MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_016810	CCA	2	6	2600011	2600016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378700391
55002	NC_016810	TCA	2	6	2600031	2600036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700391
55003	NC_016810	T	6	6	2600042	2600047	0 %	100 %	0 %	0 %	378700391
55004	NC_016810	CGT	2	6	2600053	2600058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700391
55005	NC_016810	CGT	2	6	2600158	2600163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700391
55006	NC_016810	CGG	2	6	2600186	2600191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700391
55007	NC_016810	CTT	2	6	2600206	2600211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378700391
55008	NC_016810	CAC	2	6	2600255	2600260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378700391
55009	NC_016810	CTT	2	6	2600285	2600290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378700391
55010	NC_016810	GC	4	8	2600417	2600424	0 %	0 %	50 %	50 %	378700391
55011	NC_016810	CTG	2	6	2600431	2600436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700391
55012	NC_016810	GCTT	2	8	2600520	2600527	0 %	50 %	25 %	25 %	378700391
55013	NC_016810	A	6	6	2600675	2600680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55014	NC_016810	TTG	2	6	2600712	2600717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378700392
55015	NC_016810	CGT	2	6	2600746	2600751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700392
55016	NC_016810	GCT	2	6	2600798	2600803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700392
55017	NC_016810	TGC	2	6	2600917	2600922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700392
55018	NC_016810	ATC	2	6	2601035	2601040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700392
55019	NC_016810	GCG	2	6	2601042	2601047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700392
55020	NC_016810	CATC	2	8	2601055	2601062	25 %	25 %	0 %	50 %	378700392
55021	NC_016810	GCG	2	6	2601066	2601071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700392
55022	NC_016810	CGG	2	6	2601121	2601126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700392
55023	NC_016810	TCA	2	6	2601136	2601141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700392
55024	NC_016810	CGC	2	6	2601167	2601172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700392
55025	NC_016810	CTG	2	6	2601227	2601232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700392
55026	NC_016810	GTC	2	6	2601315	2601320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700392
55027	NC_016810	CTGG	2	8	2601326	2601333	0 %	25 %	50 %	25 %	378700392
55028	NC_016810	GAC	2	6	2601380	2601385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700392
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55031	NC_016810	TAGCG	2	10	2601425	2601434	20 %	20 %	40 %	20 %	378700392
55032	NC_016810	CG	3	6	2601456	2601461	0 %	0 %	50 %	50 %	378700392
55033	NC_016810	CTAACG	2	12	2601469	2601480	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378700392
55034	NC_016810	CGG	2	6	2601488	2601493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700392
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55041	NC_016810	GTCG	2	8	2601843	2601850	0 %	25 %	50 %	25 %	378700393
55042	NC_016810	TGT	2	6	2601914	2601919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378700393
55043	NC_016810	GC	4	8	2601946	2601953	0 %	0 %	50 %	50 %	378700393
55044	NC_016810	CCG	2	6	2601971	2601976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700393
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55052	NC_016810	GTA	2	6	2602317	2602322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700393
55053	NC_016810	CGTC	2	8	2602429	2602436	0 %	25 %	25 %	50 %	378700393
55054	NC_016810	TCA	3	9	2602451	2602459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700393
55055	NC_016810	TCA	2	6	2602474	2602479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700393
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55058	NC_016810	AAGC	2	8	2602692	2602699	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55059	NC_016810	TTG	2	6	2602717	2602722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55060	NC_016810	T	8	8	2602731	2602738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55061	NC_016810	TCA	2	6	2602792	2602797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700394
55062	NC_016810	CAG	2	6	2602869	2602874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700394
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55066	NC_016810	CTG	2	6	2603011	2603016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700394
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55069	NC_016810	ATGAA	2	10	2603138	2603147	60 %	20 %	20 %	0 %	378700394
55070	NC_016810	CGCA	2	8	2603167	2603174	25 %	0 %	25 %	50 %	378700394
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55083	NC_016810	CA	3	6	2604168	2604173	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55084	NC_016810	TTG	2	6	2604179	2604184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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55086	NC_016810	A	8	8	2604306	2604313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55087	NC_016810	TCA	2	6	2604339	2604344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55088	NC_016810	GGC	2	6	2604359	2604364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55089	NC_016810	ATG	2	6	2604373	2604378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55090	NC_016810	AATGG	2	10	2604479	2604488	40 %	20 %	40 %	0 %	378700397
55091	NC_016810	C	6	6	2604498	2604503	0 %	0 %	0 %	100 %	378700397
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55099	NC_016810	CAG	2	6	2604754	2604759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700397
55100	NC_016810	A	6	6	2604785	2604790	100 %	0 %	0 %	0 %	378700397
55101	NC_016810	CCAG	2	8	2604792	2604799	25 %	0 %	25 %	50 %	378700397
55102	NC_016810	CAC	3	9	2604811	2604819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378700397
55103	NC_016810	CTG	2	6	2604856	2604861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700397
55104	NC_016810	GCA	2	6	2604906	2604911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700397
55105	NC_016810	GCACCA	2	12	2604972	2604983	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378700397
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55112	NC_016810	GC	3	6	2605306	2605311	0 %	0 %	50 %	50 %	378700397
55113	NC_016810	CAG	2	6	2605324	2605329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700397
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55115	NC_016810	CCA	2	6	2605401	2605406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378700397
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55117	NC_016810	TCA	2	6	2605595	2605600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55471	NC_016810	AAT	2	6	2621934	2621939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378700412
55472	NC_016810	CACG	2	8	2622014	2622021	25 %	0 %	25 %	50 %	378700412
55473	NC_016810	GC	3	6	2622024	2622029	0 %	0 %	50 %	50 %	378700412
55474	NC_016810	GATGC	2	10	2622069	2622078	20 %	20 %	40 %	20 %	378700412
55475	NC_016810	TAAA	2	8	2622130	2622137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55476	NC_016810	GAA	2	6	2622160	2622165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55477	NC_016810	CGT	2	6	2622212	2622217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700413
55478	NC_016810	TCG	2	6	2622280	2622285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700413
55479	NC_016810	GCC	2	6	2622324	2622329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700413
55480	NC_016810	CTG	2	6	2622333	2622338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378700413
55481	NC_016810	GCG	2	6	2622409	2622414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378700413
55482	NC_016810	GGA	2	6	2622438	2622443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378700413
55483	NC_016810	TTC	2	6	2622528	2622533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378700413
55484	NC_016810	CCA	2	6	2622554	2622559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378700413
55485	NC_016810	CCG	2	6	2622616	2622621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700413
55486	NC_016810	GCGCCT	2	12	2622784	2622795	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378700413
55487	NC_016810	GCC	2	6	2622807	2622812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700413
55488	NC_016810	GAT	2	6	2622813	2622818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700413
55489	NC_016810	GAG	2	6	2622886	2622891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378700413
55490	NC_016810	CAG	2	6	2622897	2622902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378700413
55491	NC_016810	GCC	2	6	2622916	2622921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700413
55492	NC_016810	CCG	2	6	2622965	2622970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378700413
55493	NC_016810	ATC	2	6	2623071	2623076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378700413
55494	NC_016810	GTCA	2	8	2623203	2623210	25 %	25 %	25 %	25 %	378700413
55495	NC_016810	TGA	2	6	2623232	2623237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378700413
55496	NC_016810	CCA	2	6	2623241	2623246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378700413
55497	NC_016810	CAC	2	6	2623263	2623268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378700413
55498	NC_016810	GTG	2	6	2623321	2623326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378700413
55499	NC_016810	GGTC	2	8	2623346	2623353	0 %	25 %	50 %	25 %	378700413
55500	NC_016810	TTC	2	6	2623372	2623377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378700413

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