MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_016810	CAA	2	6	861479	861484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698733
18503	NC_016810	CGCC	2	8	861506	861513	0 %	0 %	25 %	75 %	378698733
18504	NC_016810	GC	3	6	861533	861538	0 %	0 %	50 %	50 %	378698733
18505	NC_016810	TTAACG	2	12	861545	861556	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378698733
18506	NC_016810	CTG	2	6	861587	861592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698733
18507	NC_016810	TGC	2	6	861597	861602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698733
18508	NC_016810	GCG	3	9	861630	861638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698734
18509	NC_016810	GGCCG	2	10	861642	861651	0 %	0 %	60 %	40 %	378698734
18510	NC_016810	GCA	2	6	861680	861685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698734
18511	NC_016810	GCT	2	6	861701	861706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698734
18512	NC_016810	GCC	2	6	861721	861726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698734
18513	NC_016810	GT	3	6	861736	861741	0 %	50 %	50 %	0 %	378698734
18514	NC_016810	TGC	2	6	861829	861834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698734
18515	NC_016810	GGC	2	6	861854	861859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698734
18516	NC_016810	CCTGG	2	10	861917	861926	0 %	20 %	40 %	40 %	378698734
18517	NC_016810	GTG	2	6	861944	861949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698734
18518	NC_016810	CGG	2	6	861998	862003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698734
18519	NC_016810	GTG	2	6	862005	862010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698734
18520	NC_016810	ACC	2	6	862017	862022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698734
18521	NC_016810	GGCG	2	8	862135	862142	0 %	0 %	75 %	25 %	378698734
18522	NC_016810	TACTGA	2	12	862377	862388	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378698735
18523	NC_016810	CAG	2	6	862536	862541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698735
18524	NC_016810	CGA	2	6	862614	862619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698735
18525	NC_016810	CGG	2	6	862637	862642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698735
18526	NC_016810	GCAG	2	8	862674	862681	25 %	0 %	50 %	25 %	378698735
18527	NC_016810	GCGG	2	8	862702	862709	0 %	0 %	75 %	25 %	378698735
18528	NC_016810	CT	3	6	862723	862728	0 %	50 %	0 %	50 %	378698735
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18532	NC_016810	GCC	2	6	862887	862892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698735
18533	NC_016810	GC	3	6	862895	862900	0 %	0 %	50 %	50 %	378698735
18534	NC_016810	CGC	2	6	862927	862932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698735
18535	NC_016810	GGC	2	6	862989	862994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698735
18536	NC_016810	GACAG	2	10	862995	863004	40 %	0 %	40 %	20 %	378698735
18537	NC_016810	CTT	2	6	863055	863060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18538	NC_016810	CTG	2	6	863077	863082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18539	NC_016810	T	6	6	863083	863088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18540	NC_016810	AAT	2	6	863171	863176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18541	NC_016810	T	9	9	863196	863204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18542	NC_016810	GGC	2	6	863241	863246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18543	NC_016810	TA	3	6	863401	863406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18544	NC_016810	AAGG	2	8	863422	863429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18545	NC_016810	TCA	2	6	863452	863457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18546	NC_016810	A	6	6	863476	863481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18547	NC_016810	CTG	2	6	863509	863514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18548	NC_016810	T	6	6	863600	863605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18549	NC_016810	T	6	6	863615	863620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18550	NC_016810	CGT	2	6	863751	863756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698736
18551	NC_016810	GGA	2	6	863771	863776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698736
18552	NC_016810	GGC	2	6	863894	863899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698736
18553	NC_016810	CTA	2	6	863960	863965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698736
18554	NC_016810	ACT	2	6	863968	863973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698736
18555	NC_016810	GTG	3	9	864096	864104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698736
18556	NC_016810	ATG	2	6	864156	864161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698736
18557	NC_016810	GC	3	6	864194	864199	0 %	0 %	50 %	50 %	378698736
18558	NC_016810	GCG	2	6	864274	864279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698736
18559	NC_016810	GAC	2	6	864309	864314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698736
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18561	NC_016810	CTAT	2	8	864412	864419	25 %	50 %	0 %	25 %	378698736
18562	NC_016810	CGC	2	6	864439	864444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698736
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18570	NC_016810	CTG	2	6	864687	864692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698736
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18573	NC_016810	GAG	2	6	864825	864830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698736
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18575	NC_016810	TGA	2	6	864902	864907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698736
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18578	NC_016810	GCT	2	6	864938	864943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698736
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18585	NC_016810	TGG	2	6	865237	865242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698736
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18592	NC_016810	GTT	2	6	865688	865693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698736
18593	NC_016810	AGTC	2	8	865784	865791	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18594	NC_016810	GAA	2	6	865878	865883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18595	NC_016810	CT	3	6	865920	865925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18596	NC_016810	A	8	8	865937	865944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18597	NC_016810	TAT	2	6	865952	865957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18598	NC_016810	CAT	2	6	866032	866037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18599	NC_016810	A	6	6	866045	866050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18600	NC_016810	GAC	2	6	866119	866124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18603	NC_016810	AGA	2	6	866384	866389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698737
18604	NC_016810	ATA	2	6	866443	866448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698737
18605	NC_016810	TAG	2	6	866456	866461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698737
18606	NC_016810	AGG	2	6	866462	866467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698737
18607	NC_016810	GAGG	2	8	866547	866554	25 %	0 %	75 %	0 %	378698737
18608	NC_016810	AGTC	2	8	866560	866567	25 %	25 %	25 %	25 %	378698737
18609	NC_016810	GCA	2	6	866682	866687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698737
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18611	NC_016810	ATA	2	6	866731	866736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698737
18612	NC_016810	ACT	2	6	866802	866807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698737
18613	NC_016810	ATA	2	6	867010	867015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698737
18614	NC_016810	GCC	2	6	867167	867172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698737
18615	NC_016810	ACC	2	6	867230	867235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698737
18616	NC_016810	GTAA	2	8	867255	867262	50 %	25 %	25 %	0 %	378698737
18617	NC_016810	TCC	2	6	867293	867298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698737
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18986	NC_016810	TGG	2	6	884587	884592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698756
18987	NC_016810	GTG	2	6	884595	884600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698756
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