MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 101059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
95001	NC_016822	GATCGG	2	12	4690536	4690547	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383181408
95002	NC_016822	CAGCG	2	10	4690561	4690570	20 %	0 %	40 %	40 %	383181408
95003	NC_016822	CTG	2	6	4690617	4690622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181408
95004	NC_016822	CGC	2	6	4690703	4690708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181408
95005	NC_016822	GGC	2	6	4690718	4690723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181408
95006	NC_016822	GCG	2	6	4690730	4690735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181408
95007	NC_016822	GCC	2	6	4690794	4690799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181408
95008	NC_016822	CGT	2	6	4690896	4690901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181409
95009	NC_016822	CTT	3	9	4690953	4690961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181409
95010	NC_016822	CG	3	6	4690998	4691003	0 %	0 %	50 %	50 %	383181409
95011	NC_016822	ATG	2	6	4691050	4691055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181409
95012	NC_016822	CAG	2	6	4691104	4691109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181409
95013	NC_016822	GAT	2	6	4691115	4691120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181409
95014	NC_016822	GTG	2	6	4691170	4691175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181409
95015	NC_016822	TGA	2	6	4691280	4691285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181410
95016	NC_016822	CAG	2	6	4691294	4691299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181410
95017	NC_016822	CGAC	2	8	4691305	4691312	25 %	0 %	25 %	50 %	383181410
95018	NC_016822	TTG	2	6	4691331	4691336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181410
95019	NC_016822	GCGG	2	8	4691363	4691370	0 %	0 %	75 %	25 %	383181410
95020	NC_016822	CG	3	6	4691371	4691376	0 %	0 %	50 %	50 %	383181410
95021	NC_016822	GGCG	2	8	4691380	4691387	0 %	0 %	75 %	25 %	383181410
95022	NC_016822	GGA	2	6	4691434	4691439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383181410
95023	NC_016822	GCA	2	6	4691467	4691472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181410
95024	NC_016822	GC	3	6	4691486	4691491	0 %	0 %	50 %	50 %	383181410
95025	NC_016822	CGACGC	2	12	4691566	4691577	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383181410
95026	NC_016822	ATA	2	6	4691579	4691584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181410
95027	NC_016822	CG	3	6	4691627	4691632	0 %	0 %	50 %	50 %	383181410
95028	NC_016822	A	6	6	4691636	4691641	100 %	0 %	0 %	0 %	383181410
95029	NC_016822	GCTC	2	8	4691647	4691654	0 %	25 %	25 %	50 %	383181410
95030	NC_016822	CG	3	6	4691689	4691694	0 %	0 %	50 %	50 %	383181410
95031	NC_016822	CCA	2	6	4691710	4691715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181410
95032	NC_016822	CAG	2	6	4691750	4691755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181410
95033	NC_016822	CAT	2	6	4691804	4691809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181410
95034	NC_016822	CG	3	6	4691887	4691892	0 %	0 %	50 %	50 %	383181411
95035	NC_016822	GTA	2	6	4692037	4692042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181411
95036	NC_016822	AG	3	6	4692049	4692054	50 %	0 %	50 %	0 %	383181411
95037	NC_016822	CAG	2	6	4692061	4692066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181411
95038	NC_016822	GCC	2	6	4692112	4692117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181411
95039	NC_016822	GC	3	6	4692132	4692137	0 %	0 %	50 %	50 %	383181411
95040	NC_016822	CATGC	2	10	4692151	4692160	20 %	20 %	20 %	40 %	383181411
95041	NC_016822	CCG	2	6	4692174	4692179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181411
95042	NC_016822	GTG	2	6	4692188	4692193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181411
95043	NC_016822	CGTGGG	2	12	4692237	4692248	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	383181411
95044	NC_016822	TGGC	2	8	4692260	4692267	0 %	25 %	50 %	25 %	383181411
95045	NC_016822	CG	4	8	4692281	4692288	0 %	0 %	50 %	50 %	383181411
95046	NC_016822	GCG	2	6	4692296	4692301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181411
95047	NC_016822	GCG	2	6	4692332	4692337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181411
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95049	NC_016822	CTG	2	6	4692361	4692366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181411
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95051	NC_016822	GTG	2	6	4692515	4692520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181411
95052	NC_016822	CGCAG	2	10	4692534	4692543	20 %	0 %	40 %	40 %	383181411
95053	NC_016822	CGC	2	6	4692570	4692575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181411
95054	NC_016822	ATC	2	6	4692602	4692607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181411
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95058	NC_016822	CGT	2	6	4692702	4692707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181411
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95061	NC_016822	GCA	2	6	4692801	4692806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181411
95062	NC_016822	GCC	2	6	4692811	4692816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181411
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95064	NC_016822	TACG	2	8	4692986	4692993	25 %	25 %	25 %	25 %	383181412
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95069	NC_016822	AGC	2	6	4693105	4693110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181412
95070	NC_016822	CGA	2	6	4693124	4693129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181412
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95072	NC_016822	CGC	2	6	4693163	4693168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181412
95073	NC_016822	CG	3	6	4693231	4693236	0 %	0 %	50 %	50 %	383181412
95074	NC_016822	GCG	2	6	4693243	4693248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181412
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95077	NC_016822	CCA	2	6	4693367	4693372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181412
95078	NC_016822	GC	3	6	4693377	4693382	0 %	0 %	50 %	50 %	383181412
95079	NC_016822	TCG	2	6	4693438	4693443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181412
95080	NC_016822	AGCG	2	8	4693462	4693469	25 %	0 %	50 %	25 %	383181412
95081	NC_016822	CAC	2	6	4693509	4693514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181412
95082	NC_016822	CGC	2	6	4693714	4693719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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95085	NC_016822	GTC	2	6	4693784	4693789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181413
95086	NC_016822	CGGT	2	8	4693797	4693804	0 %	25 %	50 %	25 %	383181413
95087	NC_016822	CCA	2	6	4693816	4693821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181413
95088	NC_016822	TCA	2	6	4693834	4693839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181413
95089	NC_016822	CAG	2	6	4693856	4693861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181413
95090	NC_016822	CCA	3	9	4693912	4693920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181413
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95092	NC_016822	CGGT	2	8	4693972	4693979	0 %	25 %	50 %	25 %	383181413
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95096	NC_016822	GTC	2	6	4694069	4694074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181413
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95100	NC_016822	GCA	2	6	4694248	4694253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181413
95101	NC_016822	CGG	2	6	4694259	4694264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181413
95102	NC_016822	CTG	2	6	4694315	4694320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181413
95103	NC_016822	CG	3	6	4694331	4694336	0 %	0 %	50 %	50 %	383181413
95104	NC_016822	CAG	2	6	4694348	4694353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181413
95105	NC_016822	GGC	2	6	4694514	4694519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181414
95106	NC_016822	AAT	2	6	4694520	4694525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181414
95107	NC_016822	CAC	2	6	4694569	4694574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181414
95108	NC_016822	TCA	2	6	4694576	4694581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181414
95109	NC_016822	CTG	2	6	4694626	4694631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181414
95110	NC_016822	TCG	2	6	4694648	4694653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181414
95111	NC_016822	CGG	2	6	4694680	4694685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181414
95112	NC_016822	GGGC	2	8	4694730	4694737	0 %	0 %	75 %	25 %	383181414
95113	NC_016822	TTCACC	2	12	4694801	4694812	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	383181414
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95115	NC_016822	CTC	2	6	4694887	4694892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383181414
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95212	NC_016822	GAC	2	6	4698866	4698871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181419
95213	NC_016822	TGGG	2	8	4698922	4698929	0 %	25 %	75 %	0 %	383181419
95214	NC_016822	GATGGT	2	12	4698932	4698943	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383181419
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95218	NC_016822	GCCCA	2	10	4699283	4699292	20 %	0 %	20 %	60 %	383181420
95219	NC_016822	AAG	2	6	4699340	4699345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181420
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95221	NC_016822	GA	3	6	4699373	4699378	50 %	0 %	50 %	0 %	383181420
95222	NC_016822	GATCG	2	10	4699393	4699402	20 %	20 %	40 %	20 %	383181420
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95224	NC_016822	GTT	2	6	4699489	4699494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181420
95225	NC_016822	TTG	2	6	4699514	4699519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181420
95226	NC_016822	GTA	2	6	4699603	4699608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181420
95227	NC_016822	CAG	2	6	4699678	4699683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181420
95228	NC_016822	GTT	2	6	4699693	4699698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181420
95229	NC_016822	TTG	2	6	4699712	4699717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181420
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95466	NC_016822	GTA	2	6	4711085	4711090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181430
95467	NC_016822	AGC	2	6	4711136	4711141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181430
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95469	NC_016822	TCA	2	6	4711257	4711262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181430
95470	NC_016822	CGA	2	6	4711269	4711274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181430
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95493	NC_016822	ATA	2	6	4712189	4712194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181430
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95495	NC_016822	TCATA	2	10	4712303	4712312	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95496	NC_016822	ATT	2	6	4712333	4712338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95497	NC_016822	TTA	2	6	4712364	4712369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95498	NC_016822	GTTC	2	8	4712406	4712413	0 %	50 %	25 %	25 %	383181431
95499	NC_016822	GCG	2	6	4712437	4712442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181431
95500	NC_016822	ACG	2	6	4712479	4712484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181431

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