MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55501	NC_016810	CTT	2	6	2623388	2623393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378700413
55502	NC_016810	GCC	2	6	2623437	2623442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700413
55503	NC_016810	GC	3	6	2623467	2623472	0 %	0 %	50 %	50 %	378700413
55504	NC_016810	CGC	2	6	2623491	2623496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700413
55505	NC_016810	AGG	2	6	2623588	2623593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378700413
55506	NC_016810	CGT	2	6	2623595	2623600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700413
55507	NC_016810	CTT	2	6	2623613	2623618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378700413
55508	NC_016810	TAA	2	6	2623658	2623663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55509	NC_016810	T	7	7	2623708	2623714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55510	NC_016810	CTG	2	6	2623766	2623771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55511	NC_016810	GCC	2	6	2623832	2623837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700414
55512	NC_016810	CTG	2	6	2623855	2623860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700414
55513	NC_016810	GCG	2	6	2623892	2623897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700414
55514	NC_016810	CCGC	2	8	2624010	2624017	0 %	0 %	25 %	75 %	378700414
55515	NC_016810	GCA	2	6	2624025	2624030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700414
55516	NC_016810	CG	3	6	2624066	2624071	0 %	0 %	50 %	50 %	378700414
55517	NC_016810	ATC	2	6	2624083	2624088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700414
55518	NC_016810	TTG	2	6	2624119	2624124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378700414
55519	NC_016810	CAG	2	6	2624125	2624130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700414
55520	NC_016810	AGC	2	6	2624138	2624143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700414
55521	NC_016810	CAG	2	6	2624179	2624184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700414
55522	NC_016810	CGGCG	2	10	2624241	2624250	0 %	0 %	60 %	40 %	378700414
55523	NC_016810	CGT	2	6	2624278	2624283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700414
55524	NC_016810	TTA	2	6	2624300	2624305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378700414
55525	NC_016810	CGA	2	6	2624328	2624333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700414
55526	NC_016810	TCGT	2	8	2624348	2624355	0 %	50 %	25 %	25 %	378700414
55527	NC_016810	CG	4	8	2624373	2624380	0 %	0 %	50 %	50 %	378700414
55528	NC_016810	TCG	2	6	2624399	2624404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700414
55529	NC_016810	GCG	3	9	2624408	2624416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700414
55530	NC_016810	ACG	2	6	2624444	2624449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700414
55531	NC_016810	GGT	2	6	2624487	2624492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378700414
55532	NC_016810	GC	4	8	2624547	2624554	0 %	0 %	50 %	50 %	378700414
55533	NC_016810	CAG	2	6	2624564	2624569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700414
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55535	NC_016810	GTT	2	6	2624601	2624606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378700414
55536	NC_016810	CAG	2	6	2624626	2624631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700414
55537	NC_016810	ACT	2	6	2624651	2624656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700414
55538	NC_016810	GCC	2	6	2624672	2624677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700414
55539	NC_016810	GCAACA	2	12	2624703	2624714	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	378700414
55540	NC_016810	CG	3	6	2624869	2624874	0 %	0 %	50 %	50 %	378700414
55541	NC_016810	GC	3	6	2625001	2625006	0 %	0 %	50 %	50 %	378700414
55542	NC_016810	CGA	2	6	2625020	2625025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700414
55543	NC_016810	ACGG	2	8	2625028	2625035	25 %	0 %	50 %	25 %	378700414
55544	NC_016810	GGA	2	6	2625093	2625098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378700414
55545	NC_016810	GGCT	2	8	2625100	2625107	0 %	25 %	50 %	25 %	378700414
55546	NC_016810	CCCG	2	8	2625286	2625293	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55547	NC_016810	TGC	2	6	2625356	2625361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700415
55548	NC_016810	CTGC	2	8	2625410	2625417	0 %	25 %	25 %	50 %	378700415
55549	NC_016810	CAT	2	6	2625470	2625475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700415
55550	NC_016810	CAT	2	6	2625491	2625496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700415
55551	NC_016810	CCTGCG	2	12	2625674	2625685	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378700415
55552	NC_016810	CT	3	6	2625796	2625801	0 %	50 %	0 %	50 %	378700415
55553	NC_016810	TGT	3	9	2625806	2625814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378700415
55554	NC_016810	CGC	2	6	2625848	2625853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700415
55555	NC_016810	CTG	2	6	2626011	2626016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700415
55556	NC_016810	CGC	2	6	2626040	2626045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700415
55557	NC_016810	AACTGG	2	12	2626048	2626059	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378700415
55558	NC_016810	AGT	2	6	2626061	2626066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700415
55559	NC_016810	GC	3	6	2626125	2626130	0 %	0 %	50 %	50 %	378700415
55560	NC_016810	GC	3	6	2626200	2626205	0 %	0 %	50 %	50 %	378700415
55561	NC_016810	CGC	2	6	2626262	2626267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700415
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