MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 63182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_016633	TCG	2	6	655059	655064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315031
11502	NC_016633	CAA	2	6	655226	655231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315031
11503	NC_016633	ATGG	2	8	655235	655242	25 %	25 %	50 %	0 %	374315031
11504	NC_016633	TCC	2	6	655269	655274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315031
11505	NC_016633	CTG	2	6	655298	655303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315031
11506	NC_016633	TCAG	2	8	655317	655324	25 %	25 %	25 %	25 %	374315031
11507	NC_016633	ACA	2	6	655347	655352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315031
11508	NC_016633	GGT	2	6	655375	655380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374315031
11509	NC_016633	CTT	2	6	655459	655464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315031
11510	NC_016633	GTA	2	6	655488	655493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315031
11511	NC_016633	TGA	2	6	655510	655515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315031
11512	NC_016633	TGCT	2	8	655522	655529	0 %	50 %	25 %	25 %	374315031
11513	NC_016633	CAAGG	2	10	655676	655685	40 %	0 %	40 %	20 %	374315032
11514	NC_016633	GCG	2	6	655720	655725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374315032
11515	NC_016633	CAG	2	6	655742	655747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315032
11516	NC_016633	ACAGGG	2	12	655765	655776	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	374315032
11517	NC_016633	CTT	2	6	655784	655789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315032
11518	NC_016633	CAT	2	6	655882	655887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315032
11519	NC_016633	CAC	2	6	655916	655921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374315032
11520	NC_016633	T	8	8	655931	655938	0 %	100 %	0 %	0 %	374315032
11521	NC_016633	AGG	2	6	655975	655980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374315032
11522	NC_016633	CTGC	2	8	656041	656048	0 %	25 %	25 %	50 %	374315032
11523	NC_016633	TACC	2	8	656098	656105	25 %	25 %	0 %	50 %	374315032
11524	NC_016633	CATCCC	2	12	656168	656179	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	374315032
11525	NC_016633	AGAA	2	8	656254	656261	75 %	0 %	25 %	0 %	374315032
11526	NC_016633	TGC	2	6	656332	656337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315032
11527	NC_016633	CCT	2	6	656372	656377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11528	NC_016633	TTCA	2	8	656386	656393	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11529	NC_016633	TTC	2	6	656471	656476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11530	NC_016633	A	7	7	656501	656507	100 %	0 %	0 %	0 %	374315033
11531	NC_016633	CAA	2	6	656692	656697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315033
11532	NC_016633	AT	3	6	656704	656709	50 %	50 %	0 %	0 %	374315033
11533	NC_016633	TAT	2	6	656776	656781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374315033
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11535	NC_016633	GGA	2	6	656905	656910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374315033
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11538	NC_016633	AGGG	2	8	657126	657133	25 %	0 %	75 %	0 %	374315033
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11548	NC_016633	TTCA	2	8	657784	657791	25 %	50 %	0 %	25 %	374315033
11549	NC_016633	GGT	2	6	657801	657806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374315033
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11551	NC_016633	CAGA	2	8	657835	657842	50 %	0 %	25 %	25 %	374315033
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11553	NC_016633	TTC	2	6	658025	658030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315033
11554	NC_016633	TACG	2	8	658069	658076	25 %	25 %	25 %	25 %	374315033
11555	NC_016633	TACT	2	8	658082	658089	25 %	50 %	0 %	25 %	374315033
11556	NC_016633	CGA	2	6	658297	658302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315033
11557	NC_016633	GATA	2	8	658315	658322	50 %	25 %	25 %	0 %	374315033
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11572	NC_016633	CTTT	2	8	659383	659390	0 %	75 %	0 %	25 %	374315034
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11585	NC_016633	TGGA	2	8	660174	660181	25 %	25 %	50 %	0 %	374315034
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11588	NC_016633	GTCT	2	8	660353	660360	0 %	50 %	25 %	25 %	374315034
11589	NC_016633	AGAGGG	2	12	660373	660384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374315034
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11594	NC_016633	TGA	2	6	660716	660721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315035
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11599	NC_016633	TCGA	2	8	661045	661052	25 %	25 %	25 %	25 %	374315035
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11604	NC_016633	T	6	6	661529	661534	0 %	100 %	0 %	0 %	374315036
11605	NC_016633	CAG	2	6	661535	661540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315036
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11609	NC_016633	CTGT	2	8	661788	661795	0 %	50 %	25 %	25 %	374315036
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11611	NC_016633	A	7	7	661829	661835	100 %	0 %	0 %	0 %	374315036
11612	NC_016633	GCCCC	2	10	661846	661855	0 %	0 %	20 %	80 %	374315036
11613	NC_016633	TCT	2	6	661873	661878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315036
11614	NC_016633	CTGCC	2	10	661908	661917	0 %	20 %	20 %	60 %	374315036
11615	NC_016633	TTC	2	6	661920	661925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315036
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11618	NC_016633	AT	3	6	662148	662153	50 %	50 %	0 %	0 %	374315036
11619	NC_016633	CGA	2	6	662177	662182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315036
11620	NC_016633	CTTC	2	8	662185	662192	0 %	50 %	0 %	50 %	374315036
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11622	NC_016633	CAT	2	6	662402	662407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315036
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11747	NC_016633	AC	4	8	670332	670339	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11748	NC_016633	CTA	2	6	670391	670396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11999	NC_016633	ATCA	2	8	685941	685948	50 %	25 %	0 %	25 %	374315049
12000	NC_016633	TTGA	2	8	685950	685957	25 %	50 %	25 %	0 %	374315049

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