MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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65350	NC_016810	GGC	2	6	3090697	3090702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700837
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65356	NC_016810	GCA	2	6	3090960	3090965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700837
65357	NC_016810	GC	4	8	3091000	3091007	0 %	0 %	50 %	50 %	378700837
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65451	NC_016810	T	6	6	3095067	3095072	0 %	100 %	0 %	0 %	378700844
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65461	NC_016810	GCG	2	6	3095610	3095615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700845
65462	NC_016810	GTCG	2	8	3095673	3095680	0 %	25 %	50 %	25 %	378700845
65463	NC_016810	GCCC	2	8	3095691	3095698	0 %	0 %	25 %	75 %	378700845
65464	NC_016810	CCA	2	6	3095754	3095759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378700845
65465	NC_016810	TTG	2	6	3095807	3095812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378700845
65466	NC_016810	CG	4	8	3095843	3095850	0 %	0 %	50 %	50 %	378700845
65467	NC_016810	CGT	2	6	3095874	3095879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700845
65468	NC_016810	CCAT	2	8	3095910	3095917	25 %	25 %	0 %	50 %	378700845
65469	NC_016810	GCC	2	6	3095963	3095968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700845
65470	NC_016810	AGC	2	6	3095969	3095974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700845
65471	NC_016810	CGC	2	6	3095979	3095984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700845
65472	NC_016810	GTC	2	6	3095998	3096003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700845
65473	NC_016810	CTT	3	9	3096039	3096047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378700845
65474	NC_016810	GCA	2	6	3096099	3096104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700845
65475	NC_016810	GCG	2	6	3096299	3096304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700845
65476	NC_016810	TTG	2	6	3096437	3096442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378700845
65477	NC_016810	CCA	3	9	3096447	3096455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378700845
65478	NC_016810	CG	3	6	3096521	3096526	0 %	0 %	50 %	50 %	378700845
65479	NC_016810	ATA	2	6	3096611	3096616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378700845
65480	NC_016810	CAG	2	6	3096700	3096705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700845
65481	NC_016810	AGAGA	2	10	3096758	3096767	60 %	0 %	40 %	0 %	378700845
65482	NC_016810	GCA	2	6	3096798	3096803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700845
65483	NC_016810	TCA	2	6	3096830	3096835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700845
65484	NC_016810	A	6	6	3096851	3096856	100 %	0 %	0 %	0 %	378700845
65485	NC_016810	GCA	2	6	3096858	3096863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700845
65486	NC_016810	ATC	2	6	3096884	3096889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700845
65487	NC_016810	CGC	2	6	3096900	3096905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700845
65488	NC_016810	TGT	2	6	3096920	3096925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378700845
65489	NC_016810	GGC	2	6	3096943	3096948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65490	NC_016810	T	6	6	3096970	3096975	0 %	100 %	0 %	0 %	378700846
65491	NC_016810	ATC	2	6	3097007	3097012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700846
65492	NC_016810	TGG	2	6	3097029	3097034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378700846
65493	NC_016810	T	7	7	3097137	3097143	0 %	100 %	0 %	0 %	378700846
65494	NC_016810	CCA	2	6	3097182	3097187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378700846
65495	NC_016810	TCA	2	6	3097188	3097193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700846
65496	NC_016810	CAG	2	6	3097224	3097229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700846
65497	NC_016810	CGATGT	2	12	3097245	3097256	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378700846
65498	NC_016810	CCAG	2	8	3097260	3097267	25 %	0 %	25 %	50 %	378700846
65499	NC_016810	TTA	2	6	3097331	3097336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378700846
65500	NC_016810	GCC	2	6	3097459	3097464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700846

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