MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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59002	NC_016810	CGA	2	6	2789111	2789116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700552
59003	NC_016810	GTT	2	6	2789159	2789164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378700552
59004	NC_016810	AGA	2	6	2789300	2789305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378700552
59005	NC_016810	GCA	2	6	2789380	2789385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700552
59006	NC_016810	CGA	2	6	2789389	2789394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700552
59007	NC_016810	GGT	2	6	2789417	2789422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378700552
59008	NC_016810	GCTG	2	8	2789464	2789471	0 %	25 %	50 %	25 %	378700552
59009	NC_016810	GC	4	8	2789601	2789608	0 %	0 %	50 %	50 %	378700553
59010	NC_016810	CGC	2	6	2789643	2789648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700553
59011	NC_016810	CTGC	2	8	2789657	2789664	0 %	25 %	25 %	50 %	378700553
59012	NC_016810	TG	3	6	2789683	2789688	0 %	50 %	50 %	0 %	378700553
59013	NC_016810	CCGG	2	8	2789767	2789774	0 %	0 %	50 %	50 %	378700553
59014	NC_016810	GCC	2	6	2789828	2789833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700553
59015	NC_016810	GC	3	6	2789910	2789915	0 %	0 %	50 %	50 %	378700553
59016	NC_016810	CGCC	2	8	2789932	2789939	0 %	0 %	25 %	75 %	378700553
59017	NC_016810	CCG	2	6	2789946	2789951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700553
59018	NC_016810	TAT	2	6	2789957	2789962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378700553
59019	NC_016810	ATC	2	6	2790019	2790024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700553
59020	NC_016810	CCG	2	6	2790103	2790108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700553
59021	NC_016810	GTT	2	6	2790122	2790127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378700553
59022	NC_016810	GGC	2	6	2790149	2790154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700553
59023	NC_016810	ATCG	2	8	2790331	2790338	25 %	25 %	25 %	25 %	378700554
59024	NC_016810	CG	3	6	2790368	2790373	0 %	0 %	50 %	50 %	378700554
59025	NC_016810	TGA	2	6	2790381	2790386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700554
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59027	NC_016810	GCGG	2	8	2790401	2790408	0 %	0 %	75 %	25 %	378700554
59028	NC_016810	CGCC	2	8	2790435	2790442	0 %	0 %	25 %	75 %	378700554
59029	NC_016810	TGGCC	2	10	2790465	2790474	0 %	20 %	40 %	40 %	378700554
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59032	NC_016810	CTG	2	6	2790653	2790658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700554
59033	NC_016810	CTC	2	6	2790677	2790682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378700554
59034	NC_016810	TCCCG	2	10	2790715	2790724	0 %	20 %	20 %	60 %	378700554
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59037	NC_016810	GC	3	6	2790878	2790883	0 %	0 %	50 %	50 %	378700554
59038	NC_016810	CGCC	2	8	2790931	2790938	0 %	0 %	25 %	75 %	378700554
59039	NC_016810	CCG	2	6	2790948	2790953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700554
59040	NC_016810	GC	3	6	2791072	2791077	0 %	0 %	50 %	50 %	378700554
59041	NC_016810	CTG	2	6	2791082	2791087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700554
59042	NC_016810	T	6	6	2791110	2791115	0 %	100 %	0 %	0 %	378700554
59043	NC_016810	CCG	2	6	2791116	2791121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700554
59044	NC_016810	TGA	2	6	2791164	2791169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700554
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59046	NC_016810	GCGCC	2	10	2791182	2791191	0 %	0 %	40 %	60 %	378700554
59047	NC_016810	CCTG	2	8	2791257	2791264	0 %	25 %	25 %	50 %	378700554
59048	NC_016810	TG	3	6	2791317	2791322	0 %	50 %	50 %	0 %	378700554
59049	NC_016810	CAG	2	6	2791330	2791335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700554
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59051	NC_016810	GCG	2	6	2791509	2791514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700554
59052	NC_016810	AGG	2	6	2791527	2791532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378700554
59053	NC_016810	TGG	2	6	2791608	2791613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378700554
59054	NC_016810	GCC	2	6	2791724	2791729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700554
59055	NC_016810	ACA	2	6	2791936	2791941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378700554
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59057	NC_016810	GC	3	6	2792034	2792039	0 %	0 %	50 %	50 %	378700554
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59062	NC_016810	GC	3	6	2792168	2792173	0 %	0 %	50 %	50 %	378700554
59063	NC_016810	GC	3	6	2792220	2792225	0 %	0 %	50 %	50 %	378700554
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59070	NC_016810	GGGTT	2	10	2792750	2792759	0 %	40 %	60 %	0 %	378700554
59071	NC_016810	ATTG	2	8	2792782	2792789	25 %	50 %	25 %	0 %	378700554
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59087	NC_016810	GTG	2	6	2793651	2793656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378700555
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59244	NC_016810	CGG	2	6	2802336	2802341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59245	NC_016810	GTT	2	6	2802352	2802357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59246	NC_016810	GTG	2	6	2802366	2802371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59247	NC_016810	TTA	2	6	2802387	2802392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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59351	NC_016810	CG	3	6	2807703	2807708	0 %	0 %	50 %	50 %	378700562
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59354	NC_016810	T	7	7	2807850	2807856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59355	NC_016810	CTT	2	6	2807947	2807952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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59357	NC_016810	CA	3	6	2808014	2808019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59358	NC_016810	CCA	2	6	2808235	2808240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378700563
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59362	NC_016810	TCG	2	6	2808397	2808402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700563
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59368	NC_016810	AAG	2	6	2808614	2808619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59369	NC_016810	T	6	6	2808640	2808645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59370	NC_016810	A	6	6	2808655	2808660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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59480	NC_016810	CTG	2	6	2814404	2814409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700569
59481	NC_016810	CTG	2	6	2814425	2814430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700569
59482	NC_016810	ACG	2	6	2814492	2814497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700569
59483	NC_016810	TGA	2	6	2814532	2814537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700569
59484	NC_016810	GAA	2	6	2814596	2814601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378700569
59485	NC_016810	TAC	2	6	2814636	2814641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700569
59486	NC_016810	CG	3	6	2814680	2814685	0 %	0 %	50 %	50 %	378700569
59487	NC_016810	TGA	2	6	2814711	2814716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700569
59488	NC_016810	AT	3	6	2814775	2814780	50 %	50 %	0 %	0 %	378700569
59489	NC_016810	GGT	2	6	2814851	2814856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378700569
59490	NC_016810	CGG	2	6	2814880	2814885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700569
59491	NC_016810	A	6	6	2815217	2815222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59492	NC_016810	CTT	2	6	2815245	2815250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59493	NC_016810	AACA	2	8	2815316	2815323	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59494	NC_016810	AAC	2	6	2815340	2815345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59495	NC_016810	GCC	2	6	2815395	2815400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700570
59496	NC_016810	GGT	2	6	2815453	2815458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378700570
59497	NC_016810	CCG	2	6	2815536	2815541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700570
59498	NC_016810	TCA	2	6	2815543	2815548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700570
59499	NC_016810	TCT	2	6	2815585	2815590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378700570
59500	NC_016810	TCT	2	6	2815627	2815632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378700570

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