MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 101059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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73003	NC_016822	CAC	2	6	3611005	3611010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383180337
73004	NC_016822	CAT	2	6	3611085	3611090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180337
73005	NC_016822	CAA	2	6	3611245	3611250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73006	NC_016822	CAA	2	6	3611296	3611301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73007	NC_016822	TGC	2	6	3611315	3611320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73008	NC_016822	ACC	2	6	3611322	3611327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73009	NC_016822	GCA	2	6	3611363	3611368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73010	NC_016822	GCT	2	6	3611440	3611445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180338
73011	NC_016822	CTGCC	2	10	3611446	3611455	0 %	20 %	20 %	60 %	383180338
73012	NC_016822	GGC	2	6	3611476	3611481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180338
73013	NC_016822	GAT	2	6	3611522	3611527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180338
73014	NC_016822	A	6	6	3611567	3611572	100 %	0 %	0 %	0 %	383180338
73015	NC_016822	CGC	2	6	3611606	3611611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383180338
73016	NC_016822	GC	3	6	3611668	3611673	0 %	0 %	50 %	50 %	383180338
73017	NC_016822	GGC	2	6	3611683	3611688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180338
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73019	NC_016822	ATC	2	6	3611820	3611825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180338
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73021	NC_016822	CG	3	6	3611856	3611861	0 %	0 %	50 %	50 %	383180338
73022	NC_016822	TGT	2	6	3611862	3611867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383180338
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73053	NC_016822	ACTT	2	8	3613379	3613386	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73054	NC_016822	CT	3	6	3613408	3613413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73055	NC_016822	ATT	2	6	3613435	3613440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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73083	NC_016822	GAAG	2	8	3614509	3614516	50 %	0 %	50 %	0 %	383180340
73084	NC_016822	GTT	2	6	3614518	3614523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383180340
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73086	NC_016822	AAGCG	2	10	3614590	3614599	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
73087	NC_016822	GCA	2	6	3614617	3614622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73088	NC_016822	GCA	2	6	3614662	3614667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180341
73089	NC_016822	ATC	2	6	3614730	3614735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180341
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73092	NC_016822	GCT	2	6	3614829	3614834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180341
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73095	NC_016822	GAAC	2	8	3614999	3615006	50 %	0 %	25 %	25 %	383180341
73096	NC_016822	CAG	2	6	3615035	3615040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180341
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73098	NC_016822	TCG	2	6	3615151	3615156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180341
73099	NC_016822	CGTAC	2	10	3615194	3615203	20 %	20 %	20 %	40 %	383180341
73100	NC_016822	TCA	2	6	3615247	3615252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180341
73101	NC_016822	CAGA	2	8	3615287	3615294	50 %	0 %	25 %	25 %	383180341
73102	NC_016822	TCA	2	6	3615304	3615309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180341
73103	NC_016822	GAA	2	6	3615398	3615403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383180341
73104	NC_016822	ACCAC	2	10	3615463	3615472	40 %	0 %	0 %	60 %	383180341
73105	NC_016822	CAG	2	6	3615482	3615487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180341
73106	NC_016822	CAAAAC	2	12	3615490	3615501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383180341
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73108	NC_016822	ATC	2	6	3615708	3615713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180341
73109	NC_016822	GCA	2	6	3615724	3615729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180341
73110	NC_016822	GCC	2	6	3615753	3615758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383180341
73111	NC_016822	AAT	2	6	3615818	3615823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383180341
73112	NC_016822	GCC	2	6	3615827	3615832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383180341
73113	NC_016822	CAC	2	6	3615839	3615844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383180341
73114	NC_016822	GCC	2	6	3615845	3615850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383180341
73115	NC_016822	AGC	2	6	3615852	3615857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180341
73116	NC_016822	GTG	2	6	3615873	3615878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383180341
73117	NC_016822	TC	3	6	3615900	3615905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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73226	NC_016822	GTAC	2	8	3620757	3620764	25 %	25 %	25 %	25 %	383180344
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73233	NC_016822	GAC	2	6	3620994	3620999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180344
73234	NC_016822	ACG	2	6	3621004	3621009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180344
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73237	NC_016822	GAA	2	6	3621073	3621078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383180344
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73246	NC_016822	TCAT	2	8	3621394	3621401	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73247	NC_016822	CAA	2	6	3621404	3621409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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73291	NC_016822	AATT	2	8	3623298	3623305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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73345	NC_016822	ACG	2	6	3625736	3625741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180348
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73449	NC_016822	TCA	3	9	3630813	3630821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73450	NC_016822	TTAA	2	8	3630823	3630830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73451	NC_016822	GAC	2	6	3630848	3630853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180353
73452	NC_016822	CGG	2	6	3630902	3630907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180353
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73466	NC_016822	TGTC	2	8	3631399	3631406	0 %	50 %	25 %	25 %	383180353
73467	NC_016822	CGAAG	2	10	3631451	3631460	40 %	0 %	40 %	20 %	383180353
73468	NC_016822	AGA	2	6	3631547	3631552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383180353
73469	NC_016822	CGA	2	6	3631610	3631615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383180353
73470	NC_016822	ATG	2	6	3631623	3631628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180353
73471	NC_016822	CGG	2	6	3631646	3631651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180353
73472	NC_016822	ATC	2	6	3631692	3631697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180353
73473	NC_016822	GTC	2	6	3631816	3631821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180353
73474	NC_016822	CTG	2	6	3631833	3631838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180353
73475	NC_016822	TGC	2	6	3631873	3631878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180353
73476	NC_016822	CT	3	6	3631883	3631888	0 %	50 %	0 %	50 %	383180353
73477	NC_016822	GCCA	2	8	3631902	3631909	25 %	0 %	25 %	50 %	383180353
73478	NC_016822	ATT	2	6	3631951	3631956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383180353
73479	NC_016822	GAT	2	6	3632040	3632045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383180353
73480	NC_016822	GA	3	6	3632092	3632097	50 %	0 %	50 %	0 %	383180353
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73482	NC_016822	GGGGT	2	10	3632213	3632222	0 %	20 %	80 %	0 %	383180354
73483	NC_016822	CAT	2	6	3632274	3632279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180354
73484	NC_016822	TCC	2	6	3632327	3632332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383180354
73485	NC_016822	GTT	2	6	3632343	3632348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383180354
73486	NC_016822	TAA	2	6	3632376	3632381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383180354
73487	NC_016822	ATT	2	6	3632386	3632391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383180354
73488	NC_016822	TGT	2	6	3632409	3632414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383180354
73489	NC_016822	CTG	2	6	3632485	3632490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180354
73490	NC_016822	TTC	3	9	3632522	3632530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383180354
73491	NC_016822	GCG	2	6	3632578	3632583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383180354
73492	NC_016822	TAA	2	6	3632590	3632595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383180354
73493	NC_016822	AATG	2	8	3632628	3632635	50 %	25 %	25 %	0 %	383180354
73494	NC_016822	GAA	2	6	3632733	3632738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383180354
73495	NC_016822	TGC	2	6	3632753	3632758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180354
73496	NC_016822	CAA	3	9	3632791	3632799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383180354
73497	NC_016822	TCA	2	6	3632801	3632806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383180354
73498	NC_016822	GC	3	6	3632834	3632839	0 %	0 %	50 %	50 %	383180354
73499	NC_016822	CTG	2	6	3632856	3632861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383180354
73500	NC_016822	TAA	2	6	3632931	3632936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383180354

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