MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 63182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_016633	T	7	7	686042	686048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12002	NC_016633	CAT	2	6	686103	686108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12003	NC_016633	AAT	2	6	686117	686122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_016633	CGA	2	6	686193	686198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12005	NC_016633	AGG	2	6	686203	686208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12006	NC_016633	TGT	2	6	686295	686300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315050
12007	NC_016633	AGA	2	6	686365	686370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374315050
12008	NC_016633	GAAA	2	8	686579	686586	75 %	0 %	25 %	0 %	374315050
12009	NC_016633	GACCGC	2	12	686618	686629	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374315050
12010	NC_016633	TAT	2	6	686728	686733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374315050
12011	NC_016633	GCC	2	6	686852	686857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315050
12012	NC_016633	GAT	2	6	686912	686917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315050
12013	NC_016633	TGC	2	6	686977	686982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315050
12014	NC_016633	CAC	2	6	687001	687006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374315050
12015	NC_016633	TGAT	2	8	687063	687070	25 %	50 %	25 %	0 %	374315050
12016	NC_016633	GAC	2	6	687136	687141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315050
12017	NC_016633	AAGTT	2	10	687161	687170	40 %	40 %	20 %	0 %	374315050
12018	NC_016633	CTTG	2	8	687355	687362	0 %	50 %	25 %	25 %	374315050
12019	NC_016633	AAAAT	2	10	687377	687386	80 %	20 %	0 %	0 %	374315050
12020	NC_016633	A	7	7	687443	687449	100 %	0 %	0 %	0 %	374315050
12021	NC_016633	ACCTT	2	10	687495	687504	20 %	40 %	0 %	40 %	374315050
12022	NC_016633	AAAG	2	8	687530	687537	75 %	0 %	25 %	0 %	374315050
12023	NC_016633	TCA	2	6	687609	687614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315050
12024	NC_016633	A	6	6	687686	687691	100 %	0 %	0 %	0 %	374315050
12025	NC_016633	GCG	2	6	687696	687701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374315050
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12030	NC_016633	AGG	2	6	688095	688100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374315050
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12033	NC_016633	TTCCC	2	10	688390	688399	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
12034	NC_016633	TTA	2	6	688403	688408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12035	NC_016633	A	6	6	688561	688566	100 %	0 %	0 %	0 %	374315051
12036	NC_016633	TCC	2	6	688590	688595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315051
12037	NC_016633	GCC	2	6	688619	688624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315051
12038	NC_016633	CTG	2	6	688682	688687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315051
12039	NC_016633	TCCCA	2	10	688913	688922	20 %	20 %	0 %	60 %	374315051
12040	NC_016633	GAT	2	6	688934	688939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315051
12041	NC_016633	T	7	7	688978	688984	0 %	100 %	0 %	0 %	374315051
12042	NC_016633	GTA	2	6	689012	689017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315051
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12046	NC_016633	TTG	2	6	689315	689320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315052
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12049	NC_016633	AGG	2	6	689429	689434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374315052
12050	NC_016633	GGA	2	6	689479	689484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374315052
12051	NC_016633	GGA	2	6	689515	689520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374315052
12052	NC_016633	GAAT	2	8	689574	689581	50 %	25 %	25 %	0 %	374315052
12053	NC_016633	CTT	2	6	689607	689612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315052
12054	NC_016633	TGC	2	6	689636	689641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315052
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12057	NC_016633	ATG	2	6	689987	689992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315052
12058	NC_016633	ACT	2	6	690055	690060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315052
12059	NC_016633	ATG	2	6	690086	690091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315052
12060	NC_016633	GAC	2	6	690121	690126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315052
12061	NC_016633	GAAA	2	8	690156	690163	75 %	0 %	25 %	0 %	374315052
12062	NC_016633	GCC	2	6	690169	690174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315052
12063	NC_016633	TCG	2	6	690215	690220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315052
12064	NC_016633	AGG	2	6	690259	690264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374315052
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12069	NC_016633	AAC	2	6	690538	690543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315052
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12074	NC_016633	GCA	2	6	690674	690679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315052
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12080	NC_016633	CAA	2	6	691173	691178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315052
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12084	NC_016633	AGGA	2	8	691275	691282	50 %	0 %	50 %	0 %	374315052
12085	NC_016633	GTT	2	6	691356	691361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315052
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12088	NC_016633	GAAA	2	8	691477	691484	75 %	0 %	25 %	0 %	374315052
12089	NC_016633	CCT	2	6	691491	691496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315052
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12092	NC_016633	GAC	2	6	691784	691789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315052
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12097	NC_016633	GT	3	6	692151	692156	0 %	50 %	50 %	0 %	374315052
12098	NC_016633	AGAT	2	8	692180	692187	50 %	25 %	25 %	0 %	374315052
12099	NC_016633	CCT	3	9	692196	692204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315052
12100	NC_016633	CT	3	6	692310	692315	0 %	50 %	0 %	50 %	374315052
12101	NC_016633	CTG	2	6	692321	692326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315052
12102	NC_016633	GA	4	8	692484	692491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12103	NC_016633	CAG	2	6	692562	692567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315053
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12105	NC_016633	A	6	6	692612	692617	100 %	0 %	0 %	0 %	374315053
12106	NC_016633	ACGGT	2	10	692619	692628	20 %	20 %	40 %	20 %	374315053
12107	NC_016633	TCG	2	6	692673	692678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315053
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12110	NC_016633	GACGG	2	10	692771	692780	20 %	0 %	60 %	20 %	374315053
12111	NC_016633	AAGGA	2	10	692834	692843	60 %	0 %	40 %	0 %	374315053
12112	NC_016633	GTT	2	6	692896	692901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315053
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12115	NC_016633	ATC	2	6	693062	693067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315053
12116	NC_016633	GCT	2	6	693120	693125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315053
12117	NC_016633	ACG	2	6	693210	693215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315053
12118	NC_016633	G	6	6	693260	693265	0 %	0 %	100 %	0 %	374315053
12119	NC_016633	TGC	2	6	693297	693302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315053
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12121	NC_016633	CTT	2	6	693431	693436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315054
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12486	NC_016633	ATG	2	6	713494	713499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315074
12487	NC_016633	CAT	3	9	713537	713545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315074
12488	NC_016633	TGCC	2	8	713656	713663	0 %	25 %	25 %	50 %	374315074
12489	NC_016633	GTT	2	6	713708	713713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315074
12490	NC_016633	AAT	2	6	713727	713732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374315074
12491	NC_016633	AAT	2	6	713802	713807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374315074
12492	NC_016633	CAT	2	6	713897	713902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315074
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