MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103

Total Repeats: 101213

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
100001	NC_016812	A	6	6	4249807	4249812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100002	NC_016812	CG	3	6	4249837	4249842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100003	NC_016812	CG	3	6	4249857	4249862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100004	NC_016812	TAT	2	6	4249870	4249875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100005	NC_016812	CGG	3	9	4249921	4249929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100006	NC_016812	CAT	2	6	4249959	4249964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100007	NC_016812	CG	3	6	4249970	4249975	0 %	0 %	50 %	50 %	378828499
100008	NC_016812	TGG	2	6	4250030	4250035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378828499
100009	NC_016812	TCCGT	2	10	4250089	4250098	0 %	40 %	20 %	40 %	378828499
100010	NC_016812	GAG	2	6	4250335	4250340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378828500
100011	NC_016812	CAG	2	6	4250347	4250352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828500
100012	NC_016812	CTG	2	6	4250361	4250366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828500
100013	NC_016812	TCC	2	6	4250422	4250427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378828500
100014	NC_016812	GCG	2	6	4250436	4250441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828500
100015	NC_016812	GT	3	6	4250473	4250478	0 %	50 %	50 %	0 %	378828500
100016	NC_016812	ATT	2	6	4250508	4250513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378828500
100017	NC_016812	GAG	2	6	4250544	4250549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378828500
100018	NC_016812	AAAC	2	8	4250588	4250595	75 %	0 %	0 %	25 %	378828500
100019	NC_016812	GAG	2	6	4250715	4250720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378828500
100020	NC_016812	TGGC	2	8	4250798	4250805	0 %	25 %	50 %	25 %	378828500
100021	NC_016812	CG	3	6	4250935	4250940	0 %	0 %	50 %	50 %	378828500
100022	NC_016812	CTAG	2	8	4250961	4250968	25 %	25 %	25 %	25 %	378828500
100023	NC_016812	A	6	6	4250978	4250983	100 %	0 %	0 %	0 %	378828500
100024	NC_016812	CGT	2	6	4251068	4251073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828500
100025	NC_016812	TGCGA	2	10	4251109	4251118	20 %	20 %	40 %	20 %	378828500
100026	NC_016812	TTCG	2	8	4251192	4251199	0 %	50 %	25 %	25 %	378828500
100027	NC_016812	C	6	6	4251264	4251269	0 %	0 %	0 %	100 %	378828500
100028	NC_016812	GAT	2	6	4251302	4251307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100029	NC_016812	GCC	2	6	4251308	4251313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100030	NC_016812	CTG	2	6	4251343	4251348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100031	NC_016812	CTTC	2	8	4251360	4251367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100032	NC_016812	AGGA	2	8	4251378	4251385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100033	NC_016812	GA	3	6	4251400	4251405	50 %	0 %	50 %	0 %	378828501
100034	NC_016812	GCG	2	6	4251414	4251419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828501
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100036	NC_016812	GAC	2	6	4251559	4251564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828501
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100038	NC_016812	CGGC	2	8	4251809	4251816	0 %	0 %	50 %	50 %	378828501
100039	NC_016812	TCG	2	6	4251827	4251832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828501
100040	NC_016812	GTT	3	9	4251856	4251864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378828501
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100042	NC_016812	GGC	2	6	4252104	4252109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828501
100043	NC_016812	TCG	2	6	4252187	4252192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828501
100044	NC_016812	TCT	2	6	4252226	4252231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378828501
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100047	NC_016812	TAT	2	6	4252444	4252449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378828501
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100050	NC_016812	CGGCAA	2	12	4252557	4252568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828501
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100053	NC_016812	ATC	2	6	4252741	4252746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378828501
100054	NC_016812	GCGG	2	8	4252790	4252797	0 %	0 %	75 %	25 %	378828501
100055	NC_016812	GCG	2	6	4252882	4252887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828501
100056	NC_016812	TGCT	2	8	4252955	4252962	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100057	NC_016812	TC	3	6	4253052	4253057	0 %	50 %	0 %	50 %	378828502
100058	NC_016812	TGC	2	6	4253078	4253083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828502
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100061	NC_016812	GC	3	6	4253303	4253308	0 %	0 %	50 %	50 %	378828502
100062	NC_016812	CG	3	6	4253385	4253390	0 %	0 %	50 %	50 %	378828502
100063	NC_016812	CTG	2	6	4253497	4253502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828502
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100068	NC_016812	ATC	2	6	4253718	4253723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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100084	NC_016812	TTCG	2	8	4254354	4254361	0 %	50 %	25 %	25 %	378828503
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100086	NC_016812	GTC	2	6	4254477	4254482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828503
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100088	NC_016812	A	6	6	4254637	4254642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100089	NC_016812	CAC	2	6	4254718	4254723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378828504
100090	NC_016812	TCC	2	6	4254781	4254786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378828504
100091	NC_016812	GC	4	8	4254856	4254863	0 %	0 %	50 %	50 %	378828504
100092	NC_016812	CTTTGC	2	12	4254887	4254898	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378828504
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100099	NC_016812	CG	3	6	4255217	4255222	0 %	0 %	50 %	50 %	378828504
100100	NC_016812	CGAC	2	8	4255244	4255251	25 %	0 %	25 %	50 %	378828504
100101	NC_016812	TCG	2	6	4255261	4255266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828504
100102	NC_016812	CGA	2	6	4255282	4255287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828504
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100104	NC_016812	CTT	2	6	4255400	4255405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100105	NC_016812	ATGC	2	8	4255438	4255445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100106	NC_016812	CGA	3	9	4255494	4255502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828505
100107	NC_016812	TAA	2	6	4255511	4255516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378828505
100108	NC_016812	T	6	6	4255561	4255566	0 %	100 %	0 %	0 %	378828505
100109	NC_016812	CGG	2	6	4255634	4255639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828505
100110	NC_016812	CAA	2	6	4255697	4255702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378828505
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100112	NC_016812	GC	3	6	4255776	4255781	0 %	0 %	50 %	50 %	378828505
100113	NC_016812	AGG	2	6	4255850	4255855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378828505
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100115	NC_016812	AT	3	6	4255923	4255928	50 %	50 %	0 %	0 %	378828505
100116	NC_016812	CGA	2	6	4256373	4256378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828505
100117	NC_016812	GCA	2	6	4256384	4256389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828505
100118	NC_016812	CTTG	2	8	4256406	4256413	0 %	50 %	25 %	25 %	378828505
100119	NC_016812	CGT	2	6	4256514	4256519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828505
100120	NC_016812	GT	3	6	4256604	4256609	0 %	50 %	50 %	0 %	378828505
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100133	NC_016812	TTC	2	6	4257074	4257079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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100187	NC_016812	CGAT	2	8	4260310	4260317	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100188	NC_016812	CGCGA	2	10	4260360	4260369	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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100219	NC_016812	TGTC	2	8	4262210	4262217	0 %	50 %	25 %	25 %	378828510
100220	NC_016812	AC	3	6	4262237	4262242	50 %	0 %	0 %	50 %	378828510
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100223	NC_016812	GTC	2	6	4262343	4262348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828510
100224	NC_016812	GAA	2	6	4262547	4262552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378828510
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100226	NC_016812	GACC	2	8	4262640	4262647	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100227	NC_016812	CTT	2	6	4262718	4262723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378828511
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100229	NC_016812	ACTG	2	8	4262838	4262845	25 %	25 %	25 %	25 %	378828511
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100232	NC_016812	GAA	2	6	4263050	4263055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378828511
100233	NC_016812	CCT	2	6	4263083	4263088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378828511
100234	NC_016812	GCG	2	6	4263150	4263155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100235	NC_016812	CGATC	2	10	4263160	4263169	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
100236	NC_016812	GCA	2	6	4263234	4263239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100237	NC_016812	GAG	2	6	4263252	4263257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100238	NC_016812	GCA	2	6	4263345	4263350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100239	NC_016812	GCA	2	6	4263353	4263358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100240	NC_016812	TCG	2	6	4263409	4263414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100241	NC_016812	TGA	2	6	4263431	4263436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100242	NC_016812	CGGT	2	8	4263521	4263528	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100243	NC_016812	GCG	2	6	4263575	4263580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100244	NC_016812	TGGT	2	8	4263581	4263588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100245	NC_016812	GCG	2	6	4263677	4263682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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100250	NC_016812	TCT	2	6	4263813	4263818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378828512
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100258	NC_016812	CGCTGA	2	12	4264085	4264096	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378828513
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100272	NC_016812	GAA	2	6	4264850	4264855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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100352	NC_016812	CGGC	2	8	4269578	4269585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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100355	NC_016812	TGA	2	6	4269734	4269739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378828516
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100466	NC_016812	GC	3	6	4275342	4275347	0 %	0 %	50 %	50 %	378828522
100467	NC_016812	GCCGA	2	10	4275349	4275358	20 %	0 %	40 %	40 %	378828522
100468	NC_016812	ATC	2	6	4275443	4275448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378828522
100469	NC_016812	CGAA	2	8	4275486	4275493	50 %	0 %	25 %	25 %	378828523
100470	NC_016812	GCCG	2	8	4275513	4275520	0 %	0 %	50 %	50 %	378828523
100471	NC_016812	CGATC	2	10	4275581	4275590	20 %	20 %	20 %	40 %	378828523
100472	NC_016812	GC	3	6	4275626	4275631	0 %	0 %	50 %	50 %	378828523
100473	NC_016812	CGC	2	6	4275777	4275782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828523
100474	NC_016812	ACC	2	6	4275790	4275795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378828523
100475	NC_016812	GCG	3	9	4275815	4275823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828523
100476	NC_016812	AGA	2	6	4275863	4275868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378828523
100477	NC_016812	GGC	2	6	4275870	4275875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378828523
100478	NC_016812	CGAG	2	8	4275878	4275885	25 %	0 %	50 %	25 %	378828523
100479	NC_016812	GCC	2	6	4275921	4275926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828523
100480	NC_016812	CAT	2	6	4275951	4275956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378828523
100481	NC_016812	AGA	2	6	4275980	4275985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378828523
100482	NC_016812	TGG	2	6	4275989	4275994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378828523
100483	NC_016812	TCT	2	6	4276001	4276006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378828523
100484	NC_016812	GC	3	6	4276019	4276024	0 %	0 %	50 %	50 %	378828523
100485	NC_016812	AGC	2	6	4276033	4276038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828523
100486	NC_016812	TCG	2	6	4276064	4276069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828523
100487	NC_016812	GATCGA	2	12	4276071	4276082	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378828523
100488	NC_016812	AGC	3	9	4276105	4276113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828523
100489	NC_016812	GAC	2	6	4276119	4276124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828523
100490	NC_016812	CGC	2	6	4276133	4276138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828523
100491	NC_016812	CGA	2	6	4276154	4276159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828523
100492	NC_016812	ACG	2	6	4276249	4276254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828523
100493	NC_016812	GCC	2	6	4276315	4276320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828523
100494	NC_016812	CGC	2	6	4276339	4276344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378828523
100495	NC_016812	CGCT	2	8	4276361	4276368	0 %	25 %	25 %	50 %	378828523
100496	NC_016812	AT	3	6	4276413	4276418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100497	NC_016812	GAG	2	6	4276621	4276626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378828524
100498	NC_016812	GGCTA	2	10	4276670	4276679	20 %	20 %	40 %	20 %	378828524
100499	NC_016812	GGT	2	6	4276692	4276697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378828524
100500	NC_016812	TGC	2	6	4276721	4276726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828524

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