MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 63182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_016633	AC	3	6	797737	797742	50 %	0 %	0 %	50 %	374315150
14003	NC_016633	TCA	2	6	797791	797796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315150
14004	NC_016633	A	6	6	797811	797816	100 %	0 %	0 %	0 %	374315150
14005	NC_016633	CTC	2	6	797859	797864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315150
14006	NC_016633	GCTGG	2	10	797892	797901	0 %	20 %	60 %	20 %	374315150
14007	NC_016633	G	7	7	797916	797922	0 %	0 %	100 %	0 %	374315150
14008	NC_016633	GGT	2	6	798009	798014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374315150
14009	NC_016633	TG	3	6	798286	798291	0 %	50 %	50 %	0 %	374315150
14010	NC_016633	CAT	2	6	798302	798307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315150
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14012	NC_016633	ATG	2	6	798450	798455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315150
14013	NC_016633	GCC	2	6	798582	798587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315150
14014	NC_016633	TCT	2	6	798658	798663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315150
14015	NC_016633	CT	3	6	798662	798667	0 %	50 %	0 %	50 %	374315150
14016	NC_016633	GCC	2	6	798702	798707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315150
14017	NC_016633	CAA	2	6	798715	798720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315150
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14019	NC_016633	GAG	2	6	798795	798800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374315150
14020	NC_016633	TTC	2	6	798819	798824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315150
14021	NC_016633	ACGC	2	8	798830	798837	25 %	0 %	25 %	50 %	374315150
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14024	NC_016633	CCCTT	2	10	798949	798958	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
14025	NC_016633	AGC	2	6	798964	798969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14026	NC_016633	TTC	2	6	798972	798977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14027	NC_016633	TCC	2	6	799106	799111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14028	NC_016633	A	7	7	799189	799195	100 %	0 %	0 %	0 %	374315151
14029	NC_016633	ATTG	2	8	799278	799285	25 %	50 %	25 %	0 %	374315151
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14036	NC_016633	TGGTA	2	10	799582	799591	20 %	40 %	40 %	0 %	374315151
14037	NC_016633	TTG	2	6	799643	799648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315151
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14039	NC_016633	T	6	6	799687	799692	0 %	100 %	0 %	0 %	374315151
14040	NC_016633	A	6	6	799720	799725	100 %	0 %	0 %	0 %	374315151
14041	NC_016633	AAC	2	6	799760	799765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315151
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14044	NC_016633	T	6	6	799957	799962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_016633	AAC	2	6	799981	799986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315152
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14052	NC_016633	GAA	2	6	800297	800302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374315152
14053	NC_016633	GAT	2	6	800341	800346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315152
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14057	NC_016633	ACAGG	2	10	800475	800484	40 %	0 %	40 %	20 %	374315153
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14063	NC_016633	ATC	2	6	800931	800936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315154
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14069	NC_016633	GTA	2	6	801280	801285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315154
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14089	NC_016633	GGT	2	6	802566	802571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374315155
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14093	NC_016633	C	6	6	803039	803044	0 %	0 %	0 %	100 %	374315156
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14100	NC_016633	ACT	2	6	803527	803532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315156
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14103	NC_016633	TCCT	2	8	803728	803735	0 %	50 %	0 %	50 %	374315156
14104	NC_016633	CGGC	2	8	803736	803743	0 %	0 %	50 %	50 %	374315156
14105	NC_016633	ATA	2	6	803836	803841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374315156
14106	NC_016633	CAAT	2	8	803910	803917	50 %	25 %	0 %	25 %	374315156
14107	NC_016633	CAAC	2	8	803955	803962	50 %	0 %	0 %	50 %	374315156
14108	NC_016633	TA	3	6	804016	804021	50 %	50 %	0 %	0 %	374315156
14109	NC_016633	GAT	2	6	804025	804030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315156
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14115	NC_016633	AG	3	6	804333	804338	50 %	0 %	50 %	0 %	374315156
14116	NC_016633	CTT	2	6	804417	804422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315156
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14121	NC_016633	TTG	2	6	804865	804870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315157
14122	NC_016633	ATC	2	6	804882	804887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315157
14123	NC_016633	AG	3	6	804894	804899	50 %	0 %	50 %	0 %	374315157
14124	NC_016633	TCT	2	6	804997	805002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315157
14125	NC_016633	GCT	2	6	805060	805065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315157
14126	NC_016633	CTCTT	2	10	805184	805193	0 %	60 %	0 %	40 %	374315157
14127	NC_016633	T	6	6	805340	805345	0 %	100 %	0 %	0 %	374315157
14128	NC_016633	ATG	2	6	805369	805374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315157
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14130	NC_016633	TAATGA	2	12	805573	805584	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374315158
14131	NC_016633	TCC	2	6	805599	805604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315158
14132	NC_016633	ATC	2	6	805740	805745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315159
14133	NC_016633	TGA	2	6	805753	805758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315159
14134	NC_016633	GCA	2	6	805878	805883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315159
14135	NC_016633	GC	3	6	805885	805890	0 %	0 %	50 %	50 %	374315159
14136	NC_016633	AGC	2	6	805907	805912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315159
14137	NC_016633	AAAC	2	8	805917	805924	75 %	0 %	0 %	25 %	374315159
14138	NC_016633	AAATC	2	10	805938	805947	60 %	20 %	0 %	20 %	374315159
14139	NC_016633	GTT	2	6	805965	805970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315159
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14141	NC_016633	CAG	2	6	806030	806035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315159
14142	NC_016633	CCT	2	6	806081	806086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14143	NC_016633	TATTT	2	10	806098	806107	20 %	80 %	0 %	0 %	374315160
14144	NC_016633	ATA	2	6	806186	806191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374315160
14145	NC_016633	AAAT	2	8	806257	806264	75 %	25 %	0 %	0 %	374315160
14146	NC_016633	AG	3	6	806363	806368	50 %	0 %	50 %	0 %	374315160
14147	NC_016633	GA	3	6	806376	806381	50 %	0 %	50 %	0 %	374315160
14148	NC_016633	T	6	6	806456	806461	0 %	100 %	0 %	0 %	374315160
14149	NC_016633	CTT	2	6	806468	806473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315160
14150	NC_016633	ACAGTA	2	12	806506	806517	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	374315160
14151	NC_016633	AGCC	2	8	806619	806626	25 %	0 %	25 %	50 %	374315160
14152	NC_016633	T	6	6	806670	806675	0 %	100 %	0 %	0 %	374315160
14153	NC_016633	GAT	2	6	806714	806719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315160
14154	NC_016633	CTG	2	6	806916	806921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315160
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14156	NC_016633	AACCG	2	10	807068	807077	40 %	0 %	20 %	40 %	374315160
14157	NC_016633	GT	3	6	807085	807090	0 %	50 %	50 %	0 %	374315160
14158	NC_016633	GTAT	2	8	807135	807142	25 %	50 %	25 %	0 %	374315160
14159	NC_016633	TTC	2	6	807155	807160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315160
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14161	NC_016633	A	6	6	807268	807273	100 %	0 %	0 %	0 %	374315160
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14165	NC_016633	G	6	6	807523	807528	0 %	0 %	100 %	0 %	374315160
14166	NC_016633	CCT	2	6	807600	807605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315160
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14169	NC_016633	GGAA	2	8	807851	807858	50 %	0 %	50 %	0 %	374315160
14170	NC_016633	GGC	2	6	807914	807919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374315160
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14174	NC_016633	CTG	2	6	808258	808263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315161
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14176	NC_016633	TCA	2	6	808304	808309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315161
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14181	NC_016633	TCTG	2	8	808617	808624	0 %	50 %	25 %	25 %	374315161
14182	NC_016633	TCC	2	6	808679	808684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315161
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14185	NC_016633	GCT	2	6	808849	808854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315161
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14187	NC_016633	T	6	6	808975	808980	0 %	100 %	0 %	0 %	374315161
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14193	NC_016633	CAT	2	6	809453	809458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315162
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14198	NC_016633	CAT	2	6	809765	809770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315163
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14200	NC_016633	GTT	2	6	809849	809854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315163
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14209	NC_016633	AGA	2	6	810255	810260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374315163
14210	NC_016633	TGT	2	6	810305	810310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315163
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14213	NC_016633	TCT	2	6	810589	810594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315163
14214	NC_016633	TCCAC	2	10	810607	810616	20 %	20 %	0 %	60 %	374315163
14215	NC_016633	GA	3	6	810618	810623	50 %	0 %	50 %	0 %	374315163
14216	NC_016633	AC	3	6	810629	810634	50 %	0 %	0 %	50 %	374315163
14217	NC_016633	ATT	2	6	810676	810681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374315163
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14220	NC_016633	AAT	2	6	810917	810922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374315163
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14222	NC_016633	AG	3	6	811089	811094	50 %	0 %	50 %	0 %	374315163
14223	NC_016633	CTG	2	6	811248	811253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315163
14224	NC_016633	CGA	2	6	811343	811348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315163
14225	NC_016633	ACTGAA	2	12	811359	811370	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	374315163
14226	NC_016633	GCA	2	6	811627	811632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315163
14227	NC_016633	AAT	2	6	811646	811651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374315163
14228	NC_016633	AAC	2	6	811662	811667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315163
14229	NC_016633	GGA	2	6	811698	811703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374315163
14230	NC_016633	CAA	2	6	811763	811768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315163
14231	NC_016633	CAC	2	6	811988	811993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374315163
14232	NC_016633	TGT	2	6	812123	812128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315163
14233	NC_016633	CTC	2	6	812133	812138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315163
14234	NC_016633	A	6	6	812165	812170	100 %	0 %	0 %	0 %	374315163
14235	NC_016633	CAT	2	6	812246	812251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315163
14236	NC_016633	TTTA	2	8	812283	812290	25 %	75 %	0 %	0 %	374315163
14237	NC_016633	AAG	2	6	812353	812358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374315163
14238	NC_016633	TCT	2	6	812371	812376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315163
14239	NC_016633	GCT	2	6	812386	812391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315163
14240	NC_016633	ATC	2	6	812424	812429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315163
14241	NC_016633	A	6	6	812451	812456	100 %	0 %	0 %	0 %	374315163
14242	NC_016633	GAG	2	6	812465	812470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374315163
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14245	NC_016633	GTT	2	6	812594	812599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315163
14246	NC_016633	CCT	2	6	812648	812653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315163
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14249	NC_016633	GAT	2	6	812766	812771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315163
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14252	NC_016633	A	7	7	812857	812863	100 %	0 %	0 %	0 %	374315163
14253	NC_016633	A	7	7	812890	812896	100 %	0 %	0 %	0 %	374315163
14254	NC_016633	CAA	2	6	812926	812931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14279	NC_016633	T	9	9	814490	814498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14280	NC_016633	CTATG	2	10	814533	814542	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14281	NC_016633	TCCT	2	8	814545	814552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14282	NC_016633	AT	4	8	814565	814572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14283	NC_016633	T	6	6	814681	814686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14284	NC_016633	TACAG	2	10	814739	814748	40 %	20 %	20 %	20 %	374315166
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14366	NC_016633	TGA	2	6	819297	819302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315170
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14480	NC_016633	GCT	2	6	824760	824765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315175
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14484	NC_016633	TCA	2	6	824930	824935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315175
14485	NC_016633	TCA	2	6	825000	825005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315175
14486	NC_016633	ATC	2	6	825109	825114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315175
14487	NC_016633	A	6	6	825295	825300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14488	NC_016633	A	6	6	825350	825355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14489	NC_016633	CCT	2	6	825566	825571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315176
14490	NC_016633	TTC	2	6	825610	825615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315176
14491	NC_016633	ATTC	2	8	825631	825638	25 %	50 %	0 %	25 %	374315176
14492	NC_016633	GCA	2	6	825645	825650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315176
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14495	NC_016633	CTC	2	6	825758	825763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315176
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14499	NC_016633	TA	4	8	826114	826121	50 %	50 %	0 %	0 %	374315177
14500	NC_016633	CCTT	2	8	826143	826150	0 %	50 %	0 %	50 %	374315177

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