MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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56502	NC_016810	GCT	2	6	2668236	2668241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700433
56503	NC_016810	CCA	2	6	2668349	2668354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378700433
56504	NC_016810	T	6	6	2668458	2668463	0 %	100 %	0 %	0 %	378700433
56505	NC_016810	GCG	2	6	2668498	2668503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700433
56506	NC_016810	TCG	2	6	2668513	2668518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700433
56507	NC_016810	GGT	2	6	2668536	2668541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378700433
56508	NC_016810	GGC	2	6	2668569	2668574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700433
56509	NC_016810	CGA	2	6	2668630	2668635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700433
56510	NC_016810	GAC	2	6	2668643	2668648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700433
56511	NC_016810	CAG	2	6	2668659	2668664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700433
56512	NC_016810	GCG	2	6	2668688	2668693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700433
56513	NC_016810	CTT	2	6	2668700	2668705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378700433
56514	NC_016810	CTGG	2	8	2668710	2668717	0 %	25 %	50 %	25 %	378700433
56515	NC_016810	CACT	2	8	2668721	2668728	25 %	25 %	0 %	50 %	378700433
56516	NC_016810	CAC	2	6	2668730	2668735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378700433
56517	NC_016810	CGC	2	6	2668824	2668829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700433
56518	NC_016810	GC	3	6	2668889	2668894	0 %	0 %	50 %	50 %	378700433
56519	NC_016810	T	6	6	2668952	2668957	0 %	100 %	0 %	0 %	378700433
56520	NC_016810	GCA	2	6	2669021	2669026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700433
56521	NC_016810	GGCT	2	8	2669116	2669123	0 %	25 %	50 %	25 %	378700433
56522	NC_016810	GAC	2	6	2669124	2669129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700433
56523	NC_016810	CG	3	6	2669255	2669260	0 %	0 %	50 %	50 %	378700433
56524	NC_016810	TGCT	2	8	2669278	2669285	0 %	50 %	25 %	25 %	378700433
56525	NC_016810	GC	3	6	2669294	2669299	0 %	0 %	50 %	50 %	378700433
56526	NC_016810	AGC	2	6	2669347	2669352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700433
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56528	NC_016810	GCC	2	6	2669386	2669391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700433
56529	NC_016810	TCG	2	6	2669432	2669437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700433
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56531	NC_016810	GCGCC	2	10	2669492	2669501	0 %	0 %	40 %	60 %	378700433
56532	NC_016810	AAC	2	6	2669578	2669583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378700433
56533	NC_016810	CGCC	2	8	2669639	2669646	0 %	0 %	25 %	75 %	378700433
56534	NC_016810	GCA	3	9	2669675	2669683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700433
56535	NC_016810	GC	3	6	2669700	2669705	0 %	0 %	50 %	50 %	378700433
56536	NC_016810	CAG	2	6	2669751	2669756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700433
56537	NC_016810	AG	4	8	2669775	2669782	50 %	0 %	50 %	0 %	378700433
56538	NC_016810	AGC	2	6	2669908	2669913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700433
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56540	NC_016810	T	6	6	2669966	2669971	0 %	100 %	0 %	0 %	378700433
56541	NC_016810	CGG	2	6	2670011	2670016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700433
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56544	NC_016810	TGC	2	6	2670256	2670261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700433
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56546	NC_016810	GTT	2	6	2670351	2670356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378700433
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56549	NC_016810	TGA	2	6	2670451	2670456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56550	NC_016810	TGA	2	6	2670501	2670506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56551	NC_016810	GCCA	2	8	2670537	2670544	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56552	NC_016810	ACC	2	6	2670625	2670630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378700434
56553	NC_016810	T	6	6	2670634	2670639	0 %	100 %	0 %	0 %	378700434
56554	NC_016810	CGC	2	6	2670642	2670647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700434
56555	NC_016810	TGA	2	6	2670669	2670674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700434
56556	NC_016810	GCC	2	6	2670708	2670713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700434
56557	NC_016810	GGCG	2	8	2670735	2670742	0 %	0 %	75 %	25 %	378700434
56558	NC_016810	T	6	6	2670775	2670780	0 %	100 %	0 %	0 %	378700434
56559	NC_016810	ATG	2	6	2670823	2670828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700434
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56561	NC_016810	TGG	2	6	2670934	2670939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378700434
56562	NC_016810	TGC	2	6	2670941	2670946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700434
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56564	NC_016810	CGA	2	6	2671005	2671010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700434
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56569	NC_016810	CG	3	6	2671140	2671145	0 %	0 %	50 %	50 %	378700434
56570	NC_016810	CGG	2	6	2671148	2671153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700434
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56577	NC_016810	ATT	2	6	2671579	2671584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56578	NC_016810	TAA	2	6	2671591	2671596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56581	NC_016810	T	6	6	2671694	2671699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56583	NC_016810	TAATT	2	10	2671728	2671737	40 %	60 %	0 %	0 %	378700435
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56585	NC_016810	GTC	2	6	2671799	2671804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700435
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56589	NC_016810	CTGG	2	8	2672178	2672185	0 %	25 %	50 %	25 %	378700435
56590	NC_016810	TGG	2	6	2672198	2672203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378700435
56591	NC_016810	ATT	2	6	2672218	2672223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378700435
56592	NC_016810	A	6	6	2672288	2672293	100 %	0 %	0 %	0 %	378700435
56593	NC_016810	TGAA	2	8	2672294	2672301	50 %	25 %	25 %	0 %	378700435
56594	NC_016810	GGA	2	6	2672328	2672333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378700435
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56598	NC_016810	T	7	7	2672496	2672502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56599	NC_016810	CAG	2	6	2672528	2672533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56600	NC_016810	TTG	2	6	2672537	2672542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56601	NC_016810	TAT	2	6	2672638	2672643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56602	NC_016810	CCG	2	6	2672659	2672664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56603	NC_016810	TGC	2	6	2672760	2672765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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56605	NC_016810	CAGA	2	8	2672853	2672860	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56606	NC_016810	AGG	2	6	2672915	2672920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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56611	NC_016810	GTCG	2	8	2673098	2673105	0 %	25 %	50 %	25 %	378700436
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56856	NC_016810	A	6	6	2684791	2684796	100 %	0 %	0 %	0 %	378700449
56857	NC_016810	CACC	2	8	2684810	2684817	25 %	0 %	0 %	75 %	378700449
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56884	NC_016810	CGCTG	2	10	2686269	2686278	0 %	20 %	40 %	40 %	378700451
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56887	NC_016810	CGT	2	6	2686432	2686437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700451
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56911	NC_016810	CGC	2	6	2687403	2687408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700452
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56915	NC_016810	CAGCA	2	10	2687537	2687546	40 %	0 %	20 %	40 %	378700452
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56922	NC_016810	CATA	2	8	2687793	2687800	50 %	25 %	0 %	25 %	378700452
56923	NC_016810	CAG	2	6	2687806	2687811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700452
56924	NC_016810	CCGC	3	12	2687822	2687833	0 %	0 %	25 %	75 %	378700452
56925	NC_016810	AGC	2	6	2687858	2687863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700452
56926	NC_016810	GC	3	6	2687862	2687867	0 %	0 %	50 %	50 %	378700452
56927	NC_016810	CTG	2	6	2687872	2687877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700452
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56932	NC_016810	GGC	2	6	2688085	2688090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700453
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56934	NC_016810	CAGC	2	8	2688287	2688294	25 %	0 %	25 %	50 %	378700453
56935	NC_016810	AGT	2	6	2688401	2688406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700453
56936	NC_016810	CCG	2	6	2688434	2688439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700453
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56939	NC_016810	GCC	3	9	2688601	2688609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700453
56940	NC_016810	CTC	2	6	2688695	2688700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56941	NC_016810	GAT	2	6	2688790	2688795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700454
56942	NC_016810	CCA	2	6	2688809	2688814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378700454
56943	NC_016810	GC	3	6	2688900	2688905	0 %	0 %	50 %	50 %	378700454
56944	NC_016810	TGA	3	9	2688916	2688924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700454
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56946	NC_016810	GCCTTT	2	12	2689041	2689052	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378700454
56947	NC_016810	A	6	6	2689120	2689125	100 %	0 %	0 %	0 %	378700454
56948	NC_016810	AGC	2	6	2689134	2689139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700454
56949	NC_016810	CG	3	6	2689147	2689152	0 %	0 %	50 %	50 %	378700454
56950	NC_016810	TCA	2	6	2689185	2689190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700454
56951	NC_016810	CGCC	2	8	2689198	2689205	0 %	0 %	25 %	75 %	378700454
56952	NC_016810	ACA	2	6	2689273	2689278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378700454
56953	NC_016810	GCA	2	6	2689312	2689317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700454
56954	NC_016810	GTC	2	6	2689365	2689370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700454
56955	NC_016810	CCCGA	2	10	2689451	2689460	20 %	0 %	20 %	60 %	378700454
56956	NC_016810	GCA	2	6	2689483	2689488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700454
56957	NC_016810	TGC	2	6	2689515	2689520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700454
56958	NC_016810	CGA	2	6	2689552	2689557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700454
56959	NC_016810	ATA	2	6	2689632	2689637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378700454
56960	NC_016810	CAC	2	6	2689681	2689686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378700454
56961	NC_016810	TGG	2	6	2689752	2689757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378700454
56962	NC_016810	GA	3	6	2689802	2689807	50 %	0 %	50 %	0 %	378700454
56963	NC_016810	ATG	2	6	2689833	2689838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700454
56964	NC_016810	AGC	2	6	2689857	2689862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700454
56965	NC_016810	CG	3	6	2689938	2689943	0 %	0 %	50 %	50 %	378700454
56966	NC_016810	ACGCC	2	10	2689968	2689977	20 %	0 %	20 %	60 %	378700454
56967	NC_016810	CCG	2	6	2689994	2689999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700454
56968	NC_016810	CAG	3	9	2690036	2690044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700454
56969	NC_016810	GAAG	2	8	2690089	2690096	50 %	0 %	50 %	0 %	378700455
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56971	NC_016810	CGC	3	9	2690134	2690142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700455
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