MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 101059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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85002	NC_016822	TTCC	2	8	4202173	4202180	0 %	50 %	0 %	50 %	383180951
85003	NC_016822	GTAT	2	8	4202181	4202188	25 %	50 %	25 %	0 %	383180951
85004	NC_016822	TGA	2	6	4202196	4202201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180951
85005	NC_016822	TACT	2	8	4202228	4202235	25 %	50 %	0 %	25 %	383180951
85006	NC_016822	CCCAG	2	10	4202329	4202338	20 %	0 %	20 %	60 %	383180951
85007	NC_016822	TTG	2	6	4202343	4202348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383180951
85008	NC_016822	TGC	2	6	4202430	4202435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180951
85009	NC_016822	GAA	2	6	4202447	4202452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383180951
85010	NC_016822	ATGCG	2	10	4202463	4202472	20 %	20 %	40 %	20 %	383180951
85011	NC_016822	CG	3	6	4202533	4202538	0 %	0 %	50 %	50 %	383180951
85012	NC_016822	AAAC	2	8	4202540	4202547	75 %	0 %	0 %	25 %	383180951
85013	NC_016822	TGA	2	6	4202556	4202561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180951
85014	NC_016822	TCA	2	6	4202562	4202567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180951
85015	NC_016822	CTG	3	9	4202624	4202632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180951
85016	NC_016822	TGG	2	6	4202637	4202642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383180951
85017	NC_016822	GAGC	2	8	4202776	4202783	25 %	0 %	50 %	25 %	383180951
85018	NC_016822	TCCG	2	8	4202808	4202815	0 %	25 %	25 %	50 %	383180951
85019	NC_016822	TGGCG	2	10	4202827	4202836	0 %	20 %	60 %	20 %	383180951
85020	NC_016822	CCG	2	6	4202856	4202861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383180951
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85022	NC_016822	GCC	2	6	4202954	4202959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383180951
85023	NC_016822	AG	3	6	4202977	4202982	50 %	0 %	50 %	0 %	383180951
85024	NC_016822	ATC	2	6	4203006	4203011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180951
85025	NC_016822	ATCG	2	8	4203128	4203135	25 %	25 %	25 %	25 %	383180951
85026	NC_016822	TTGC	2	8	4203197	4203204	0 %	50 %	25 %	25 %	383180951
85027	NC_016822	TGC	2	6	4203228	4203233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180951
85028	NC_016822	CT	3	6	4203248	4203253	0 %	50 %	0 %	50 %	383180951
85029	NC_016822	TGG	2	6	4203279	4203284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383180951
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85031	NC_016822	TGC	2	6	4203376	4203381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180951
85032	NC_016822	TCC	2	6	4203390	4203395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383180951
85033	NC_016822	GAT	2	6	4203431	4203436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180951
85034	NC_016822	GCA	2	6	4203469	4203474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180951
85035	NC_016822	TGTT	2	8	4203516	4203523	0 %	75 %	25 %	0 %	383180951
85036	NC_016822	AGC	2	6	4203542	4203547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180951
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85038	NC_016822	CTGG	2	8	4203631	4203638	0 %	25 %	50 %	25 %	383180951
85039	NC_016822	AG	3	6	4203706	4203711	50 %	0 %	50 %	0 %	383180951
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85042	NC_016822	CT	3	6	4203921	4203926	0 %	50 %	0 %	50 %	383180952
85043	NC_016822	GAT	2	6	4204050	4204055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180952
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85069	NC_016822	T	6	6	4205384	4205389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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85231	NC_016822	T	6	6	4212586	4212591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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85233	NC_016822	TAAA	2	8	4212762	4212769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85234	NC_016822	GATGC	2	10	4212890	4212899	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
85235	NC_016822	CGC	2	6	4212966	4212971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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85466	NC_016822	GAAC	2	8	4224525	4224532	50 %	0 %	25 %	25 %	383180967
85467	NC_016822	TTCAC	2	10	4224596	4224605	20 %	40 %	0 %	40 %	383180967
85468	NC_016822	GCA	2	6	4224644	4224649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180967
85469	NC_016822	CAG	2	6	4224655	4224660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180967
85470	NC_016822	GAC	2	6	4224711	4224716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180967
85471	NC_016822	AGC	2	6	4224719	4224724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180967
85472	NC_016822	TGCAG	2	10	4224845	4224854	20 %	20 %	40 %	20 %	383180967
85473	NC_016822	TGG	2	6	4224936	4224941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383180967
85474	NC_016822	TGA	2	6	4224996	4225001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180967
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85477	NC_016822	CGT	2	6	4225176	4225181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180967
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85481	NC_016822	GCT	2	6	4225506	4225511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180967
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85484	NC_016822	GCA	2	6	4225712	4225717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180968
85485	NC_016822	TGT	2	6	4225733	4225738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383180968
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85487	NC_016822	GAC	2	6	4225839	4225844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180968
85488	NC_016822	CAC	2	6	4225896	4225901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383180968
85489	NC_016822	GC	3	6	4225941	4225946	0 %	0 %	50 %	50 %	383180968
85490	NC_016822	AG	3	6	4225948	4225953	50 %	0 %	50 %	0 %	383180968
85491	NC_016822	CGG	2	6	4225986	4225991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180968
85492	NC_016822	GCT	2	6	4226051	4226056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180968
85493	NC_016822	TAA	2	6	4226079	4226084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383180968
85494	NC_016822	CTCC	2	8	4226101	4226108	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
85495	NC_016822	AGC	2	6	4226148	4226153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180969
85496	NC_016822	GAT	2	6	4226172	4226177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180969
85497	NC_016822	CTGC	2	8	4226258	4226265	0 %	25 %	25 %	50 %	383180969
85498	NC_016822	GCG	2	6	4226331	4226336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180969
85499	NC_016822	GAT	2	6	4226352	4226357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180969
85500	NC_016822	CGCTTT	2	12	4226370	4226381	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383180969

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