MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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85003	NC_016810	TAA	2	6	4017756	4017761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378701679
85004	NC_016810	GTC	2	6	4017769	4017774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701679
85005	NC_016810	CA	3	6	4017775	4017780	50 %	0 %	0 %	50 %	378701679
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85009	NC_016810	CAT	2	6	4017930	4017935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378701679
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85015	NC_016810	GC	4	8	4018117	4018124	0 %	0 %	50 %	50 %	378701679
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85119	NC_016810	CCG	3	9	4022496	4022504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378701683
85120	NC_016810	CCG	2	6	4022528	4022533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378701683
85121	NC_016810	TCC	2	6	4022618	4022623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378701683
85122	NC_016810	GGCGC	2	10	4022624	4022633	0 %	0 %	60 %	40 %	378701683
85123	NC_016810	G	6	6	4022640	4022645	0 %	0 %	100 %	0 %	378701683
85124	NC_016810	ATC	2	6	4022654	4022659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378701683
85125	NC_016810	GC	3	6	4022797	4022802	0 %	0 %	50 %	50 %	378701683
85126	NC_016810	CCA	2	6	4022812	4022817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378701683
85127	NC_016810	TGGC	2	8	4022837	4022844	0 %	25 %	50 %	25 %	378701683
85128	NC_016810	AAT	2	6	4022881	4022886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378701683
85129	NC_016810	GC	3	6	4022941	4022946	0 %	0 %	50 %	50 %	378701683
85130	NC_016810	GC	3	6	4022955	4022960	0 %	0 %	50 %	50 %	378701683
85131	NC_016810	CGTTC	2	10	4023041	4023050	0 %	40 %	20 %	40 %	378701683
85132	NC_016810	CATC	2	8	4023063	4023070	25 %	25 %	0 %	50 %	378701683
85133	NC_016810	GCT	2	6	4023081	4023086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701683
85134	NC_016810	GC	3	6	4023094	4023099	0 %	0 %	50 %	50 %	378701683
85135	NC_016810	GAC	2	6	4023127	4023132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701683
85136	NC_016810	GA	3	6	4023148	4023153	50 %	0 %	50 %	0 %	378701683
85137	NC_016810	ACG	2	6	4023173	4023178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701683
85138	NC_016810	TAA	2	6	4023252	4023257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85139	NC_016810	CTGC	2	8	4023310	4023317	0 %	25 %	25 %	50 %	378701684
85140	NC_016810	GTG	2	6	4023326	4023331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378701684
85141	NC_016810	ATA	2	6	4023334	4023339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378701684
85142	NC_016810	TGA	2	6	4023344	4023349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378701684
85143	NC_016810	CGCCA	2	10	4023430	4023439	20 %	0 %	20 %	60 %	378701684
85144	NC_016810	TGC	2	6	4023521	4023526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701684
85145	NC_016810	CTGT	2	8	4023571	4023578	0 %	50 %	25 %	25 %	378701684
85146	NC_016810	ACG	2	6	4023631	4023636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701684
85147	NC_016810	A	6	6	4023680	4023685	100 %	0 %	0 %	0 %	378701684
85148	NC_016810	ATAG	2	8	4023721	4023728	50 %	25 %	25 %	0 %	378701684
85149	NC_016810	GA	3	6	4023784	4023789	50 %	0 %	50 %	0 %	378701684
85150	NC_016810	CCAG	2	8	4023831	4023838	25 %	0 %	25 %	50 %	378701684
85151	NC_016810	CGA	2	6	4023931	4023936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701684
85152	NC_016810	TTGA	2	8	4024030	4024037	25 %	50 %	25 %	0 %	378701684
85153	NC_016810	GCC	2	6	4024079	4024084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378701684
85154	NC_016810	A	7	7	4024221	4024227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85155	NC_016810	A	6	6	4024235	4024240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85156	NC_016810	CAT	2	6	4024323	4024328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85157	NC_016810	GCT	2	6	4024440	4024445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701685
85158	NC_016810	GAT	2	6	4024536	4024541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378701685
85159	NC_016810	GCC	2	6	4024609	4024614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378701685
85160	NC_016810	ATG	2	6	4024645	4024650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378701685
85161	NC_016810	CGGCG	2	10	4024659	4024668	0 %	0 %	60 %	40 %	378701685
85162	NC_016810	CT	3	6	4024705	4024710	0 %	50 %	0 %	50 %	378701685
85163	NC_016810	TGG	2	6	4024730	4024735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378701685
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85165	NC_016810	CGT	2	6	4024773	4024778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701685
85166	NC_016810	GCT	2	6	4024827	4024832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701685
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85170	NC_016810	GC	3	6	4025067	4025072	0 %	0 %	50 %	50 %	378701685
85171	NC_016810	CTG	2	6	4025116	4025121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701685
85172	NC_016810	CTGAA	2	10	4025153	4025162	40 %	20 %	20 %	20 %	378701685
85173	NC_016810	GCT	2	6	4025190	4025195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701685
85174	NC_016810	ACT	2	6	4025289	4025294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378701685
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85176	NC_016810	GCGG	2	8	4025350	4025357	0 %	0 %	75 %	25 %	378701685
85177	NC_016810	ATATGC	2	12	4025420	4025431	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378701685
85178	NC_016810	CTG	2	6	4025440	4025445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701685
85179	NC_016810	CGG	2	6	4025474	4025479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701685
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85181	NC_016810	TTG	2	6	4025519	4025524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378701685
85182	NC_016810	TGC	2	6	4025531	4025536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701685
85183	NC_016810	CTGG	2	8	4025625	4025632	0 %	25 %	50 %	25 %	378701685
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85187	NC_016810	CTGG	2	8	4025713	4025720	0 %	25 %	50 %	25 %	378701685
85188	NC_016810	ATC	2	6	4025740	4025745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378701685
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85192	NC_016810	GC	3	6	4025928	4025933	0 %	0 %	50 %	50 %	378701686
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85197	NC_016810	GGC	2	6	4026120	4026125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701686
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85200	NC_016810	TTC	2	6	4026228	4026233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378701686
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85207	NC_016810	CGT	2	6	4026551	4026556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701686
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85211	NC_016810	GGC	2	6	4026612	4026617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701686
85212	NC_016810	CGG	2	6	4026763	4026768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701686
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85216	NC_016810	TCAG	2	8	4026985	4026992	25 %	25 %	25 %	25 %	378701686
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85218	NC_016810	ACTC	2	8	4027090	4027097	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85219	NC_016810	GCA	2	6	4027175	4027180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701687
85220	NC_016810	CTC	2	6	4027191	4027196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378701687
85221	NC_016810	GCGA	2	8	4027199	4027206	25 %	0 %	50 %	25 %	378701687
85222	NC_016810	TGC	2	6	4027207	4027212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701687
85223	NC_016810	GCG	2	6	4027241	4027246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701687
85224	NC_016810	AGT	2	6	4027250	4027255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378701687
85225	NC_016810	A	6	6	4027257	4027262	100 %	0 %	0 %	0 %	378701687
85226	NC_016810	CCG	3	9	4027321	4027329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378701687
85227	NC_016810	TAA	2	6	4027338	4027343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378701687
85228	NC_016810	GCC	2	6	4027404	4027409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378701687
85229	NC_016810	CAC	2	6	4027411	4027416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378701687
85230	NC_016810	TCA	2	6	4027429	4027434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378701687
85231	NC_016810	CTG	2	6	4027511	4027516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701687
85232	NC_016810	TTCCG	2	10	4027541	4027550	0 %	40 %	20 %	40 %	378701687
85233	NC_016810	CAA	2	6	4027560	4027565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378701687
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