MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_016810	GGC	2	6	657434	657439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698549
14003	NC_016810	CTG	2	6	657466	657471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698549
14004	NC_016810	CGG	2	6	657497	657502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698549
14005	NC_016810	TAC	2	6	657503	657508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698549
14006	NC_016810	TAC	2	6	657549	657554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698549
14007	NC_016810	GCA	2	6	657565	657570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698549
14008	NC_016810	CGC	2	6	657620	657625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698549
14009	NC_016810	GC	3	6	657652	657657	0 %	0 %	50 %	50 %	378698549
14010	NC_016810	TCTT	2	8	657664	657671	0 %	75 %	0 %	25 %	378698549
14011	NC_016810	GCC	2	6	657764	657769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698549
14012	NC_016810	GGC	2	6	657807	657812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698549
14013	NC_016810	CGG	2	6	657848	657853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698549
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14015	NC_016810	GCC	2	6	657876	657881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698549
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14017	NC_016810	GAC	2	6	658011	658016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698549
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14019	NC_016810	GCC	2	6	658052	658057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698549
14020	NC_016810	GTC	2	6	658069	658074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698549
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14022	NC_016810	CG	3	6	658081	658086	0 %	0 %	50 %	50 %	378698549
14023	NC_016810	GATCT	2	10	658170	658179	20 %	40 %	20 %	20 %	378698549
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14030	NC_016810	CTG	2	6	658332	658337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698549
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14032	NC_016810	TGG	2	6	658360	658365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698549
14033	NC_016810	TGCGT	2	10	658452	658461	0 %	40 %	40 %	20 %	378698549
14034	NC_016810	A	6	6	658494	658499	100 %	0 %	0 %	0 %	378698549
14035	NC_016810	AG	3	6	658546	658551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14043	NC_016810	CAG	2	6	658864	658869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698550
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14057	NC_016810	TGG	2	6	659377	659382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698550
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14086	NC_016810	TGTAA	2	10	660642	660651	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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14090	NC_016810	TC	3	6	660731	660736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14091	NC_016810	ACA	2	6	660753	660758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14120	NC_016810	TAT	2	6	661910	661915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698553
14121	NC_016810	GGT	2	6	662003	662008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698553
14122	NC_016810	AGT	2	6	662010	662015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698553
14123	NC_016810	ATG	2	6	662154	662159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698553
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14126	NC_016810	TTG	2	6	662262	662267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698553
14127	NC_016810	TGCT	2	8	662317	662324	0 %	50 %	25 %	25 %	378698553
14128	NC_016810	TCC	2	6	662356	662361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698553
14129	NC_016810	GCT	2	6	662525	662530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698553
14130	NC_016810	CGG	2	6	662545	662550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698553
14131	NC_016810	GAT	2	6	662618	662623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698553
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14136	NC_016810	TCT	2	6	662743	662748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698553
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14141	NC_016810	TGG	2	6	663098	663103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698554
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14144	NC_016810	TGC	2	6	663120	663125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698554
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14149	NC_016810	GC	3	6	663391	663396	0 %	0 %	50 %	50 %	378698555
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14171	NC_016810	GCCGG	2	10	664215	664224	0 %	0 %	60 %	40 %	378698555
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14193	NC_016810	A	6	6	665267	665272	100 %	0 %	0 %	0 %	378698556
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14233	NC_016810	TAT	2	6	667453	667458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14234	NC_016810	AT	3	6	667472	667477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14235	NC_016810	CTT	2	6	667524	667529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14237	NC_016810	TAT	2	6	667575	667580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698559
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14241	NC_016810	A	6	6	667694	667699	100 %	0 %	0 %	0 %	378698559
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14486	NC_016810	GGC	2	6	679313	679318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14487	NC_016810	ATG	2	6	679334	679339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14488	NC_016810	ATA	2	6	679496	679501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698570
14489	NC_016810	TGCGGC	2	12	679526	679537	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378698570
14490	NC_016810	ATC	2	6	679568	679573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698570
14491	NC_016810	CGA	2	6	679671	679676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698570
14492	NC_016810	C	7	7	679852	679858	0 %	0 %	0 %	100 %	378698570
14493	NC_016810	GCG	2	6	680015	680020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698570
14494	NC_016810	TGGC	2	8	680076	680083	0 %	25 %	50 %	25 %	378698570
14495	NC_016810	GGC	2	6	680118	680123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698570
14496	NC_016810	TCG	2	6	680210	680215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698570
14497	NC_016810	GGC	2	6	680221	680226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698570
14498	NC_016810	CAGC	2	8	680247	680254	25 %	0 %	25 %	50 %	378698570
14499	NC_016810	ATG	2	6	680282	680287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698570
14500	NC_016810	A	6	6	680333	680338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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