MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei 53G plasmid C

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016824	AGA	2	6	6	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181731
2	NC_016824	CTG	3	9	98	106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181731
3	NC_016824	CCT	2	6	134	139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383181731
4	NC_016824	TGGT	2	8	159	166	0 %	50 %	50 %	0 %	383181731
5	NC_016824	CAT	2	6	171	176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181731
6	NC_016824	GAA	2	6	254	259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181731
7	NC_016824	GTT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181731
8	NC_016824	AATG	2	8	393	400	50 %	25 %	25 %	0 %	383181731
9	NC_016824	CTG	2	6	514	519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181731
10	NC_016824	CTT	2	6	530	535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181731
11	NC_016824	GAA	2	6	546	551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181731
12	NC_016824	TTGC	2	8	591	598	0 %	50 %	25 %	25 %	383181731
13	NC_016824	A	6	6	810	815	100 %	0 %	0 %	0 %	383181731
14	NC_016824	TCC	2	6	818	823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383181731
15	NC_016824	CGA	2	6	861	866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181731
16	NC_016824	TGA	2	6	882	887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181731
17	NC_016824	AATATT	2	12	973	984	50 %	50 %	0 %	0 %	383181732
18	NC_016824	T	8	8	1018	1025	0 %	100 %	0 %	0 %	383181732
19	NC_016824	AAG	2	6	1026	1031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181732
20	NC_016824	AATT	2	8	1133	1140	50 %	50 %	0 %	0 %	383181732
21	NC_016824	TA	3	6	1142	1147	50 %	50 %	0 %	0 %	383181732
22	NC_016824	AAAC	2	8	1154	1161	75 %	0 %	0 %	25 %	383181732
23	NC_016824	TGCA	2	8	1282	1289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016824	CT	3	6	1443	1448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016824	T	6	6	1519	1524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016824	ATG	2	6	1541	1546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016824	GAC	2	6	1618	1623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016824	ACC	2	6	1624	1629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_016824	A	6	6	1634	1639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016824	GTTTT	2	10	1693	1702	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016824	GT	3	6	1725	1730	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016824	G	6	6	1770	1775	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016824	T	6	6	1791	1796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016824	CG	3	6	1807	1812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016824	TGA	2	6	2039	2044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.