MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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73002	NC_016810	GCA	2	6	3457556	3457561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701169
73003	NC_016810	GCG	2	6	3457581	3457586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701169
73004	NC_016810	ACC	2	6	3457598	3457603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378701169
73005	NC_016810	ATC	2	6	3457677	3457682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73006	NC_016810	CTT	2	6	3457738	3457743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378701170
73007	NC_016810	ATCG	2	8	3457793	3457800	25 %	25 %	25 %	25 %	378701170
73008	NC_016810	CGC	2	6	3457857	3457862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378701170
73009	NC_016810	GTT	2	6	3457863	3457868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378701170
73010	NC_016810	AGC	2	6	3457878	3457883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701170
73011	NC_016810	CCT	2	6	3457933	3457938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378701170
73012	NC_016810	ACC	3	9	3458001	3458009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378701170
73013	NC_016810	TGC	2	6	3458013	3458018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701170
73014	NC_016810	ACC	2	6	3458052	3458057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378701170
73015	NC_016810	CGC	2	6	3458081	3458086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378701170
73016	NC_016810	GCA	2	6	3458120	3458125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701170
73017	NC_016810	A	6	6	3458125	3458130	100 %	0 %	0 %	0 %	378701170
73018	NC_016810	GGTC	2	8	3458143	3458150	0 %	25 %	50 %	25 %	378701170
73019	NC_016810	CGGCG	2	10	3458228	3458237	0 %	0 %	60 %	40 %	378701170
73020	NC_016810	GCG	2	6	3458251	3458256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701170
73021	NC_016810	CAG	2	6	3458273	3458278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701170
73022	NC_016810	CCG	2	6	3458283	3458288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378701170
73023	NC_016810	CAT	2	6	3458405	3458410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73024	NC_016810	CCA	2	6	3458436	3458441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73025	NC_016810	GGA	2	6	3458446	3458451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73026	NC_016810	GCA	2	6	3458520	3458525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701171
73027	NC_016810	GGCC	2	8	3458537	3458544	0 %	0 %	50 %	50 %	378701171
73028	NC_016810	TCA	2	6	3458551	3458556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378701171
73029	NC_016810	A	7	7	3458591	3458597	100 %	0 %	0 %	0 %	378701171
73030	NC_016810	TGA	2	6	3458630	3458635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378701171
73031	NC_016810	CGA	2	6	3458645	3458650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701171
73032	NC_016810	GCG	2	6	3458698	3458703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701171
73033	NC_016810	GTT	2	6	3458780	3458785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378701171
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73037	NC_016810	GTC	3	9	3458883	3458891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701171
73038	NC_016810	GAC	2	6	3458925	3458930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701171
73039	NC_016810	CTG	2	6	3458961	3458966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701171
73040	NC_016810	T	6	6	3458994	3458999	0 %	100 %	0 %	0 %	378701172
73041	NC_016810	AATTT	2	10	3459025	3459034	40 %	60 %	0 %	0 %	378701172
73042	NC_016810	GCA	2	6	3459065	3459070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701172
73043	NC_016810	CGA	2	6	3459088	3459093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701172
73044	NC_016810	CG	3	6	3459106	3459111	0 %	0 %	50 %	50 %	378701172
73045	NC_016810	CGC	2	6	3459161	3459166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378701172
73046	NC_016810	GC	3	6	3459171	3459176	0 %	0 %	50 %	50 %	378701172
73047	NC_016810	GC	3	6	3459215	3459220	0 %	0 %	50 %	50 %	378701172
73048	NC_016810	ATC	2	6	3459252	3459257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378701172
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73050	NC_016810	CAC	2	6	3459348	3459353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378701172
73051	NC_016810	GTT	2	6	3459356	3459361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378701172
73052	NC_016810	GCCA	2	8	3459364	3459371	25 %	0 %	25 %	50 %	378701172
73053	NC_016810	GT	3	6	3459389	3459394	0 %	50 %	50 %	0 %	378701172
73054	NC_016810	GTATCT	2	12	3459462	3459473	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378701173
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73056	NC_016810	CGT	2	6	3459526	3459531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701173
73057	NC_016810	GCA	2	6	3459537	3459542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701173
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73059	NC_016810	TCGC	2	8	3459618	3459625	0 %	25 %	25 %	50 %	378701173
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73063	NC_016810	CCG	2	6	3459922	3459927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378701174
73064	NC_016810	GC	3	6	3459974	3459979	0 %	0 %	50 %	50 %	378701174
73065	NC_016810	GCG	2	6	3460015	3460020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701174
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73069	NC_016810	GCTTC	2	10	3460156	3460165	0 %	40 %	20 %	40 %	378701174
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73071	NC_016810	GCA	3	9	3460314	3460322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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73074	NC_016810	CTG	2	6	3460513	3460518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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73078	NC_016810	CAA	2	6	3460831	3460836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73079	NC_016810	ATT	2	6	3460858	3460863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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73082	NC_016810	CTGCC	2	10	3460989	3460998	0 %	20 %	20 %	60 %	378701175
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73084	NC_016810	A	8	8	3461108	3461115	100 %	0 %	0 %	0 %	378701175
73085	NC_016810	CGC	2	6	3461149	3461154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378701175
73086	NC_016810	GC	3	6	3461211	3461216	0 %	0 %	50 %	50 %	378701175
73087	NC_016810	GGC	2	6	3461226	3461231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378701175
73088	NC_016810	CAAC	2	8	3461336	3461343	50 %	0 %	0 %	50 %	378701175
73089	NC_016810	GTA	2	6	3461389	3461394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378701175
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73091	NC_016810	GCT	2	6	3461501	3461506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378701175
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73093	NC_016810	CGCC	2	8	3461558	3461565	0 %	0 %	25 %	75 %	378701175
73094	NC_016810	GCA	2	6	3461580	3461585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701175
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73100	NC_016810	GCC	2	6	3461795	3461800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378701175
73101	NC_016810	CGAT	2	8	3461849	3461856	25 %	25 %	25 %	25 %	378701175
73102	NC_016810	GCC	2	6	3461866	3461871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378701175
73103	NC_016810	TGGA	2	8	3461899	3461906	25 %	25 %	50 %	0 %	378701175
73104	NC_016810	GAG	2	6	3461974	3461979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73105	NC_016810	TTA	2	6	3462008	3462013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378701176
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73107	NC_016810	AGC	2	6	3462060	3462065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701176
73108	NC_016810	GCA	2	6	3462097	3462102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378701176
73109	NC_016810	CG	3	6	3462108	3462113	0 %	0 %	50 %	50 %	378701176
73110	NC_016810	CTGG	2	8	3462128	3462135	0 %	25 %	50 %	25 %	378701176
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73345	NC_016810	TCAT	2	8	3472232	3472239	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73346	NC_016810	CAA	2	6	3472242	3472247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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