MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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56002	NC_016810	GCC	2	6	2646398	2646403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700418
56003	NC_016810	TTCA	2	8	2646433	2646440	25 %	50 %	0 %	25 %	378700418
56004	NC_016810	GC	3	6	2646453	2646458	0 %	0 %	50 %	50 %	378700418
56005	NC_016810	TCT	2	6	2646518	2646523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378700418
56006	NC_016810	GCT	2	6	2646531	2646536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700418
56007	NC_016810	CAG	2	6	2646577	2646582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700418
56008	NC_016810	ATT	2	6	2646595	2646600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378700418
56009	NC_016810	TCT	2	6	2646617	2646622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378700418
56010	NC_016810	GGC	2	6	2646646	2646651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700418
56011	NC_016810	GC	3	6	2646678	2646683	0 %	0 %	50 %	50 %	378700418
56012	NC_016810	CTT	2	6	2646798	2646803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378700418
56013	NC_016810	GTG	2	6	2646839	2646844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378700418
56014	NC_016810	T	6	6	2646868	2646873	0 %	100 %	0 %	0 %	378700418
56015	NC_016810	ACA	2	6	2646888	2646893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378700418
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56017	NC_016810	CAG	2	6	2646964	2646969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700418
56018	NC_016810	CAC	2	6	2646976	2646981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378700418
56019	NC_016810	GC	3	6	2647002	2647007	0 %	0 %	50 %	50 %	378700418
56020	NC_016810	TGT	2	6	2647047	2647052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378700418
56021	NC_016810	CGA	2	6	2647053	2647058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700418
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56032	NC_016810	TGG	2	6	2647422	2647427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378700418
56033	NC_016810	ATG	2	6	2647484	2647489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700418
56034	NC_016810	GCC	2	6	2647568	2647573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700418
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56049	NC_016810	CAGG	2	8	2648403	2648410	25 %	0 %	50 %	25 %	378700418
56050	NC_016810	GAG	2	6	2648411	2648416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378700418
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56052	NC_016810	TGCAGA	2	12	2648431	2648442	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378700418
56053	NC_016810	TAAA	2	8	2648534	2648541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56054	NC_016810	GAT	2	6	2648569	2648574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56055	NC_016810	TAAC	2	8	2648588	2648595	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56056	NC_016810	AT	3	6	2648604	2648609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56057	NC_016810	AAAAG	2	10	2648615	2648624	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
56058	NC_016810	ATA	2	6	2648655	2648660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56059	NC_016810	TTAT	2	8	2648677	2648684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56060	NC_016810	AAT	2	6	2648705	2648710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56061	NC_016810	AATAA	2	10	2648742	2648751	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56062	NC_016810	CCG	2	6	2648752	2648757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56063	NC_016810	CTCTG	2	10	2648831	2648840	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
56064	NC_016810	T	7	7	2648893	2648899	0 %	100 %	0 %	0 %	378700419
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56067	NC_016810	AGCGC	2	10	2649132	2649141	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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56101	NC_016810	CCG	2	6	2650470	2650475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700420
56102	NC_016810	A	6	6	2650662	2650667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56103	NC_016810	TCA	2	6	2650668	2650673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56104	NC_016810	CG	3	6	2650679	2650684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56105	NC_016810	GTT	2	6	2650698	2650703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56106	NC_016810	T	6	6	2650738	2650743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56107	NC_016810	AC	3	6	2650747	2650752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56108	NC_016810	ACCGT	2	10	2650783	2650792	20 %	20 %	20 %	40 %	378700421
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56117	NC_016810	ATC	2	6	2651263	2651268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700421
56118	NC_016810	TTG	2	6	2651274	2651279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378700421
56119	NC_016810	CAC	2	6	2651309	2651314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378700421
56120	NC_016810	CGC	2	6	2651354	2651359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700421
56121	NC_016810	CAGCGA	2	12	2651361	2651372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700421
56122	NC_016810	CCGC	2	8	2651584	2651591	0 %	0 %	25 %	75 %	378700421
56123	NC_016810	CGC	2	6	2651600	2651605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700421
56124	NC_016810	ACA	2	6	2651609	2651614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378700421
56125	NC_016810	ACGA	2	8	2651621	2651628	50 %	0 %	25 %	25 %	378700421
56126	NC_016810	GA	3	6	2651627	2651632	50 %	0 %	50 %	0 %	378700421
56127	NC_016810	CAT	2	6	2651678	2651683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700421
56128	NC_016810	CG	3	6	2651709	2651714	0 %	0 %	50 %	50 %	378700421
56129	NC_016810	GAC	2	6	2651853	2651858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700421
56130	NC_016810	TCT	2	6	2651860	2651865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378700421
56131	NC_016810	CGC	2	6	2651867	2651872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700421
56132	NC_016810	ATT	2	6	2651965	2651970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378700422
56133	NC_016810	CAT	2	6	2651983	2651988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700422
56134	NC_016810	TGCGC	2	10	2652034	2652043	0 %	20 %	40 %	40 %	378700422
56135	NC_016810	GC	4	8	2652040	2652047	0 %	0 %	50 %	50 %	378700422
56136	NC_016810	T	6	6	2652049	2652054	0 %	100 %	0 %	0 %	378700422
56137	NC_016810	CGC	2	6	2652078	2652083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700422
56138	NC_016810	GCG	2	6	2652143	2652148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700422
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56142	NC_016810	CTG	2	6	2652235	2652240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700422
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56144	NC_016810	CTG	2	6	2652283	2652288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700422
56145	NC_016810	GCG	2	6	2652350	2652355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700422
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56148	NC_016810	CG	3	6	2652422	2652427	0 %	0 %	50 %	50 %	378700422
56149	NC_016810	GCT	2	6	2652442	2652447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700422
56150	NC_016810	GCCA	2	8	2652456	2652463	25 %	0 %	25 %	50 %	378700422
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56152	NC_016810	CAGC	2	8	2652495	2652502	25 %	0 %	25 %	50 %	378700422
56153	NC_016810	AAG	2	6	2652521	2652526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378700422
56154	NC_016810	GTTC	2	8	2652552	2652559	0 %	50 %	25 %	25 %	378700422
56155	NC_016810	GCG	2	6	2652612	2652617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700423
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56162	NC_016810	GTT	2	6	2652979	2652984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378700423
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56166	NC_016810	GTA	2	6	2653070	2653075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700423
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56168	NC_016810	CGT	2	6	2653198	2653203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700423
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56171	NC_016810	GC	4	8	2653399	2653406	0 %	0 %	50 %	50 %	378700423
56172	NC_016810	CCG	2	6	2653603	2653608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700423
56173	NC_016810	T	6	6	2653851	2653856	0 %	100 %	0 %	0 %	378700423
56174	NC_016810	CGAA	2	8	2653907	2653914	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56175	NC_016810	GC	3	6	2653949	2653954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56176	NC_016810	GCA	2	6	2653986	2653991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700424
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56179	NC_016810	TCG	2	6	2654063	2654068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700424
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56182	NC_016810	GCCCG	2	10	2654158	2654167	0 %	0 %	40 %	60 %	378700424
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56184	NC_016810	TGA	2	6	2654205	2654210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700424
56185	NC_016810	GCT	2	6	2654223	2654228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700424
56186	NC_016810	CG	5	10	2654301	2654310	0 %	0 %	50 %	50 %	378700424
56187	NC_016810	GCC	2	6	2654366	2654371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700424
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56189	NC_016810	CG	3	6	2654450	2654455	0 %	0 %	50 %	50 %	378700424
56190	NC_016810	CCGC	2	8	2654456	2654463	0 %	0 %	25 %	75 %	378700424
56191	NC_016810	GATC	2	8	2654490	2654497	25 %	25 %	25 %	25 %	378700424
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56201	NC_016810	GC	3	6	2655230	2655235	0 %	0 %	50 %	50 %	378700425
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56215	NC_016810	T	6	6	2655798	2655803	0 %	100 %	0 %	0 %	378700425
56216	NC_016810	ACG	2	6	2655804	2655809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700425
56217	NC_016810	GCG	2	6	2655847	2655852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700425
56218	NC_016810	GCA	2	6	2655881	2655886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700425
56219	NC_016810	AT	3	6	2655928	2655933	50 %	50 %	0 %	0 %	378700425
56220	NC_016810	TCT	2	6	2655973	2655978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378700425
56221	NC_016810	CTG	2	6	2656029	2656034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700425
56222	NC_016810	GTT	2	6	2656046	2656051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378700425
56223	NC_016810	GGT	2	6	2656077	2656082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378700425
56224	NC_016810	CGTG	2	8	2656100	2656107	0 %	25 %	50 %	25 %	378700425
56225	NC_016810	ATTC	2	8	2656116	2656123	25 %	50 %	0 %	25 %	378700425
56226	NC_016810	GCTACA	2	12	2656124	2656135	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56227	NC_016810	CGA	2	6	2656163	2656168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56228	NC_016810	GCCC	2	8	2656177	2656184	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56229	NC_016810	GTTA	2	8	2656202	2656209	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56230	NC_016810	TTG	2	6	2656279	2656284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56231	NC_016810	TTA	2	6	2656325	2656330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56232	NC_016810	ATT	2	6	2656357	2656362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56233	NC_016810	AATG	2	8	2656386	2656393	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56234	NC_016810	GCCA	2	8	2656488	2656495	25 %	0 %	25 %	50 %	378700426
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56353	NC_016810	CGC	2	6	2661864	2661869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700431
56354	NC_016810	CGG	2	6	2661906	2661911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700431
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56371	NC_016810	GAG	2	6	2662904	2662909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378700431
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56439	NC_016810	ACG	2	6	2665633	2665638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700433
56440	NC_016810	TCG	2	6	2665654	2665659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700433
56441	NC_016810	CTG	2	6	2665686	2665691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700433
56442	NC_016810	GCT	2	6	2665743	2665748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700433
56443	NC_016810	TCCAGC	2	12	2665768	2665779	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378700433
56444	NC_016810	CCGG	2	8	2665780	2665787	0 %	0 %	50 %	50 %	378700433
56445	NC_016810	CCA	3	9	2665796	2665804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378700433
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56450	NC_016810	GGC	2	6	2666022	2666027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700433
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56452	NC_016810	AG	3	6	2666169	2666174	50 %	0 %	50 %	0 %	378700433
56453	NC_016810	GTT	2	6	2666241	2666246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378700433
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56458	NC_016810	CTG	2	6	2666478	2666483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700433
56459	NC_016810	CAGCG	2	10	2666496	2666505	20 %	0 %	40 %	40 %	378700433
56460	NC_016810	TAT	2	6	2666537	2666542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378700433
56461	NC_016810	GCA	2	6	2666585	2666590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700433
56462	NC_016810	CGG	2	6	2666619	2666624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700433
56463	NC_016810	CG	3	6	2666646	2666651	0 %	0 %	50 %	50 %	378700433
56464	NC_016810	CCG	2	6	2666722	2666727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700433
56465	NC_016810	GTA	2	6	2666744	2666749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700433
56466	NC_016810	GC	3	6	2666776	2666781	0 %	0 %	50 %	50 %	378700433
56467	NC_016810	TGG	2	6	2666861	2666866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378700433
56468	NC_016810	GC	3	6	2666913	2666918	0 %	0 %	50 %	50 %	378700433
56469	NC_016810	GCG	2	6	2666927	2666932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700433
56470	NC_016810	CAG	2	6	2666946	2666951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700433
56471	NC_016810	TGGC	2	8	2666966	2666973	0 %	25 %	50 %	25 %	378700433
56472	NC_016810	TGC	2	6	2666989	2666994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700433
56473	NC_016810	CT	3	6	2667010	2667015	0 %	50 %	0 %	50 %	378700433
56474	NC_016810	CAGGC	2	10	2667053	2667062	20 %	0 %	40 %	40 %	378700433
56475	NC_016810	ACGC	2	8	2667066	2667073	25 %	0 %	25 %	50 %	378700433
56476	NC_016810	TGC	2	6	2667091	2667096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700433
56477	NC_016810	TTCGCC	2	12	2667147	2667158	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378700433
56478	NC_016810	GC	3	6	2667170	2667175	0 %	0 %	50 %	50 %	378700433
56479	NC_016810	GGT	2	6	2667192	2667197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378700433
56480	NC_016810	GCT	2	6	2667230	2667235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700433
56481	NC_016810	GGC	2	6	2667261	2667266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700433
56482	NC_016810	CGGT	2	8	2667292	2667299	0 %	25 %	50 %	25 %	378700433
56483	NC_016810	GCG	2	6	2667382	2667387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700433
56484	NC_016810	CGC	2	6	2667404	2667409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700433
56485	NC_016810	CTG	2	6	2667525	2667530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700433
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56489	NC_016810	GTC	2	6	2667579	2667584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700433
56490	NC_016810	CGC	2	6	2667590	2667595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700433
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56492	NC_016810	GCC	2	6	2667614	2667619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700433
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56496	NC_016810	GTA	2	6	2667893	2667898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700433
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56498	NC_016810	CCA	2	6	2668044	2668049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378700433
56499	NC_016810	CCA	2	6	2668070	2668075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378700433
56500	NC_016810	CGGCG	2	10	2668098	2668107	0 %	0 %	60 %	40 %	378700433

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