MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
75001	NC_016810	ACC	2	6	3549002	3549007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378701259
75002	NC_016810	AGC	2	6	3549008	3549013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701259
75003	NC_016810	TTA	2	6	3549045	3549050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75004	NC_016810	CGG	2	6	3549079	3549084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75005	NC_016810	CTCA	2	8	3549118	3549125	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75006	NC_016810	AG	3	6	3549196	3549201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75007	NC_016810	GGT	2	6	3549214	3549219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75008	NC_016810	CTA	2	6	3549231	3549236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75009	NC_016810	ACA	2	6	3549247	3549252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75010	NC_016810	AATT	2	8	3549266	3549273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75011	NC_016810	ATT	2	6	3549355	3549360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75012	NC_016810	AAT	2	6	3549411	3549416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75013	NC_016810	GTT	2	6	3549417	3549422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75014	NC_016810	AAG	2	6	3549467	3549472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378701260
75015	NC_016810	CTC	2	6	3549496	3549501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378701260
75016	NC_016810	AGA	2	6	3549504	3549509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378701260
75017	NC_016810	ATCA	2	8	3549568	3549575	50 %	25 %	0 %	25 %	378701260
75018	NC_016810	AAATGG	2	12	3549632	3549643	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378701260
75019	NC_016810	CAA	2	6	3549674	3549679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378701260
75020	NC_016810	ACG	2	6	3549722	3549727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701260
75021	NC_016810	GTG	2	6	3549733	3549738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378701260
75022	NC_016810	CTG	2	6	3549778	3549783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701260
75023	NC_016810	CGA	2	6	3549828	3549833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701260
75024	NC_016810	TCC	2	6	3549926	3549931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75025	NC_016810	GTC	2	6	3549932	3549937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75026	NC_016810	CGG	2	6	3549941	3549946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75027	NC_016810	CGC	2	6	3549971	3549976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75028	NC_016810	CAC	2	6	3550021	3550026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75029	NC_016810	ATGA	2	8	3550027	3550034	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75030	NC_016810	A	7	7	3550041	3550047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75031	NC_016810	TTA	2	6	3550065	3550070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75032	NC_016810	T	6	6	3550090	3550095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75033	NC_016810	GCG	2	6	3550104	3550109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75034	NC_016810	A	6	6	3550141	3550146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75035	NC_016810	ATTA	2	8	3550191	3550198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75036	NC_016810	TGA	2	6	3550228	3550233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75037	NC_016810	CGA	2	6	3550267	3550272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75038	NC_016810	TC	3	6	3550327	3550332	0 %	50 %	0 %	50 %	378701261
75039	NC_016810	CGC	2	6	3550345	3550350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378701261
75040	NC_016810	ATCGG	2	10	3550391	3550400	20 %	20 %	40 %	20 %	378701261
75041	NC_016810	TCAG	2	8	3550403	3550410	25 %	25 %	25 %	25 %	378701261
75042	NC_016810	A	6	6	3550454	3550459	100 %	0 %	0 %	0 %	378701261
75043	NC_016810	GCA	2	6	3550509	3550514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701261
75044	NC_016810	CT	3	6	3550695	3550700	0 %	50 %	0 %	50 %	378701262
75045	NC_016810	GTA	2	6	3550789	3550794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378701262
75046	NC_016810	TCG	2	6	3550819	3550824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701262
75047	NC_016810	CAT	2	6	3550859	3550864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378701262
75048	NC_016810	AAG	2	6	3550873	3550878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378701262
75049	NC_016810	CCG	2	6	3550897	3550902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378701262
75050	NC_016810	TCG	2	6	3550921	3550926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75051	NC_016810	CGA	2	6	3550934	3550939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75052	NC_016810	T	6	6	3550962	3550967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75053	NC_016810	GCC	2	6	3550999	3551004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378701263
75054	NC_016810	CTT	2	6	3551014	3551019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378701263
75055	NC_016810	TCA	2	6	3551025	3551030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378701263
75056	NC_016810	CAGG	2	8	3551071	3551078	25 %	0 %	50 %	25 %	378701263
75057	NC_016810	GAAC	2	8	3551080	3551087	50 %	0 %	25 %	25 %	378701263
75058	NC_016810	AGCC	2	8	3551249	3551256	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75059	NC_016810	GACA	2	8	3551266	3551273	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75060	NC_016810	TAC	2	6	3551285	3551290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75061	NC_016810	CAT	2	6	3551295	3551300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75062	NC_016810	A	7	7	3551384	3551390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75063	NC_016810	GCG	3	9	3551491	3551499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701264
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75065	NC_016810	ATC	2	6	3551573	3551578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378701264
75066	NC_016810	CGG	2	6	3551584	3551589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701264
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75068	NC_016810	TGA	2	6	3551676	3551681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378701264
75069	NC_016810	ATC	2	6	3551688	3551693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378701264
75070	NC_016810	TCA	2	6	3551737	3551742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378701264
75071	NC_016810	GCAG	2	8	3551766	3551773	25 %	0 %	50 %	25 %	378701264
75072	NC_016810	GTC	2	6	3551802	3551807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701264
75073	NC_016810	AAAC	2	8	3551827	3551834	75 %	0 %	0 %	25 %	378701264
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75080	NC_016810	CGC	2	6	3552146	3552151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378701264
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75089	NC_016810	CGC	2	6	3552510	3552515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378701264
75090	NC_016810	CTGT	2	8	3552527	3552534	0 %	50 %	25 %	25 %	378701264
75091	NC_016810	ATAAG	2	10	3552615	3552624	60 %	20 %	20 %	0 %	378701264
75092	NC_016810	GGC	2	6	3552676	3552681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701264
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75101	NC_016810	ATA	2	6	3553131	3553136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378701264
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75106	NC_016810	CGG	2	6	3553258	3553263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701264
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75108	NC_016810	GAA	2	6	3553429	3553434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378701265
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75238	NC_016810	GC	3	6	3559721	3559726	0 %	0 %	50 %	50 %	378701269
75239	NC_016810	CTTTG	2	10	3559736	3559745	0 %	60 %	20 %	20 %	378701269
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75242	NC_016810	CG	3	6	3559832	3559837	0 %	0 %	50 %	50 %	378701269
75243	NC_016810	CTG	2	6	3559865	3559870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701269
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75337	NC_016810	TCGCA	2	10	3564340	3564349	20 %	20 %	20 %	40 %	378701273
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75345	NC_016810	AAATA	2	10	3564715	3564724	80 %	20 %	0 %	0 %	378701273
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75353	NC_016810	GCA	2	6	3565079	3565084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701274
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75446	NC_016810	TTAA	2	8	3569430	3569437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75447	NC_016810	TATT	2	8	3569439	3569446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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75471	NC_016810	GC	3	6	3570715	3570720	0 %	0 %	50 %	50 %	378701278
75472	NC_016810	ATT	2	6	3570735	3570740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378701278
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75474	NC_016810	GCTG	2	8	3570893	3570900	0 %	25 %	50 %	25 %	378701278
75475	NC_016810	CGT	2	6	3570978	3570983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701278
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75480	NC_016810	T	6	6	3571322	3571327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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75496	NC_016810	A	6	6	3572365	3572370	100 %	0 %	0 %	0 %	378701280
75497	NC_016810	CGA	2	6	3572412	3572417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701280
75498	NC_016810	ATC	2	6	3572464	3572469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378701280
75499	NC_016810	CGG	5	15	3572478	3572492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701280
75500	NC_016810	AGC	2	6	3572565	3572570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701280

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