MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57501	NC_016810	GAATA	2	10	2715235	2715244	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57502	NC_016810	GTC	2	6	2715273	2715278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57503	NC_016810	GCA	2	6	2715415	2715420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700472
57504	NC_016810	GGC	2	6	2715424	2715429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700472
57505	NC_016810	CCGTTC	2	12	2715549	2715560	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378700472
57506	NC_016810	CGA	2	6	2715577	2715582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700472
57507	NC_016810	ATTA	2	8	2715607	2715614	50 %	50 %	0 %	0 %	378700472
57508	NC_016810	GGC	2	6	2715625	2715630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700472
57509	NC_016810	CACGC	2	10	2715635	2715644	20 %	0 %	20 %	60 %	378700472
57510	NC_016810	GAA	2	6	2715659	2715664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378700472
57511	NC_016810	TGC	2	6	2715687	2715692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700472
57512	NC_016810	CGCC	2	8	2715697	2715704	0 %	0 %	25 %	75 %	378700472
57513	NC_016810	TGG	2	6	2715738	2715743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378700472
57514	NC_016810	GGT	2	6	2715787	2715792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378700472
57515	NC_016810	CTG	2	6	2715812	2715817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700472
57516	NC_016810	GGA	2	6	2715841	2715846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378700472
57517	NC_016810	CTG	3	9	2715848	2715856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700472
57518	NC_016810	GGC	2	6	2715895	2715900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700472
57519	NC_016810	GCA	2	6	2715964	2715969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700472
57520	NC_016810	GC	3	6	2715970	2715975	0 %	0 %	50 %	50 %	378700472
57521	NC_016810	CTGT	2	8	2715982	2715989	0 %	50 %	25 %	25 %	378700472
57522	NC_016810	ATG	2	6	2716049	2716054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700472
57523	NC_016810	ACA	2	6	2716084	2716089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378700472
57524	NC_016810	A	7	7	2716138	2716144	100 %	0 %	0 %	0 %	378700472
57525	NC_016810	AGA	2	6	2716176	2716181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57526	NC_016810	CTT	2	6	2716200	2716205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378700473
57527	NC_016810	GTG	2	6	2716345	2716350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378700473
57528	NC_016810	TTC	2	6	2716376	2716381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378700473
57529	NC_016810	TCA	2	6	2716389	2716394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700473
57530	NC_016810	CTGG	2	8	2716420	2716427	0 %	25 %	50 %	25 %	378700473
57531	NC_016810	TCA	2	6	2716445	2716450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700473
57532	NC_016810	CCG	2	6	2716496	2716501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700473
57533	NC_016810	GCT	2	6	2716550	2716555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700473
57534	NC_016810	TTC	2	6	2716556	2716561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378700473
57535	NC_016810	ATA	3	9	2716569	2716577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378700473
57536	NC_016810	CTGG	2	8	2716651	2716658	0 %	25 %	50 %	25 %	378700473
57537	NC_016810	ATA	2	6	2716697	2716702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378700473
57538	NC_016810	ATC	2	6	2716811	2716816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700473
57539	NC_016810	GCA	2	6	2716833	2716838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700473
57540	NC_016810	TCA	2	6	2716919	2716924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700473
57541	NC_016810	CGTTTC	2	12	2716960	2716971	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378700473
57542	NC_016810	ACAA	2	8	2716973	2716980	75 %	0 %	0 %	25 %	378700473
57543	NC_016810	GCCA	2	8	2717013	2717020	25 %	0 %	25 %	50 %	378700473
57544	NC_016810	CGT	2	6	2717034	2717039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700473
57545	NC_016810	CAG	2	6	2717050	2717055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700473
57546	NC_016810	TTA	2	6	2717120	2717125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57547	NC_016810	T	6	6	2717164	2717169	0 %	100 %	0 %	0 %	378700474
57548	NC_016810	AAAT	2	8	2717217	2717224	75 %	25 %	0 %	0 %	378700474
57549	NC_016810	GACGT	2	10	2717261	2717270	20 %	20 %	40 %	20 %	378700474
57550	NC_016810	CTGG	2	8	2717350	2717357	0 %	25 %	50 %	25 %	378700474
57551	NC_016810	GAA	2	6	2717443	2717448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378700474
57552	NC_016810	CAG	3	9	2717452	2717460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700474
57553	NC_016810	TAT	2	6	2717499	2717504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378700474
57554	NC_016810	GCC	2	6	2717506	2717511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700474
57555	NC_016810	CAG	2	6	2717680	2717685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700474
57556	NC_016810	TCC	2	6	2717746	2717751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378700474
57557	NC_016810	GC	3	6	2717766	2717771	0 %	0 %	50 %	50 %	378700474
57558	NC_016810	ACC	2	6	2717801	2717806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378700474
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57560	NC_016810	CAT	2	6	2717844	2717849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700474
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57562	NC_016810	CCG	2	6	2718089	2718094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700474
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57566	NC_016810	A	7	7	2718363	2718369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57567	NC_016810	T	6	6	2718394	2718399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57568	NC_016810	AAC	2	6	2718453	2718458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378700475
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57570	NC_016810	TG	3	6	2718477	2718482	0 %	50 %	50 %	0 %	378700475
57571	NC_016810	CAT	2	6	2718531	2718536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700475
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57577	NC_016810	AAT	2	6	2718652	2718657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378700475
57578	NC_016810	A	6	6	2718667	2718672	100 %	0 %	0 %	0 %	378700475
57579	NC_016810	CTT	2	6	2718686	2718691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378700475
57580	NC_016810	CT	3	6	2719021	2719026	0 %	50 %	0 %	50 %	378700475
57581	NC_016810	ATC	2	6	2719040	2719045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700475
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57584	NC_016810	CGCT	2	8	2719157	2719164	0 %	25 %	25 %	50 %	378700475
57585	NC_016810	CTGC	2	8	2719279	2719286	0 %	25 %	25 %	50 %	378700475
57586	NC_016810	GCCC	2	8	2719371	2719378	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57587	NC_016810	TGT	2	6	2719385	2719390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57588	NC_016810	A	6	6	2719425	2719430	100 %	0 %	0 %	0 %	378700476
57589	NC_016810	GT	3	6	2719526	2719531	0 %	50 %	50 %	0 %	378700476
57590	NC_016810	GAA	2	6	2719614	2719619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378700476
57591	NC_016810	CAA	2	6	2719690	2719695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57592	NC_016810	AT	3	6	2719728	2719733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57593	NC_016810	CGC	2	6	2719761	2719766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57594	NC_016810	CATG	2	8	2719835	2719842	25 %	25 %	25 %	25 %	378700477
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57597	NC_016810	CG	3	6	2720164	2720169	0 %	0 %	50 %	50 %	378700478
57598	NC_016810	TTTCA	2	10	2720186	2720195	20 %	60 %	0 %	20 %	378700478
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57601	NC_016810	GCC	2	6	2720343	2720348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700478
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57605	NC_016810	GCC	3	9	2720514	2720522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700478
57606	NC_016810	GC	3	6	2720525	2720530	0 %	0 %	50 %	50 %	378700478
57607	NC_016810	GGT	2	6	2720582	2720587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378700478
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57612	NC_016810	CCGGAT	2	12	2720809	2720820	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378700478
57613	NC_016810	CG	3	6	2720830	2720835	0 %	0 %	50 %	50 %	378700478
57614	NC_016810	TCTT	2	8	2720906	2720913	0 %	75 %	0 %	25 %	378700479
57615	NC_016810	GTT	2	6	2721088	2721093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378700479
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57618	NC_016810	CGC	2	6	2721165	2721170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700479
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