MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 63182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_016633	GCAA	2	8	855407	855414	50 %	0 %	25 %	25 %	374315206
15003	NC_016633	CTC	2	6	855417	855422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315206
15004	NC_016633	AGA	2	6	855441	855446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374315206
15005	NC_016633	TCC	2	6	855553	855558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315206
15006	NC_016633	CTTG	2	8	855627	855634	0 %	50 %	25 %	25 %	374315206
15007	NC_016633	CA	3	6	855661	855666	50 %	0 %	0 %	50 %	374315206
15008	NC_016633	CAT	2	6	855669	855674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315206
15009	NC_016633	GGAA	2	8	855752	855759	50 %	0 %	50 %	0 %	374315206
15010	NC_016633	CTA	2	6	855790	855795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15011	NC_016633	A	6	6	855821	855826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_016633	GTT	2	6	855846	855851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_016633	TGA	2	6	855901	855906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_016633	TGG	2	6	855927	855932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_016633	AGT	2	6	855934	855939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_016633	GGTTTG	2	12	856096	856107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_016633	TG	3	6	856106	856111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_016633	TTAGT	2	10	856131	856140	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_016633	AGC	2	6	856170	856175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15020	NC_016633	GTG	2	6	856264	856269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_016633	CT	3	6	856330	856335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15022	NC_016633	TACT	2	8	856343	856350	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15023	NC_016633	CTGA	2	8	856354	856361	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15024	NC_016633	T	6	6	856373	856378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_016633	TCC	2	6	856515	856520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15026	NC_016633	TTCTC	2	10	856572	856581	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15027	NC_016633	ATT	2	6	856622	856627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_016633	AAATTC	2	12	856632	856643	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15029	NC_016633	GAC	2	6	856648	856653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15030	NC_016633	TTCTT	2	10	856683	856692	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15031	NC_016633	T	8	8	856799	856806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_016633	AAC	2	6	856809	856814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15033	NC_016633	GGT	2	6	856825	856830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_016633	AT	3	6	856833	856838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_016633	TGT	2	6	856845	856850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_016633	ATG	2	6	856866	856871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_016633	TTA	2	6	856873	856878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15038	NC_016633	AT	3	6	856919	856924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15039	NC_016633	TCC	2	6	856994	856999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315207
15040	NC_016633	GAA	2	6	857153	857158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374315207
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15042	NC_016633	TGA	2	6	857386	857391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315207
15043	NC_016633	TGC	2	6	857455	857460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315207
15044	NC_016633	GAA	2	6	857462	857467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374315207
15045	NC_016633	TCG	2	6	857595	857600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315207
15046	NC_016633	TGA	2	6	857734	857739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315207
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15048	NC_016633	ACTCA	2	10	857848	857857	40 %	20 %	0 %	40 %	374315207
15049	NC_016633	CT	3	6	857858	857863	0 %	50 %	0 %	50 %	374315207
15050	NC_016633	GAA	2	6	857875	857880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374315207
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15053	NC_016633	TC	3	6	858050	858055	0 %	50 %	0 %	50 %	374315207
15054	NC_016633	AAGGAA	2	12	858083	858094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374315207
15055	NC_016633	TGA	2	6	858106	858111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315207
15056	NC_016633	GAA	2	6	858113	858118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374315207
15057	NC_016633	CAA	2	6	858121	858126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315207
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15059	NC_016633	CTA	2	6	858175	858180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315207
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15062	NC_016633	A	7	7	858237	858243	100 %	0 %	0 %	0 %	374315207
15063	NC_016633	GTT	2	6	858263	858268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315207
15064	NC_016633	ATC	2	6	858425	858430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315208
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15068	NC_016633	AGG	2	6	858623	858628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374315208
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15072	NC_016633	AAGG	2	8	858744	858751	50 %	0 %	50 %	0 %	374315208
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15089	NC_016633	GGT	2	6	859736	859741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374315209
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15100	NC_016633	AAT	2	6	860218	860223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374315209
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15102	NC_016633	TTA	2	6	860278	860283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374315210
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15107	NC_016633	AT	3	6	860612	860617	50 %	50 %	0 %	0 %	374315210
15108	NC_016633	CCA	2	6	860635	860640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374315210
15109	NC_016633	ATC	2	6	860701	860706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315210
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15111	NC_016633	T	6	6	860735	860740	0 %	100 %	0 %	0 %	374315210
15112	NC_016633	TCA	2	6	860746	860751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315210
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15118	NC_016633	CG	3	6	861069	861074	0 %	0 %	50 %	50 %	374315210
15119	NC_016633	AG	3	6	861110	861115	50 %	0 %	50 %	0 %	374315210
15120	NC_016633	GGC	3	9	861120	861128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374315210
15121	NC_016633	A	6	6	861135	861140	100 %	0 %	0 %	0 %	374315210
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15123	NC_016633	ACT	2	6	861188	861193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315210
15124	NC_016633	AAT	2	6	861221	861226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15125	NC_016633	CAA	2	6	861341	861346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315211
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15137	NC_016633	A	6	6	862147	862152	100 %	0 %	0 %	0 %	374315211
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15230	NC_016633	AC	3	6	867941	867946	50 %	0 %	0 %	50 %	374315216
15231	NC_016633	GAAATG	2	12	868003	868014	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374315216
15232	NC_016633	AAGA	2	8	868036	868043	75 %	0 %	25 %	0 %	374315216
15233	NC_016633	AAC	2	6	868069	868074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315216
15234	NC_016633	TGA	2	6	868113	868118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315216
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15236	NC_016633	TTGC	2	8	868141	868148	0 %	50 %	25 %	25 %	374315216
15237	NC_016633	CAA	2	6	868332	868337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315216
15238	NC_016633	TGA	2	6	868356	868361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315216
15239	NC_016633	ACA	2	6	868419	868424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315216
15240	NC_016633	CAA	2	6	868426	868431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315216
15241	NC_016633	CCTAT	2	10	868468	868477	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15242	NC_016633	AGG	2	6	868493	868498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15243	NC_016633	CAAT	2	8	868499	868506	50 %	25 %	0 %	25 %	374315217
15244	NC_016633	A	6	6	868508	868513	100 %	0 %	0 %	0 %	374315217
15245	NC_016633	ATT	2	6	868535	868540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374315217
15246	NC_016633	TCTCAC	2	12	868549	868560	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	374315217
15247	NC_016633	TGA	2	6	868692	868697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315217
15248	NC_016633	GCA	2	6	868710	868715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315217
15249	NC_016633	AGC	2	6	868777	868782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315217
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15251	NC_016633	GATGG	2	10	868924	868933	20 %	20 %	60 %	0 %	374315217
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15259	NC_016633	CTG	2	6	869594	869599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315218
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15271	NC_016633	ATCT	2	8	870101	870108	25 %	50 %	0 %	25 %	374315218
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15279	NC_016633	CTG	2	6	870551	870556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315218
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15339	NC_016633	AT	3	6	874168	874173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15353	NC_016633	AT	3	6	875274	875279	50 %	50 %	0 %	0 %	374315220
15354	NC_016633	AGA	3	9	875346	875354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15355	NC_016633	TAA	3	9	875427	875435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15356	NC_016633	TGA	2	6	875453	875458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15358	NC_016633	ATT	2	6	875567	875572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374315221
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15361	NC_016633	ATC	2	6	875701	875706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315221
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15365	NC_016633	ATC	2	6	875862	875867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315221
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15367	NC_016633	AAT	2	6	875914	875919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374315221
15368	NC_016633	ATC	2	6	875928	875933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315221
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15471	NC_016633	TAC	2	6	882353	882358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315227
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15486	NC_016633	GA	3	6	883114	883119	50 %	0 %	50 %	0 %	374315228
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15489	NC_016633	CAA	2	6	883186	883191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315228
15490	NC_016633	GCA	2	6	883238	883243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315228
15491	NC_016633	TCG	2	6	883355	883360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315229
15492	NC_016633	ACT	2	6	883370	883375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315229
15493	NC_016633	ATC	2	6	883393	883398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315229
15494	NC_016633	G	6	6	883425	883430	0 %	0 %	100 %	0 %	374315229
15495	NC_016633	TCT	2	6	883431	883436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315229
15496	NC_016633	TTG	2	6	883544	883549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315229
15497	NC_016633	GACATC	2	12	883582	883593	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	374315229
15498	NC_016633	CAT	2	6	883624	883629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315229
15499	NC_016633	GGAA	2	8	883775	883782	50 %	0 %	50 %	0 %	374315229
15500	NC_016633	TCC	2	6	883814	883819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315229

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