MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_016810	CAT	2	6	680363	680368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14502	NC_016810	CCA	2	6	680422	680427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698571
14503	NC_016810	GCC	2	6	680470	680475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698571
14504	NC_016810	AGT	2	6	680476	680481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698571
14505	NC_016810	CAG	2	6	680573	680578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698571
14506	NC_016810	GTT	2	6	680587	680592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698571
14507	NC_016810	GCA	2	6	680638	680643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698571
14508	NC_016810	ACCAGT	2	12	680697	680708	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378698571
14509	NC_016810	GA	3	6	680728	680733	50 %	0 %	50 %	0 %	378698571
14510	NC_016810	ACC	2	6	680808	680813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698571
14511	NC_016810	TGT	2	6	680848	680853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698571
14512	NC_016810	CAG	2	6	680909	680914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698571
14513	NC_016810	TGA	2	6	680932	680937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698571
14514	NC_016810	CCA	2	6	680943	680948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698571
14515	NC_016810	CTAAG	2	10	680962	680971	40 %	20 %	20 %	20 %	378698571
14516	NC_016810	T	6	6	681021	681026	0 %	100 %	0 %	0 %	378698571
14517	NC_016810	CGC	2	6	681031	681036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698571
14518	NC_016810	AAT	2	6	681119	681124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698571
14519	NC_016810	CAGC	2	8	681155	681162	25 %	0 %	25 %	50 %	378698571
14520	NC_016810	CAT	2	6	681263	681268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698571
14521	NC_016810	CCG	2	6	681282	681287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698571
14522	NC_016810	GCG	2	6	681290	681295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698571
14523	NC_016810	GCG	2	6	681328	681333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698571
14524	NC_016810	TGA	2	6	681343	681348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698571
14525	NC_016810	CCG	2	6	681363	681368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698571
14526	NC_016810	GGAG	2	8	681383	681390	25 %	0 %	75 %	0 %	378698571
14527	NC_016810	GCGT	2	8	681442	681449	0 %	25 %	50 %	25 %	378698571
14528	NC_016810	GCG	2	6	681482	681487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698571
14529	NC_016810	CCAG	2	8	681538	681545	25 %	0 %	25 %	50 %	378698571
14530	NC_016810	GTG	2	6	681549	681554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698571
14531	NC_016810	TGC	2	6	681646	681651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698571
14532	NC_016810	ATC	2	6	681723	681728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698571
14533	NC_016810	CGA	2	6	681730	681735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698571
14534	NC_016810	GCG	2	6	681760	681765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698571
14535	NC_016810	AAC	2	6	681789	681794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698571
14536	NC_016810	CAC	2	6	681806	681811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698571
14537	NC_016810	CAA	2	6	681821	681826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698571
14538	NC_016810	AT	3	6	681832	681837	50 %	50 %	0 %	0 %	378698571
14539	NC_016810	CAG	2	6	681939	681944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698572
14540	NC_016810	GCC	2	6	682032	682037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698572
14541	NC_016810	CTG	2	6	682038	682043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698572
14542	NC_016810	TAA	2	6	682044	682049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698572
14543	NC_016810	CTG	3	9	682059	682067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698572
14544	NC_016810	CCGCC	2	10	682085	682094	0 %	0 %	20 %	80 %	378698572
14545	NC_016810	GCGAC	2	10	682097	682106	20 %	0 %	40 %	40 %	378698572
14546	NC_016810	CAG	3	9	682131	682139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698572
14547	NC_016810	AGC	2	6	682150	682155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698572
14548	NC_016810	CGCTTC	2	12	682233	682244	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378698572
14549	NC_016810	CG	4	8	682247	682254	0 %	0 %	50 %	50 %	378698572
14550	NC_016810	GTT	2	6	682305	682310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698572
14551	NC_016810	CG	3	6	682322	682327	0 %	0 %	50 %	50 %	378698572
14552	NC_016810	CGG	3	9	682349	682357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698572
14553	NC_016810	GCG	2	6	682375	682380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698572
14554	NC_016810	GGC	2	6	682403	682408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698572
14555	NC_016810	GGC	2	6	682413	682418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698572
14556	NC_016810	TGC	2	6	682442	682447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698572
14557	NC_016810	CGCC	2	8	682463	682470	0 %	0 %	25 %	75 %	378698572
14558	NC_016810	GCT	2	6	682486	682491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698572
14559	NC_016810	GGC	2	6	682537	682542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698572
14560	NC_016810	GC	3	6	682640	682645	0 %	0 %	50 %	50 %	378698572
14561	NC_016810	GC	3	6	682705	682710	0 %	0 %	50 %	50 %	378698572
14562	NC_016810	CAT	2	6	682785	682790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698572
14563	NC_016810	GCA	2	6	682791	682796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698573
14564	NC_016810	TCAG	2	8	682820	682827	25 %	25 %	25 %	25 %	378698573
14565	NC_016810	CG	3	6	682844	682849	0 %	0 %	50 %	50 %	378698573
14566	NC_016810	CAG	2	6	682873	682878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698573
14567	NC_016810	GCG	2	6	682882	682887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698573
14568	NC_016810	GGC	2	6	682905	682910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698573
14569	NC_016810	CCG	2	6	682929	682934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698573
14570	NC_016810	CAG	2	6	683029	683034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698573
14571	NC_016810	CGG	2	6	683138	683143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698573
14572	NC_016810	CCA	2	6	683175	683180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698573
14573	NC_016810	AGTGG	2	10	683195	683204	20 %	20 %	60 %	0 %	378698573
14574	NC_016810	GC	3	6	683222	683227	0 %	0 %	50 %	50 %	378698573
14575	NC_016810	CTTG	2	8	683231	683238	0 %	50 %	25 %	25 %	378698573
14576	NC_016810	TC	3	6	683239	683244	0 %	50 %	0 %	50 %	378698573
14577	NC_016810	AGC	2	6	683258	683263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698573
14578	NC_016810	CGT	2	6	683277	683282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698573
14579	NC_016810	CAC	2	6	683335	683340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698574
14580	NC_016810	CGGT	2	8	683384	683391	0 %	25 %	50 %	25 %	378698574
14581	NC_016810	GC	3	6	683427	683432	0 %	0 %	50 %	50 %	378698574
14582	NC_016810	GCT	2	6	683471	683476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698574
14583	NC_016810	CAGC	2	8	683487	683494	25 %	0 %	25 %	50 %	378698574
14584	NC_016810	GGT	2	6	683569	683574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698574
14585	NC_016810	GCG	2	6	683613	683618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698574
14586	NC_016810	CGA	2	6	683619	683624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698574
14587	NC_016810	GCC	2	6	683636	683641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698574
14588	NC_016810	CGG	2	6	683646	683651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698574
14589	NC_016810	CCG	2	6	683663	683668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698574
14590	NC_016810	CGC	2	6	683673	683678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698574
14591	NC_016810	GC	3	6	683736	683741	0 %	0 %	50 %	50 %	378698574
14592	NC_016810	ACC	2	6	683747	683752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698574
14593	NC_016810	TGG	2	6	683919	683924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698574
14594	NC_016810	CCG	2	6	684011	684016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698574
14595	NC_016810	CCG	2	6	684072	684077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698574
14596	NC_016810	CAG	2	6	684091	684096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698574
14597	NC_016810	TTTG	2	8	684139	684146	0 %	75 %	25 %	0 %	378698574
14598	NC_016810	CTT	2	6	684156	684161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698574
14599	NC_016810	GATCA	2	10	684172	684181	40 %	20 %	20 %	20 %	378698574
14600	NC_016810	GCA	2	6	684222	684227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698574
14601	NC_016810	CCA	2	6	684270	684275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698574
14602	NC_016810	AGG	2	6	684342	684347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698574
14603	NC_016810	CGC	2	6	684381	684386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698574
14604	NC_016810	CCG	2	6	684407	684412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698574
14605	NC_016810	CAGC	2	8	684435	684442	25 %	0 %	25 %	50 %	378698574
14606	NC_016810	TTC	2	6	684457	684462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698574
14607	NC_016810	ACC	2	6	684503	684508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698574
14608	NC_016810	GCG	2	6	684531	684536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698574
14609	NC_016810	CGC	3	9	684627	684635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698574
14610	NC_016810	GTG	2	6	684643	684648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698574
14611	NC_016810	CGG	2	6	684683	684688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698574
14612	NC_016810	CG	3	6	684723	684728	0 %	0 %	50 %	50 %	378698574
14613	NC_016810	GCT	2	6	684803	684808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698574
14614	NC_016810	T	7	7	684846	684852	0 %	100 %	0 %	0 %	378698574
14615	NC_016810	TTC	2	6	684859	684864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698575
14616	NC_016810	ACG	2	6	684950	684955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698575
14617	NC_016810	GCG	2	6	684971	684976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698575
14618	NC_016810	GCA	2	6	685044	685049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698575
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14620	NC_016810	GTT	2	6	685135	685140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698575
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14988	NC_016810	ATG	2	6	701500	701505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698593
14989	NC_016810	GCC	2	6	701550	701555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698593
14990	NC_016810	GAT	2	6	701565	701570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698593
14991	NC_016810	TCA	2	6	701612	701617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698593
14992	NC_016810	CGC	2	6	701706	701711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698593
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14994	NC_016810	GCCGT	2	10	701746	701755	0 %	20 %	40 %	40 %	378698593
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14999	NC_016810	CCAT	2	8	702110	702117	25 %	25 %	0 %	50 %	378698593
15000	NC_016810	CGAT	2	8	702127	702134	25 %	25 %	25 %	25 %	378698593

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