MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
68001	NC_016810	T	6	6	3216127	3216132	0 %	100 %	0 %	0 %	378700943
68002	NC_016810	GTT	2	6	3216303	3216308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378700944
68003	NC_016810	TTCTGC	2	12	3216387	3216398	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378700944
68004	NC_016810	TCC	2	6	3216428	3216433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378700944
68005	NC_016810	A	8	8	3216481	3216488	100 %	0 %	0 %	0 %	378700944
68006	NC_016810	TG	3	6	3216493	3216498	0 %	50 %	50 %	0 %	378700944
68007	NC_016810	CCT	2	6	3216507	3216512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68008	NC_016810	A	6	6	3216580	3216585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68009	NC_016810	A	6	6	3216684	3216689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68010	NC_016810	CAT	2	6	3216764	3216769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68011	NC_016810	CG	3	6	3216830	3216835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68012	NC_016810	GGT	2	6	3216878	3216883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68013	NC_016810	CGA	2	6	3216937	3216942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68014	NC_016810	AGCC	2	8	3217011	3217018	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68015	NC_016810	A	6	6	3217050	3217055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68016	NC_016810	ATG	2	6	3217075	3217080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68017	NC_016810	ATC	3	9	3217093	3217101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68018	NC_016810	GGTAAA	2	12	3217168	3217179	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68019	NC_016810	A	6	6	3217177	3217182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68020	NC_016810	GAT	2	6	3217203	3217208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700945
68021	NC_016810	A	6	6	3217316	3217321	100 %	0 %	0 %	0 %	378700945
68022	NC_016810	CGC	2	6	3217575	3217580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700945
68023	NC_016810	GCC	2	6	3217601	3217606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700945
68024	NC_016810	CTT	2	6	3217611	3217616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378700945
68025	NC_016810	CGC	2	6	3217629	3217634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700945
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68029	NC_016810	CATC	2	8	3217746	3217753	25 %	25 %	0 %	50 %	378700945
68030	NC_016810	AAAT	2	8	3217760	3217767	75 %	25 %	0 %	0 %	378700945
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68033	NC_016810	A	6	6	3217812	3217817	100 %	0 %	0 %	0 %	378700945
68034	NC_016810	ATG	2	6	3217889	3217894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700945
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68038	NC_016810	TGC	2	6	3217994	3217999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700945
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68040	NC_016810	AGA	2	6	3218128	3218133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68041	NC_016810	GCG	2	6	3218318	3218323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700946
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68052	NC_016810	GCA	2	6	3218734	3218739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700946
68053	NC_016810	TTG	2	6	3218744	3218749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378700946
68054	NC_016810	GC	3	6	3218887	3218892	0 %	0 %	50 %	50 %	378700946
68055	NC_016810	CGC	2	6	3218912	3218917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700946
68056	NC_016810	CAG	3	9	3218979	3218987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700946
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68058	NC_016810	GAT	3	9	3219136	3219144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68059	NC_016810	ATA	2	6	3219169	3219174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68060	NC_016810	CTTT	2	8	3219233	3219240	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68061	NC_016810	TGGCC	2	10	3219273	3219282	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
68062	NC_016810	TGC	2	6	3219284	3219289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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68087	NC_016810	GC	3	6	3220959	3220964	0 %	0 %	50 %	50 %	378700948
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68090	NC_016810	CTT	2	6	3221112	3221117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378700948
68091	NC_016810	ATC	2	6	3221148	3221153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700948
68092	NC_016810	GC	3	6	3221154	3221159	0 %	0 %	50 %	50 %	378700948
68093	NC_016810	GCC	2	6	3221178	3221183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700948
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68118	NC_016810	CGA	2	6	3222362	3222367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68119	NC_016810	GC	4	8	3222404	3222411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68120	NC_016810	GTTC	2	8	3222416	3222423	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68121	NC_016810	CTT	2	6	3222455	3222460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68122	NC_016810	GTT	2	6	3222651	3222656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68123	NC_016810	ATC	2	6	3222684	3222689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700950
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68149	NC_016810	CG	3	6	3224018	3224023	0 %	0 %	50 %	50 %	378700950
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68177	NC_016810	TGA	2	6	3225167	3225172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700952
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68227	NC_016810	CG	3	6	3228373	3228378	0 %	0 %	50 %	50 %	378700956
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68229	NC_016810	CGT	2	6	3228457	3228462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700956
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68232	NC_016810	GCC	2	6	3228706	3228711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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68469	NC_016810	ATG	2	6	3240721	3240726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700966
68470	NC_016810	CCT	2	6	3240746	3240751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378700966
68471	NC_016810	CGC	2	6	3240974	3240979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700966
68472	NC_016810	AGG	2	6	3240998	3241003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378700966
68473	NC_016810	GC	4	8	3241008	3241015	0 %	0 %	50 %	50 %	378700966
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68475	NC_016810	CG	3	6	3241089	3241094	0 %	0 %	50 %	50 %	378700966
68476	NC_016810	GC	3	6	3241106	3241111	0 %	0 %	50 %	50 %	378700966
68477	NC_016810	CGGCG	2	10	3241121	3241130	0 %	0 %	60 %	40 %	378700966
68478	NC_016810	CAGT	2	8	3241189	3241196	25 %	25 %	25 %	25 %	378700966
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68481	NC_016810	CCG	2	6	3241427	3241432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700966
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68484	NC_016810	GCG	2	6	3241609	3241614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68485	NC_016810	CTG	2	6	3241665	3241670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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68500	NC_016810	GGA	2	6	3242299	3242304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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