	2	6	856202	856207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379705185
18559	NC_016826	GATT	2	8	856209	856216	25 %	50 %	25 %	0 %	379705185
18560	NC_016826	CCA	2	6	856329	856334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379705185
18561	NC_016826	AAT	2	6	856372	856377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379705185
18562	NC_016826	T	6	6	856516	856521	0 %	100 %	0 %	0 %	379705185
18563	NC_016826	CGT	2	6	856540	856545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379705185
18564	NC_016826	AAAT	2	8	856643	856650	75 %	25 %	0 %	0 %	379705185
18565	NC_016826	TGA	2	6	856690	856695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379705185
18566	NC_016826	GAC	2	6	856753	856758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379705185
18567	NC_016826	TAG	2	6	856810	856815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379705185
18568	NC_016826	CAT	2	6	856820	856825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379705185
18569	NC_016826	TCC	2	6	856855	856860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18570	NC_016826	A	6	6	856898	856903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18571	NC_016826	A	6	6	856921	856926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18572	NC_016826	GTA	2	6	856996	857001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379705186
18573	NC_016826	TGA	2	6	857022	857027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379705186
18574	NC_016826	CTT	2	6	857040	857045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379705186
18575	NC_016826	AAC	2	6	857068	857073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379705186
18576	NC_016826	CAAA	2	8	857124	857131	75 %	0 %	0 %	25 %	379705186
18577	NC_016826	GTT	2	6	857320	857325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379705187
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18579	NC_016826	T	6	6	857352	857357	0 %	100 %	0 %	0 %	379705187
18580	NC_016826	TTC	2	6	857383	857388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379705187
18581	NC_016826	ATA	2	6	857401	857406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379705187
18582	NC_016826	T	6	6	857409	857414	0 %	100 %	0 %	0 %	379705187
18583	NC_016826	AGT	2	6	857436	857441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379705187
18584	NC_016826	CTT	2	6	857457	857462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379705187
18585	NC_016826	A	6	6	857512	857517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18586	NC_016826	T	7	7	857588	857594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18587	NC_016826	TAA	2	6	857631	857636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18588	NC_016826	TCA	2	6	857641	857646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18589	NC_016826	AAC	2	6	857688	857693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18590	NC_016826	T	7	7	857811	857817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18591	NC_016826	TGG	2	6	857837	857842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18592	NC_016826	TAGAA	2	10	857908	857917	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18593	NC_016826	TAG	2	6	857924	857929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18594	NC_016826	TAT	2	6	857960	857965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379705188
18595	NC_016826	GAA	2	6	858026	858031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379705188
18596	NC_016826	GTT	2	6	858089	858094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379705188
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18598	NC_016826	TGA	2	6	858199	858204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379705188
18599	NC_016826	GTT	2	6	858248	858253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379705188
18600	NC_016826	GAT	2	6	858254	858259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379705188
18601	NC_016826	A	6	6	858289	858294	100 %	0 %	0 %	0 %	379705188
18602	NC_016826	TTA	2	6	858338	858343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379705188
18603	NC_016826	TGA	2	6	858355	858360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379705188
18604	NC_016826	A	6	6	858389	858394	100 %	0 %	0 %	0 %	379705188
18605	NC_016826	TCAAAT	2	12	858445	858456	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379705188
18606	NC_016826	ATT	2	6	858495	858500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379705188
18607	NC_016826	AG	3	6	858547	858552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18608	NC_016826	GAA	2	6	858610	858615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379705189
18609	NC_016826	GAA	2	6	858682	858687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379705189
18610	NC_016826	ACAA	2	8	858725	858732	75 %	0 %	0 %	25 %	379705189
18611	NC_016826	TTC	2	6	858734	858739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379705189
18612	NC_016826	GAA	2	6	858757	858762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379705189
18613	NC_016826	TGG	2	6	858777	858782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379705189
18614	NC_016826	GAA	2	6	858796	858801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379705189
18615	NC_016826	AGC	2	6	858831	858836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379705189
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18617	NC_016826	GAA	2	6	858850	858855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379705189
18618	NC_016826	TTC	2	6	858866	858871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379705189
18619	NC_016826	GAT	2	6	858892	858897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379705189
18620	NC_016826	CAT	2	6	858903	858908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379705189
18621	NC_016826	TGG	2	6	858930	858935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379705189
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18623	NC_016826	AGC	2	6	858942	858947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379705189
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