MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 101059

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92003	NC_016822	AC	3	6	4542909	4542914	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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92121	NC_016822	TC	3	6	4550226	4550231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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92124	NC_016822	TCC	2	6	4550442	4550447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92125	NC_016822	T	6	6	4550451	4550456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92126	NC_016822	CAA	2	6	4550475	4550480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92127	NC_016822	AAC	2	6	4550621	4550626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181282
92128	NC_016822	CGG	2	6	4550666	4550671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181282
92129	NC_016822	TGC	2	6	4550672	4550677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181282
92130	NC_016822	GAA	2	6	4550709	4550714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181282
92131	NC_016822	TGC	2	6	4550831	4550836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181282
92132	NC_016822	TGC	2	6	4550864	4550869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181282
92133	NC_016822	CTG	2	6	4550907	4550912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181282
92134	NC_016822	GTC	2	6	4550914	4550919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181282
92135	NC_016822	CAT	2	6	4550936	4550941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181282
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92138	NC_016822	CGA	2	6	4551041	4551046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181282
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92140	NC_016822	CTGG	2	8	4551120	4551127	0 %	25 %	50 %	25 %	383181282
92141	NC_016822	CTG	2	6	4551180	4551185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181282
92142	NC_016822	GTT	2	6	4551225	4551230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181282
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92145	NC_016822	CTG	2	6	4551339	4551344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181282
92146	NC_016822	CTG	2	6	4551378	4551383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181282
92147	NC_016822	GAA	2	6	4551399	4551404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181282
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92150	NC_016822	TAC	2	6	4551548	4551553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181282
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92152	NC_016822	GTT	2	6	4551624	4551629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181282
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92156	NC_016822	TCA	2	6	4551814	4551819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92157	NC_016822	GGTT	2	8	4551952	4551959	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92158	NC_016822	TGG	2	6	4552025	4552030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181283
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92163	NC_016822	TGC	2	6	4552116	4552121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181283
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92182	NC_016822	TTA	2	6	4553024	4553029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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92192	NC_016822	CTG	2	6	4553566	4553571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181286
92193	NC_016822	ACGT	2	8	4553654	4553661	25 %	25 %	25 %	25 %	383181286
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92205	NC_016822	CCA	3	9	4554125	4554133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181286
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92207	NC_016822	TGAG	2	8	4554289	4554296	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92208	NC_016822	GAAG	2	8	4554335	4554342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92209	NC_016822	CGC	2	6	4554347	4554352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92210	NC_016822	ATT	2	6	4554482	4554487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92211	NC_016822	CT	3	6	4554530	4554535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92212	NC_016822	GGA	2	6	4554542	4554547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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92219	NC_016822	TTG	2	6	4554825	4554830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181287
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92223	NC_016822	GCT	2	6	4555064	4555069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181287
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92226	NC_016822	GCT	4	12	4555265	4555276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181288
92227	NC_016822	GTAGCT	2	12	4555277	4555288	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383181288
92228	NC_016822	GCT	2	6	4555304	4555309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181288
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92230	NC_016822	A	6	6	4555314	4555319	100 %	0 %	0 %	0 %	383181288
92231	NC_016822	GCT	2	6	4555343	4555348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181288
92232	NC_016822	AAG	2	6	4555407	4555412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181288
92233	NC_016822	GCT	2	6	4555439	4555444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181288
92234	NC_016822	AAG	2	6	4555449	4555454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181288
92235	NC_016822	GAC	2	6	4555466	4555471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181288
92236	NC_016822	A	6	6	4555484	4555489	100 %	0 %	0 %	0 %	383181288
92237	NC_016822	GAA	2	6	4555496	4555501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181288
92238	NC_016822	TGAAGT	2	12	4555510	4555521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181288
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92240	NC_016822	CGA	2	6	4555668	4555673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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92321	NC_016822	CTG	2	6	4559896	4559901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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92325	NC_016822	GTACT	2	10	4560364	4560373	20 %	40 %	20 %	20 %	383181290
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92327	NC_016822	CTGA	2	8	4560430	4560437	25 %	25 %	25 %	25 %	383181290
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92329	NC_016822	CTG	2	6	4560619	4560624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181290
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92340	NC_016822	CTG	2	6	4560868	4560873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181290
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92345	NC_016822	GAA	2	6	4561143	4561148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181290
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92347	NC_016822	CTG	2	6	4561216	4561221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181290
92348	NC_016822	TGA	2	6	4561400	4561405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181290
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92350	NC_016822	ATC	2	6	4561447	4561452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181290
92351	NC_016822	GTT	2	6	4561468	4561473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181290
92352	NC_016822	AAG	2	6	4561544	4561549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181290
92353	NC_016822	GC	3	6	4561588	4561593	0 %	0 %	50 %	50 %	383181290
92354	NC_016822	TAG	2	6	4561640	4561645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181290
92355	NC_016822	GAT	2	6	4561692	4561697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181290
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92373	NC_016822	CTG	2	6	4562510	4562515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181290
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92471	NC_016822	TCG	2	6	4567210	4567215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181294
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92499	NC_016822	ATC	2	6	4568488	4568493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181296
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