MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_016810	GCG	2	6	542088	542093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698445
11503	NC_016810	GCA	2	6	542095	542100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698445
11504	NC_016810	ACG	2	6	542135	542140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698445
11505	NC_016810	GAT	2	6	542162	542167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698445
11506	NC_016810	CGC	2	6	542184	542189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698445
11507	NC_016810	ATT	2	6	542243	542248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698445
11508	NC_016810	ATA	2	6	542253	542258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698445
11509	NC_016810	TTC	2	6	542279	542284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698445
11510	NC_016810	AG	3	6	542302	542307	50 %	0 %	50 %	0 %	378698445
11511	NC_016810	AG	5	10	542356	542365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_016810	TGA	2	6	542397	542402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698446
11513	NC_016810	CAG	2	6	542411	542416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698446
11514	NC_016810	A	6	6	542424	542429	100 %	0 %	0 %	0 %	378698446
11515	NC_016810	GC	3	6	542511	542516	0 %	0 %	50 %	50 %	378698446
11516	NC_016810	GCC	2	6	542523	542528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698446
11517	NC_016810	CTG	2	6	542549	542554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698446
11518	NC_016810	GCG	2	6	542606	542611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698446
11519	NC_016810	CGC	2	6	542612	542617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698446
11520	NC_016810	AGA	2	6	542637	542642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698446
11521	NC_016810	GCC	2	6	542671	542676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698446
11522	NC_016810	GCG	2	6	542810	542815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698447
11523	NC_016810	GTG	2	6	542950	542955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698447
11524	NC_016810	CGC	2	6	543035	543040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698447
11525	NC_016810	GAT	2	6	543058	543063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698447
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11527	NC_016810	GGC	2	6	543229	543234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698447
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11531	NC_016810	TTG	2	6	543396	543401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_016810	TCAG	2	8	543440	543447	25 %	25 %	25 %	25 %	378698448
11533	NC_016810	TGA	2	6	543469	543474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698448
11534	NC_016810	GCG	2	6	543537	543542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698448
11535	NC_016810	TGA	2	6	543674	543679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698448
11536	NC_016810	CGTA	2	8	543827	543834	25 %	25 %	25 %	25 %	378698448
11537	NC_016810	AGGCGA	2	12	543884	543895	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378698448
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11542	NC_016810	GTAC	2	8	544310	544317	25 %	25 %	25 %	25 %	378698448
11543	NC_016810	TGAT	2	8	544384	544391	25 %	50 %	25 %	0 %	378698448
11544	NC_016810	GAC	2	6	544509	544514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698448
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11549	NC_016810	CTA	2	6	544703	544708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698448
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11552	NC_016810	TGC	3	9	544783	544791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698448
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11554	NC_016810	GAT	2	6	544814	544819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698448
11555	NC_016810	GTCG	2	8	544856	544863	0 %	25 %	50 %	25 %	378698448
11556	NC_016810	CGA	2	6	544904	544909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698448
11557	NC_016810	AAG	2	6	544918	544923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698448
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11563	NC_016810	AGCGCC	2	12	545367	545378	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11564	NC_016810	T	6	6	545387	545392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_016810	ATA	2	6	545393	545398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_016810	GGC	2	6	545443	545448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_016810	TGG	2	6	545470	545475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_016810	A	6	6	545494	545499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_016810	TAT	2	6	545534	545539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698449
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11573	NC_016810	CTG	2	6	545772	545777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698449
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11584	NC_016810	GC	3	6	546143	546148	0 %	0 %	50 %	50 %	378698449
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11588	NC_016810	GGC	2	6	546261	546266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11591	NC_016810	CAA	2	6	546374	546379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11592	NC_016810	GGC	2	6	546395	546400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11601	NC_016810	GGAT	2	8	546607	546614	25 %	25 %	50 %	0 %	378698450
11602	NC_016810	CGC	2	6	546622	546627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698450
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11605	NC_016810	TCG	2	6	546766	546771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698450
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11613	NC_016810	A	6	6	547281	547286	100 %	0 %	0 %	0 %	378698450
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11863	NC_016810	GCA	3	9	558896	558904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698459
11864	NC_016810	T	6	6	558935	558940	0 %	100 %	0 %	0 %	378698459
11865	NC_016810	TCT	2	6	558946	558951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698459
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11972	NC_016810	AG	3	6	563495	563500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11973	NC_016810	GGC	2	6	563526	563531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698465
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11981	NC_016810	CCT	2	6	563976	563981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698465
11982	NC_016810	TTG	2	6	563998	564003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698465
11983	NC_016810	CTT	2	6	564015	564020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698465
11984	NC_016810	CG	3	6	564021	564026	0 %	0 %	50 %	50 %	378698465
11985	NC_016810	CAG	2	6	564040	564045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698465
11986	NC_016810	GC	3	6	564128	564133	0 %	0 %	50 %	50 %	378698465
11987	NC_016810	GCG	2	6	564146	564151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698465
11988	NC_016810	ATC	2	6	564152	564157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698465
11989	NC_016810	CTG	2	6	564310	564315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698465
11990	NC_016810	CT	3	6	564365	564370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11991	NC_016810	GC	3	6	564405	564410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11992	NC_016810	CCGGC	2	10	564444	564453	0 %	0 %	40 %	60 %	378698466
11993	NC_016810	CTA	2	6	564548	564553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698466
11994	NC_016810	GCG	2	6	564580	564585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698466
11995	NC_016810	TG	3	6	564687	564692	0 %	50 %	50 %	0 %	378698466
11996	NC_016810	GGC	2	6	564744	564749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698466
11997	NC_016810	GCGCC	2	10	564754	564763	0 %	0 %	40 %	60 %	378698466
11998	NC_016810	TCA	2	6	564797	564802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698466
11999	NC_016810	GC	3	6	564860	564865	0 %	0 %	50 %	50 %	378698466
12000	NC_016810	GAA	2	6	564867	564872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698466

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