MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

< Previous12...3233343536373839404142...206207Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_016810	GTT	2	6	838452	838457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698712
18003	NC_016810	GCT	2	6	838460	838465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698712
18004	NC_016810	CGC	2	6	838481	838486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698712
18005	NC_016810	CTG	2	6	838503	838508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698712
18006	NC_016810	CGG	2	6	838568	838573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698712
18007	NC_016810	GTACG	2	10	838583	838592	20 %	20 %	40 %	20 %	378698712
18008	NC_016810	TCG	2	6	838594	838599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698712
18009	NC_016810	CG	3	6	838598	838603	0 %	0 %	50 %	50 %	378698712
18010	NC_016810	CAT	2	6	838655	838660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698712
18011	NC_016810	GC	4	8	838748	838755	0 %	0 %	50 %	50 %	378698712
18012	NC_016810	CG	3	6	838814	838819	0 %	0 %	50 %	50 %	378698713
18013	NC_016810	ACGG	2	8	838895	838902	25 %	0 %	50 %	25 %	378698713
18014	NC_016810	GCA	2	6	838912	838917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698713
18015	NC_016810	GCG	2	6	838918	838923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698713
18016	NC_016810	GTGC	2	8	838933	838940	0 %	25 %	50 %	25 %	378698713
18017	NC_016810	TTC	2	6	838958	838963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698713
18018	NC_016810	GC	3	6	838975	838980	0 %	0 %	50 %	50 %	378698713
18019	NC_016810	GGAA	2	8	839002	839009	50 %	0 %	50 %	0 %	378698713
18020	NC_016810	CGCCAG	2	12	839051	839062	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378698713
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18022	NC_016810	GCT	2	6	839071	839076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698713
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18032	NC_016810	CA	3	6	839659	839664	50 %	0 %	0 %	50 %	378698713
18033	NC_016810	GCA	2	6	839689	839694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698713
18034	NC_016810	GCG	2	6	839746	839751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698713
18035	NC_016810	GAT	2	6	839797	839802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698713
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18037	NC_016810	TGCCAG	2	12	839866	839877	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378698714
18038	NC_016810	CGCGG	2	10	839975	839984	0 %	0 %	60 %	40 %	378698714
18039	NC_016810	TAAT	2	8	839995	840002	50 %	50 %	0 %	0 %	378698714
18040	NC_016810	ACG	2	6	840118	840123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698714
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18042	NC_016810	GCGA	2	8	840205	840212	25 %	0 %	50 %	25 %	378698714
18043	NC_016810	CGA	2	6	840217	840222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698714
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18046	NC_016810	GCA	2	6	840326	840331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698714
18047	NC_016810	ACTCC	2	10	840339	840348	20 %	20 %	0 %	60 %	378698714
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18052	NC_016810	GAC	2	6	840768	840773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698714
18053	NC_016810	GCA	2	6	840788	840793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698714
18054	NC_016810	ACC	2	6	840828	840833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698714
18055	NC_016810	TATGG	2	10	840870	840879	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18056	NC_016810	TAA	2	6	840920	840925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18057	NC_016810	AC	3	6	840942	840947	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18058	NC_016810	ATC	2	6	840987	840992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18060	NC_016810	ACGG	2	8	841055	841062	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18061	NC_016810	T	6	6	841080	841085	0 %	100 %	0 %	0 %	378698715
18062	NC_016810	CGA	2	6	841121	841126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698715
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18077	NC_016810	CATT	2	8	841667	841674	25 %	50 %	0 %	25 %	378698715
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18083	NC_016810	TAT	2	6	841956	841961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698715
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18086	NC_016810	TTA	3	9	842086	842094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18088	NC_016810	GC	3	6	842126	842131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18089	NC_016810	ATA	2	6	842144	842149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18090	NC_016810	ATT	2	6	842156	842161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698716
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18092	NC_016810	ATG	2	6	842246	842251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698716
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18094	NC_016810	TC	3	6	842272	842277	0 %	50 %	0 %	50 %	378698716
18095	NC_016810	GC	4	8	842383	842390	0 %	0 %	50 %	50 %	378698716
18096	NC_016810	GCT	2	6	842407	842412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698716
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18099	NC_016810	GA	3	6	842547	842552	50 %	0 %	50 %	0 %	378698716
18100	NC_016810	CTG	3	9	842598	842606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698716
18101	NC_016810	T	6	6	842621	842626	0 %	100 %	0 %	0 %	378698716
18102	NC_016810	CGC	2	6	842644	842649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698716
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18105	NC_016810	TAA	2	6	842710	842715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698716
18106	NC_016810	CGA	2	6	842752	842757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698716
18107	NC_016810	GTG	2	6	842795	842800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698716
18108	NC_016810	ACT	2	6	842826	842831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698716
18109	NC_016810	GGCG	2	8	842875	842882	0 %	0 %	75 %	25 %	378698716
18110	NC_016810	CGCT	2	8	842922	842929	0 %	25 %	25 %	50 %	378698716
18111	NC_016810	CAAC	2	8	842944	842951	50 %	0 %	0 %	50 %	378698716
18112	NC_016810	GCA	2	6	842959	842964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698716
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18242	NC_016810	CAT	2	6	849323	849328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698723
18243	NC_016810	TG	3	6	849436	849441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18244	NC_016810	TCA	2	6	849464	849469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18245	NC_016810	TTGC	2	8	849501	849508	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18246	NC_016810	GCC	2	6	849522	849527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18247	NC_016810	CTG	2	6	849532	849537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18249	NC_016810	ACT	2	6	849593	849598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698724
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18265	NC_016810	ATCG	2	8	850420	850427	25 %	25 %	25 %	25 %	378698724
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18272	NC_016810	CAA	2	6	851007	851012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18274	NC_016810	AG	3	6	851081	851086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18275	NC_016810	GCA	3	9	851157	851165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698725
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18283	NC_016810	ATG	2	6	851479	851484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698725
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18483	NC_016810	CTG	2	6	860867	860872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698733
18484	NC_016810	CGC	2	6	860903	860908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698733
18485	NC_016810	GCA	2	6	860926	860931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698733
18486	NC_016810	TGG	2	6	860973	860978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698733
18487	NC_016810	GC	3	6	861012	861017	0 %	0 %	50 %	50 %	378698733
18488	NC_016810	CAT	2	6	861050	861055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698733
18489	NC_016810	GTTG	2	8	861064	861071	0 %	50 %	50 %	0 %	378698733
18490	NC_016810	ATG	2	6	861072	861077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698733
18491	NC_016810	GGGGC	2	10	861106	861115	0 %	0 %	80 %	20 %	378698733
18492	NC_016810	CTG	2	6	861118	861123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698733
18493	NC_016810	G	6	6	861129	861134	0 %	0 %	100 %	0 %	378698733
18494	NC_016810	TGG	2	6	861150	861155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698733
18495	NC_016810	GCG	2	6	861183	861188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698733
18496	NC_016810	TGCTC	2	10	861195	861204	0 %	40 %	20 %	40 %	378698733
18497	NC_016810	CTG	2	6	861224	861229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698733
18498	NC_016810	GCC	2	6	861265	861270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698733
18499	NC_016810	CAGGCG	2	12	861275	861286	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378698733
18500	NC_016810	GGT	2	6	861323	861328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698733

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