MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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77002	NC_016810	GCA	2	6	3646925	3646930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701368
77003	NC_016810	ATC	2	6	3647080	3647085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378701368
77004	NC_016810	CGG	2	6	3647124	3647129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701368
77005	NC_016810	CTG	2	6	3647152	3647157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701368
77006	NC_016810	ATG	2	6	3647206	3647211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378701368
77007	NC_016810	GGC	2	6	3647272	3647277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701368
77008	NC_016810	TCA	2	6	3647297	3647302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378701368
77009	NC_016810	CGA	2	6	3647304	3647309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701368
77010	NC_016810	GAAC	2	8	3647322	3647329	50 %	0 %	25 %	25 %	378701368
77011	NC_016810	GAA	2	6	3647335	3647340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378701368
77012	NC_016810	GC	3	6	3647347	3647352	0 %	0 %	50 %	50 %	378701368
77013	NC_016810	GC	3	6	3647355	3647360	0 %	0 %	50 %	50 %	378701368
77014	NC_016810	GGT	2	6	3647364	3647369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378701368
77015	NC_016810	TGG	2	6	3647522	3647527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378701368
77016	NC_016810	GC	3	6	3647596	3647601	0 %	0 %	50 %	50 %	378701369
77017	NC_016810	GGC	2	6	3647607	3647612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701369
77018	NC_016810	AGC	2	6	3647758	3647763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701369
77019	NC_016810	ACG	2	6	3647821	3647826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701369
77020	NC_016810	CG	3	6	3647825	3647830	0 %	0 %	50 %	50 %	378701369
77021	NC_016810	GTG	2	6	3647844	3647849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378701369
77022	NC_016810	ATT	2	6	3647864	3647869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378701369
77023	NC_016810	T	6	6	3647893	3647898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77024	NC_016810	T	8	8	3647902	3647909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77025	NC_016810	CGG	2	6	3647949	3647954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77026	NC_016810	CAA	2	6	3647963	3647968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77027	NC_016810	GCTG	2	8	3647996	3648003	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77028	NC_016810	CAA	2	6	3648084	3648089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77029	NC_016810	GC	3	6	3648169	3648174	0 %	0 %	50 %	50 %	378701370
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77031	NC_016810	CAT	2	6	3648252	3648257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378701370
77032	NC_016810	CCGT	2	8	3648289	3648296	0 %	25 %	25 %	50 %	378701370
77033	NC_016810	TCA	2	6	3648344	3648349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378701370
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77038	NC_016810	CTGG	2	8	3648612	3648619	0 %	25 %	50 %	25 %	378701370
77039	NC_016810	TGG	2	6	3648679	3648684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378701370
77040	NC_016810	CTG	2	6	3648688	3648693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701370
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77050	NC_016810	CGA	2	6	3649145	3649150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701371
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77054	NC_016810	GTG	2	6	3649254	3649259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378701371
77055	NC_016810	GCC	2	6	3649272	3649277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378701371
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77082	NC_016810	ATA	3	9	3650439	3650447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77083	NC_016810	ATTC	2	8	3650489	3650496	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77084	NC_016810	AATA	2	8	3650501	3650508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77085	NC_016810	TGACC	2	10	3650529	3650538	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77086	NC_016810	ATAAA	2	10	3650552	3650561	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77087	NC_016810	TCT	2	6	3650579	3650584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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77089	NC_016810	CT	3	6	3650610	3650615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77090	NC_016810	ATTA	2	8	3650642	3650649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77091	NC_016810	A	6	6	3650671	3650676	100 %	0 %	0 %	0 %	378701372
77092	NC_016810	CTATCG	2	12	3650684	3650695	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378701372
77093	NC_016810	TTA	2	6	3650712	3650717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378701372
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77100	NC_016810	GGC	2	6	3650962	3650967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701372
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77102	NC_016810	GGC	2	6	3650989	3650994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701372
77103	NC_016810	CGA	2	6	3651009	3651014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701372
77104	NC_016810	GGC	2	6	3651016	3651021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701372
77105	NC_016810	CGA	2	6	3651036	3651041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701372
77106	NC_016810	GGC	2	6	3651043	3651048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701372
77107	NC_016810	CGA	2	6	3651069	3651074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701372
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77111	NC_016810	ATG	3	9	3651149	3651157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378701372
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77117	NC_016810	GCG	2	6	3651242	3651247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701372
77118	NC_016810	GCG	2	6	3651275	3651280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701372
77119	NC_016810	CGA	2	6	3651300	3651305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701372
77120	NC_016810	GCG	2	6	3651308	3651313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701372
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77122	NC_016810	GCG	2	6	3651341	3651346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701372
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77124	NC_016810	GCG	2	6	3651374	3651379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701372
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77156	NC_016810	GC	3	6	3652598	3652603	0 %	0 %	50 %	50 %	378701372
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77219	NC_016810	TAC	2	6	3655113	3655118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378701372
77220	NC_016810	GCA	2	6	3655190	3655195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701372
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77223	NC_016810	AGC	2	6	3655229	3655234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701372
77224	NC_016810	TTG	2	6	3655247	3655252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378701372
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77226	NC_016810	ACC	2	6	3655354	3655359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378701372
77227	NC_016810	GTG	3	9	3655360	3655368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378701372
77228	NC_016810	GCA	2	6	3655385	3655390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701372
77229	NC_016810	ACA	2	6	3655406	3655411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378701372
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77467	NC_016810	C	6	6	3666430	3666435	0 %	0 %	0 %	100 %	378701384
77468	NC_016810	GCA	2	6	3666455	3666460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701384
77469	NC_016810	GGC	2	6	3666579	3666584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701384
77470	NC_016810	GCT	2	6	3666590	3666595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701384
77471	NC_016810	TTG	2	6	3666609	3666614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378701384
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77497	NC_016810	CAG	2	6	3667583	3667588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701386
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