MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 101059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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74011	NC_016822	AAT	2	6	3658793	3658798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383180384
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74013	NC_016822	ATC	2	6	3658886	3658891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180384
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74018	NC_016822	A	6	6	3658959	3658964	100 %	0 %	0 %	0 %	383180384
74019	NC_016822	GAA	2	6	3659015	3659020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383180384
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74113	NC_016822	GTTCA	2	10	3663624	3663633	20 %	40 %	20 %	20 %	383180390
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74116	NC_016822	TCA	2	6	3663682	3663687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180390
74117	NC_016822	CAT	2	6	3663692	3663697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180390
74118	NC_016822	CGC	2	6	3663779	3663784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383180390
74119	NC_016822	GAC	2	6	3663800	3663805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180390
74120	NC_016822	CCGGTG	2	12	3663826	3663837	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383180390
74121	NC_016822	GCA	2	6	3663941	3663946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180390
74122	NC_016822	GCGCAC	2	12	3663963	3663974	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383180390
74123	NC_016822	TGA	2	6	3664013	3664018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180390
74124	NC_016822	TTG	2	6	3664110	3664115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383180390
74125	NC_016822	GA	3	6	3664129	3664134	50 %	0 %	50 %	0 %	383180390
74126	NC_016822	ATA	2	6	3664219	3664224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383180390
74127	NC_016822	ATGG	2	8	3664260	3664267	25 %	25 %	50 %	0 %	383180390
74128	NC_016822	CGG	2	6	3664289	3664294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180390
74129	NC_016822	CAG	2	6	3664308	3664313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180390
74130	NC_016822	CGA	2	6	3664328	3664333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180390
74131	NC_016822	TGG	2	6	3664367	3664372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383180390
74132	NC_016822	CGT	2	6	3664380	3664385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180390
74133	NC_016822	GTA	2	6	3664485	3664490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180390
74134	NC_016822	GCG	2	6	3664606	3664611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180390
74135	NC_016822	CAG	2	6	3664631	3664636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180390
74136	NC_016822	GTT	2	6	3664652	3664657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383180390
74137	NC_016822	CAG	2	6	3664674	3664679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180390
74138	NC_016822	CG	3	6	3664686	3664691	0 %	0 %	50 %	50 %	383180390
74139	NC_016822	A	6	6	3664727	3664732	100 %	0 %	0 %	0 %	383180390
74140	NC_016822	AAGG	2	8	3664752	3664759	50 %	0 %	50 %	0 %	383180390
74141	NC_016822	TGC	2	6	3664777	3664782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180390
74142	NC_016822	TCGCGC	2	12	3664933	3664944	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383180390
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74144	NC_016822	CTC	2	6	3664989	3664994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383180390
74145	NC_016822	CGA	2	6	3665003	3665008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180390
74146	NC_016822	CAA	2	6	3665043	3665048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383180390
74147	NC_016822	AGA	2	6	3665054	3665059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383180390
74148	NC_016822	GCA	2	6	3665096	3665101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180390
74149	NC_016822	ACG	2	6	3665137	3665142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180390
74150	NC_016822	GCCAGC	2	12	3665146	3665157	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383180390
74151	NC_016822	TCA	3	9	3665186	3665194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180390
74152	NC_016822	ATA	2	6	3665202	3665207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383180390
74153	NC_016822	CAG	2	6	3665214	3665219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180390
74154	NC_016822	AAT	2	6	3665264	3665269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74155	NC_016822	TG	3	6	3665298	3665303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74156	NC_016822	TTCA	2	8	3665384	3665391	25 %	50 %	0 %	25 %	383180391
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74158	NC_016822	AGCA	2	8	3665444	3665451	50 %	0 %	25 %	25 %	383180391
74159	NC_016822	GGT	2	6	3665482	3665487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383180391
74160	NC_016822	TCC	2	6	3665541	3665546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383180391
74161	NC_016822	TGC	2	6	3665593	3665598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180391
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74163	NC_016822	CGT	2	6	3665750	3665755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180391
74164	NC_016822	AC	3	6	3665916	3665921	50 %	0 %	0 %	50 %	383180391
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74167	NC_016822	ATTA	2	8	3666035	3666042	50 %	50 %	0 %	0 %	383180391
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74169	NC_016822	TCG	2	6	3666093	3666098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180391
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74174	NC_016822	AATC	2	8	3666364	3666371	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74175	NC_016822	T	7	7	3666431	3666437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74176	NC_016822	TAA	2	6	3666634	3666639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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74178	NC_016822	TCA	2	6	3666751	3666756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74179	NC_016822	ACA	2	6	3666811	3666816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74180	NC_016822	GC	3	6	3666833	3666838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74181	NC_016822	TGT	2	6	3666935	3666940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383180392
74182	NC_016822	GCA	2	6	3667050	3667055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180392
74183	NC_016822	T	6	6	3667126	3667131	0 %	100 %	0 %	0 %	383180392
74184	NC_016822	CGC	2	6	3667215	3667220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383180392
74185	NC_016822	CGC	2	6	3667228	3667233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383180392
74186	NC_016822	GAA	3	9	3667240	3667248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383180392
74187	NC_016822	CTCTC	2	10	3667324	3667333	0 %	40 %	0 %	60 %	383180392
74188	NC_016822	CG	3	6	3667382	3667387	0 %	0 %	50 %	50 %	383180392
74189	NC_016822	CGCC	2	8	3667410	3667417	0 %	0 %	25 %	75 %	383180392
74190	NC_016822	CGG	2	6	3667508	3667513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180392
74191	NC_016822	CCA	2	6	3667575	3667580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383180392
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74193	NC_016822	CGC	2	6	3667712	3667717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383180392
74194	NC_016822	ACG	2	6	3667733	3667738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180392
74195	NC_016822	CTG	2	6	3667801	3667806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180392
74196	NC_016822	ATC	2	6	3667822	3667827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180392
74197	NC_016822	AAC	2	6	3667864	3667869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383180392
74198	NC_016822	CTT	2	6	3667896	3667901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383180392
74199	NC_016822	CGG	2	6	3667940	3667945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180392
74200	NC_016822	GCC	2	6	3667972	3667977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383180392
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74202	NC_016822	TCA	2	6	3668018	3668023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180392
74203	NC_016822	TCA	2	6	3668036	3668041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180392
74204	NC_016822	GCC	2	6	3668186	3668191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383180392
74205	NC_016822	TGGA	2	8	3668206	3668213	25 %	25 %	50 %	0 %	383180392
74206	NC_016822	CCG	2	6	3668223	3668228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383180392
74207	NC_016822	GAA	2	6	3668257	3668262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383180392
74208	NC_016822	GAC	3	9	3668281	3668289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180392
74209	NC_016822	CGGT	2	8	3668378	3668385	0 %	25 %	50 %	25 %	383180392
74210	NC_016822	GAT	2	6	3668395	3668400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180392
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74212	NC_016822	ACT	2	6	3668444	3668449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180392
74213	NC_016822	CAG	2	6	3668455	3668460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180392
74214	NC_016822	TCGC	2	8	3668515	3668522	0 %	25 %	25 %	50 %	383180392
74215	NC_016822	ACG	2	6	3668629	3668634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180392
74216	NC_016822	A	6	6	3668735	3668740	100 %	0 %	0 %	0 %	383180392
74217	NC_016822	TGC	2	6	3668759	3668764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180392
74218	NC_016822	CAT	2	6	3668877	3668882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180392
74219	NC_016822	CAC	2	6	3668911	3668916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383180392
74220	NC_016822	GCC	2	6	3668981	3668986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383180392
74221	NC_016822	CAA	2	6	3669051	3669056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383180392
74222	NC_016822	CCA	2	6	3669092	3669097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383180392
74223	NC_016822	GCT	2	6	3669110	3669115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180392
74224	NC_016822	CGGT	2	8	3669131	3669138	0 %	25 %	50 %	25 %	383180392
74225	NC_016822	GAT	2	6	3669145	3669150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180392
74226	NC_016822	TGG	2	6	3669189	3669194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383180392
74227	NC_016822	CAG	2	6	3669214	3669219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180392
74228	NC_016822	CTG	2	6	3669223	3669228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180392
74229	NC_016822	CTGG	2	8	3669246	3669253	0 %	25 %	50 %	25 %	383180392
74230	NC_016822	CTG	2	6	3669280	3669285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180392
74231	NC_016822	CGG	2	6	3669297	3669302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180392
74232	NC_016822	GTG	2	6	3669328	3669333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383180392
74233	NC_016822	CAA	2	6	3669343	3669348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383180392
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74235	NC_016822	CTG	2	6	3669430	3669435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180392
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74318	NC_016822	TAA	2	6	3673878	3673883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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74344	NC_016822	CTGG	3	12	3675115	3675126	0 %	25 %	50 %	25 %	383180397
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74444	NC_016822	ATCAC	2	10	3679616	3679625	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
74445	NC_016822	A	6	6	3679668	3679673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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74447	NC_016822	CAA	2	6	3679737	3679742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383180402
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74453	NC_016822	AGC	2	6	3679898	3679903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180402
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74460	NC_016822	CT	3	6	3680210	3680215	0 %	50 %	0 %	50 %	383180402
74461	NC_016822	CTT	2	6	3680317	3680322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383180402
74462	NC_016822	A	6	6	3680402	3680407	100 %	0 %	0 %	0 %	383180402
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74464	NC_016822	A	6	6	3680439	3680444	100 %	0 %	0 %	0 %	383180402
74465	NC_016822	CGC	2	6	3680460	3680465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383180402
74466	NC_016822	GCTCG	2	10	3680506	3680515	0 %	20 %	40 %	40 %	383180402
74467	NC_016822	TGA	2	6	3680538	3680543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180402
74468	NC_016822	TGG	3	9	3680559	3680567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383180402
74469	NC_016822	TGTT	2	8	3680595	3680602	0 %	75 %	25 %	0 %	383180402
74470	NC_016822	TTC	2	6	3680606	3680611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383180402
74471	NC_016822	T	6	6	3680654	3680659	0 %	100 %	0 %	0 %	383180402
74472	NC_016822	TGG	2	6	3680697	3680702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383180402
74473	NC_016822	ACG	2	6	3680732	3680737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180402
74474	NC_016822	TCTGG	2	10	3680777	3680786	0 %	40 %	40 %	20 %	383180402
74475	NC_016822	TGA	2	6	3680799	3680804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180402
74476	NC_016822	TTA	2	6	3680805	3680810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383180402
74477	NC_016822	ACG	2	6	3680951	3680956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180402
74478	NC_016822	GC	4	8	3680960	3680967	0 %	0 %	50 %	50 %	383180402
74479	NC_016822	GGT	2	6	3680986	3680991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383180402
74480	NC_016822	GTG	2	6	3681026	3681031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383180402
74481	NC_016822	TTA	2	6	3681058	3681063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383180402
74482	NC_016822	GCC	2	6	3681086	3681091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74483	NC_016822	ACC	2	6	3681134	3681139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383180403
74484	NC_016822	GTG	2	6	3681142	3681147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383180403
74485	NC_016822	TCA	2	6	3681177	3681182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180403
74486	NC_016822	TCA	2	6	3681246	3681251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180403
74487	NC_016822	ATG	2	6	3681255	3681260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180403
74488	NC_016822	CAGC	2	8	3681340	3681347	25 %	0 %	25 %	50 %	383180403
74489	NC_016822	CCA	2	6	3681372	3681377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383180403
74490	NC_016822	GC	3	6	3681380	3681385	0 %	0 %	50 %	50 %	383180403
74491	NC_016822	TCA	2	6	3681399	3681404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180403
74492	NC_016822	CCA	3	9	3681508	3681516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383180403
74493	NC_016822	GCG	2	6	3681520	3681525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180403
74494	NC_016822	GCA	2	6	3681562	3681567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180403
74495	NC_016822	GAC	2	6	3681574	3681579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180403
74496	NC_016822	GTG	2	6	3681580	3681585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383180403
74497	NC_016822	AAG	2	6	3681651	3681656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383180404
74498	NC_016822	CAG	2	6	3681754	3681759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180404
74499	NC_016822	CAG	2	6	3681838	3681843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180404
74500	NC_016822	TTC	2	6	3681844	3681849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383180404

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