MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_016810	GGT	2	6	589984	589989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698488
12503	NC_016810	ATG	2	6	590006	590011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698488
12504	NC_016810	CCGCC	2	10	590067	590076	0 %	0 %	20 %	80 %	378698488
12505	NC_016810	AGAC	2	8	590110	590117	50 %	0 %	25 %	25 %	378698488
12506	NC_016810	AGC	2	6	590134	590139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698488
12507	NC_016810	T	8	8	590207	590214	0 %	100 %	0 %	0 %	378698488
12508	NC_016810	GCA	2	6	590264	590269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698488
12509	NC_016810	GCC	2	6	590338	590343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698488
12510	NC_016810	TTCG	2	8	590352	590359	0 %	50 %	25 %	25 %	378698488
12511	NC_016810	ATA	2	6	590362	590367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698488
12512	NC_016810	CGA	2	6	590430	590435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698488
12513	NC_016810	GGC	2	6	590437	590442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698488
12514	NC_016810	ACG	2	6	590533	590538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_016810	AAAAT	2	10	590571	590580	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_016810	A	7	7	590602	590608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_016810	ATTT	2	8	590619	590626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_016810	TAAA	2	8	590656	590663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_016810	T	6	6	590668	590673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_016810	GTT	2	6	590700	590705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_016810	TAA	2	6	590719	590724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_016810	AT	3	6	590763	590768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_016810	TGCAAT	2	12	590797	590808	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12524	NC_016810	TGCAAT	2	12	590812	590823	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12525	NC_016810	ATT	2	6	590831	590836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_016810	GTT	2	6	590842	590847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_016810	A	6	6	590866	590871	100 %	0 %	0 %	0 %	378698489
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12538	NC_016810	TGA	2	6	591278	591283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698489
12539	NC_016810	TCT	2	6	591284	591289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698489
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12544	NC_016810	GCC	2	6	591676	591681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698489
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12551	NC_016810	GCT	2	6	591888	591893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698489
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12622	NC_016810	GTC	2	6	595065	595070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698492
12623	NC_016810	GCG	2	6	595150	595155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698492
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12626	NC_016810	GGC	3	9	595217	595225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698492
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12631	NC_016810	GC	3	6	595438	595443	0 %	0 %	50 %	50 %	378698492
12632	NC_016810	TGA	2	6	595454	595459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698492
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12642	NC_016810	ACTG	2	8	595833	595840	25 %	25 %	25 %	25 %	378698493
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12988	NC_016810	CAT	2	6	612490	612495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698512
12989	NC_016810	GCA	2	6	612514	612519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698512
12990	NC_016810	TTA	2	6	612561	612566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698512
12991	NC_016810	AAT	2	6	612569	612574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698512
12992	NC_016810	CAGC	2	8	612615	612622	25 %	0 %	25 %	50 %	378698512
12993	NC_016810	ATC	3	9	612632	612640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698512
12994	NC_016810	TATC	2	8	612667	612674	25 %	50 %	0 %	25 %	378698512
12995	NC_016810	TCT	2	6	612675	612680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698512
12996	NC_016810	GGC	2	6	612681	612686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698512
12997	NC_016810	CTG	2	6	612701	612706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698512
12998	NC_016810	ATG	2	6	612729	612734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698512
12999	NC_016810	GCA	2	6	612784	612789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698512
13000	NC_016810	A	7	7	612791	612797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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