MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 101059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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65004	NC_016822	CTTCA	2	10	3213659	3213668	20 %	40 %	0 %	40 %	383179946
65005	NC_016822	TCA	3	9	3213666	3213674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383179946
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65007	NC_016822	TA	3	6	3213798	3213803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65008	NC_016822	CG	3	6	3213857	3213862	0 %	0 %	50 %	50 %	383179947
65009	NC_016822	AAC	2	6	3214034	3214039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383179947
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65011	NC_016822	ACC	2	6	3214067	3214072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383179947
65012	NC_016822	CGG	2	6	3214083	3214088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383179947
65013	NC_016822	CAA	2	6	3214113	3214118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383179947
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65015	NC_016822	ATCTC	2	10	3214211	3214220	20 %	40 %	0 %	40 %	383179947
65016	NC_016822	GCA	2	6	3214234	3214239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383179947
65017	NC_016822	GC	3	6	3214240	3214245	0 %	0 %	50 %	50 %	383179947
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65019	NC_016822	T	6	6	3214323	3214328	0 %	100 %	0 %	0 %	383179947
65020	NC_016822	GCG	3	9	3214346	3214354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383179947
65021	NC_016822	TTA	2	6	3214376	3214381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383179947
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65024	NC_016822	TCG	2	6	3214451	3214456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383179947
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65113	NC_016822	GCG	2	6	3218967	3218972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383179949
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65115	NC_016822	ATT	2	6	3219047	3219052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383179949
65116	NC_016822	GCA	2	6	3219116	3219121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383179949
65117	NC_016822	CGC	2	6	3219153	3219158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383179949
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65119	NC_016822	CAAG	2	8	3219349	3219356	50 %	0 %	25 %	25 %	383179949
65120	NC_016822	CTG	2	6	3219374	3219379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383179949
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65122	NC_016822	TCA	2	6	3219427	3219432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383179949
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65135	NC_016822	TGC	2	6	3219963	3219968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383179949
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65146	NC_016822	A	6	6	3220367	3220372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65147	NC_016822	GGTTTT	2	12	3220449	3220460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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65213	NC_016822	CAC	2	6	3224453	3224458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383179952
65214	NC_016822	TTG	2	6	3224521	3224526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383179952
65215	NC_016822	T	6	6	3224603	3224608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65216	NC_016822	GC	3	6	3224674	3224679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65217	NC_016822	CAA	2	6	3224697	3224702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65218	NC_016822	ACAAGA	2	12	3224780	3224791	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65219	NC_016822	AAGG	2	8	3224792	3224799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65220	NC_016822	GAA	2	6	3224808	3224813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65221	NC_016822	AGA	2	6	3224818	3224823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65222	NC_016822	GATTC	2	10	3224908	3224917	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65223	NC_016822	CGCT	2	8	3224941	3224948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65224	NC_016822	ACA	2	6	3224961	3224966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383179953
65225	NC_016822	TTCCGG	2	12	3225004	3225015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383179953
65226	NC_016822	TCAA	2	8	3225029	3225036	50 %	25 %	0 %	25 %	383179953
65227	NC_016822	CAA	2	6	3225073	3225078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383179953
65228	NC_016822	GCC	2	6	3225094	3225099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383179953
65229	NC_016822	CTG	2	6	3225119	3225124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383179953
65230	NC_016822	ACC	2	6	3225242	3225247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383179953
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65232	NC_016822	TC	3	6	3225434	3225439	0 %	50 %	0 %	50 %	383179954
65233	NC_016822	GCCA	2	8	3225497	3225504	25 %	0 %	25 %	50 %	383179954
65234	NC_016822	GTC	2	6	3225531	3225536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383179954
65235	NC_016822	ACTG	2	8	3225590	3225597	25 %	25 %	25 %	25 %	383179954
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65250	NC_016822	TTTA	2	8	3226158	3226165	25 %	75 %	0 %	0 %	383179954
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65258	NC_016822	TTG	2	6	3226641	3226646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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65274	NC_016822	GTTTA	2	10	3227738	3227747	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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65352	NC_016822	CA	3	6	3231409	3231414	50 %	0 %	0 %	50 %	383179960
65353	NC_016822	ATG	2	6	3231417	3231422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383179960
65354	NC_016822	TTC	2	6	3231438	3231443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383179960
65355	NC_016822	TCCT	2	8	3231594	3231601	0 %	50 %	0 %	50 %	383179960
65356	NC_016822	CAA	2	6	3231683	3231688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383179960
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65362	NC_016822	CT	3	6	3231923	3231928	0 %	50 %	0 %	50 %	383179960
65363	NC_016822	CGC	2	6	3231948	3231953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65364	NC_016822	GCG	2	6	3231960	3231965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65365	NC_016822	TCC	2	6	3231968	3231973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65366	NC_016822	CGA	2	6	3232085	3232090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383179961
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65405	NC_016822	TA	3	6	3234279	3234284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65406	NC_016822	CGT	2	6	3234304	3234309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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65469	NC_016822	CTT	2	6	3237625	3237630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383179965
65470	NC_016822	TCA	2	6	3237657	3237662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383179965
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