MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 63182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_016633	TGG	2	6	624866	624871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374315005
11003	NC_016633	G	6	6	625035	625040	0 %	0 %	100 %	0 %	374315005
11004	NC_016633	TACA	2	8	625078	625085	50 %	25 %	0 %	25 %	374315005
11005	NC_016633	TCC	2	6	625121	625126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315005
11006	NC_016633	G	6	6	625137	625142	0 %	0 %	100 %	0 %	374315005
11007	NC_016633	GCC	2	6	625172	625177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315005
11008	NC_016633	T	6	6	625188	625193	0 %	100 %	0 %	0 %	374315005
11009	NC_016633	AGAA	2	8	625245	625252	75 %	0 %	25 %	0 %	374315005
11010	NC_016633	GTG	2	6	625253	625258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374315005
11011	NC_016633	AATC	2	8	625275	625282	50 %	25 %	0 %	25 %	374315005
11012	NC_016633	TCAG	2	8	625304	625311	25 %	25 %	25 %	25 %	374315005
11013	NC_016633	CTC	2	6	625370	625375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315006
11014	NC_016633	A	6	6	625379	625384	100 %	0 %	0 %	0 %	374315006
11015	NC_016633	GAT	2	6	625408	625413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315006
11016	NC_016633	GGA	2	6	625414	625419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374315006
11017	NC_016633	CAT	2	6	625431	625436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315006
11018	NC_016633	AT	4	8	625439	625446	50 %	50 %	0 %	0 %	374315006
11019	NC_016633	CAG	2	6	625447	625452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315006
11020	NC_016633	GCT	2	6	625516	625521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315006
11021	NC_016633	GAA	2	6	625528	625533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374315006
11022	NC_016633	GTT	2	6	625556	625561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315006
11023	NC_016633	CT	3	6	625624	625629	0 %	50 %	0 %	50 %	374315006
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11028	NC_016633	CTAT	2	8	625894	625901	25 %	50 %	0 %	25 %	374315006
11029	NC_016633	GAA	2	6	625957	625962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374315006
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11031	NC_016633	ACCT	2	8	625978	625985	25 %	25 %	0 %	50 %	374315006
11032	NC_016633	GGA	2	6	626013	626018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374315006
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11038	NC_016633	TGG	2	6	626102	626107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374315006
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11041	NC_016633	TCTT	2	8	626415	626422	0 %	75 %	0 %	25 %	374315006
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11045	NC_016633	AGG	2	6	626749	626754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_016633	GAAGA	2	10	626851	626860	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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11048	NC_016633	CAAAG	2	10	626890	626899	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11049	NC_016633	CAA	2	6	626969	626974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11050	NC_016633	TATT	2	8	626995	627002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_016633	CTT	2	6	627020	627025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11052	NC_016633	CAGG	2	8	627041	627048	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11053	NC_016633	CTG	2	6	627072	627077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11054	NC_016633	AGA	2	6	627124	627129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_016633	CAG	2	6	627251	627256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11056	NC_016633	CATT	2	8	627469	627476	25 %	50 %	0 %	25 %	374315007
11057	NC_016633	CCGG	2	8	627491	627498	0 %	0 %	50 %	50 %	374315007
11058	NC_016633	CATT	2	8	627545	627552	25 %	50 %	0 %	25 %	374315007
11059	NC_016633	CTG	2	6	627571	627576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315007
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11064	NC_016633	ATC	2	6	627825	627830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315008
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11074	NC_016633	TA	3	6	628387	628392	50 %	50 %	0 %	0 %	374315008
11075	NC_016633	ATT	2	6	628398	628403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374315008
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11079	NC_016633	TGC	2	6	628545	628550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315008
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11082	NC_016633	TTG	2	6	628656	628661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315008
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11087	NC_016633	TGGA	2	8	628793	628800	25 %	25 %	50 %	0 %	374315008
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11091	NC_016633	CAAC	2	8	628973	628980	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11092	NC_016633	A	7	7	628982	628988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_016633	ATC	2	6	628994	628999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11094	NC_016633	AC	3	6	629085	629090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11095	NC_016633	GTT	2	6	629106	629111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_016633	TA	3	6	629120	629125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_016633	AAG	2	6	629189	629194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_016633	A	6	6	629195	629200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_016633	T	6	6	629271	629276	0 %	100 %	0 %	0 %	374315009
11100	NC_016633	CTT	2	6	629280	629285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315009
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11105	NC_016633	CTT	2	6	629543	629548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315009
11106	NC_016633	T	7	7	629547	629553	0 %	100 %	0 %	0 %	374315009
11107	NC_016633	TA	3	6	629634	629639	50 %	50 %	0 %	0 %	374315009
11108	NC_016633	ATC	2	6	629649	629654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315009
11109	NC_016633	T	6	6	629656	629661	0 %	100 %	0 %	0 %	374315009
11110	NC_016633	AT	3	6	629731	629736	50 %	50 %	0 %	0 %	374315009
11111	NC_016633	GAT	2	6	629782	629787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315009
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11113	NC_016633	TCT	2	6	629884	629889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315009
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11115	NC_016633	AATC	2	8	629973	629980	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11116	NC_016633	T	7	7	629999	630005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_016633	TA	3	6	630026	630031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_016633	AAAC	2	8	630058	630065	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11120	NC_016633	ATA	2	6	630185	630190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_016633	A	6	6	630202	630207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_016633	AG	3	6	630239	630244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_016633	GCA	2	6	630323	630328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11124	NC_016633	CAA	2	6	630331	630336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11125	NC_016633	GAT	2	6	630337	630342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_016633	GAA	2	6	630371	630376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_016633	AAT	2	6	630438	630443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11128	NC_016633	ATC	2	6	630538	630543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11129	NC_016633	AAT	2	6	630550	630555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11130	NC_016633	T	7	7	630560	630566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11131	NC_016633	TGA	2	6	630582	630587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11132	NC_016633	A	7	7	630589	630595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11133	NC_016633	TTA	2	6	630628	630633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11134	NC_016633	GGC	2	6	630648	630653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11138	NC_016633	GAA	3	9	630913	630921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11139	NC_016633	ATC	2	6	630981	630986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11238	NC_016633	GCT	2	6	638058	638063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315014
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11240	NC_016633	CTTGAG	2	12	638128	638139	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	374315014
11241	NC_016633	CAG	2	6	638212	638217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315014
11242	NC_016633	CCCTG	2	10	638299	638308	0 %	20 %	20 %	60 %	374315014
11243	NC_016633	GGT	3	9	638392	638400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374315014
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11246	NC_016633	TA	3	6	638485	638490	50 %	50 %	0 %	0 %	374315014
11247	NC_016633	ATC	2	6	638512	638517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315014
11248	NC_016633	AAC	2	6	638525	638530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315014
11249	NC_016633	CCT	2	6	638559	638564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315014
11250	NC_016633	TCC	2	6	638603	638608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315014
11251	NC_016633	ACC	2	6	638633	638638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374315014
11252	NC_016633	A	6	6	638648	638653	100 %	0 %	0 %	0 %	374315014
11253	NC_016633	GAA	2	6	638687	638692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374315014
11254	NC_016633	TTC	2	6	638740	638745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315014
11255	NC_016633	AGAA	2	8	638766	638773	75 %	0 %	25 %	0 %	374315014
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11257	NC_016633	A	6	6	638813	638818	100 %	0 %	0 %	0 %	374315014
11258	NC_016633	CAG	2	6	638841	638846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315014
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11260	NC_016633	GGTAAT	2	12	638996	639007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315015
11261	NC_016633	CTG	2	6	639008	639013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315015
11262	NC_016633	GCC	2	6	639076	639081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315015
11263	NC_016633	GTA	2	6	639360	639365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315015
11264	NC_016633	TCA	2	6	639495	639500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315015
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11267	NC_016633	ACTTCC	2	12	639744	639755	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	374315015
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11270	NC_016633	TCC	2	6	639900	639905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315015
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11272	NC_016633	TCA	2	6	639973	639978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315015
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11280	NC_016633	TA	3	6	640347	640352	50 %	50 %	0 %	0 %	374315016
11281	NC_016633	CCG	2	6	640457	640462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315016
11282	NC_016633	TCT	2	6	640527	640532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315016
11283	NC_016633	CAT	2	6	640549	640554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315016
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11285	NC_016633	CGG	2	6	640767	640772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374315016
11286	NC_016633	ACT	2	6	640843	640848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315016
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11291	NC_016633	TATG	2	8	641064	641071	25 %	50 %	25 %	0 %	374315017
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11299	NC_016633	GAT	2	6	641440	641445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315017
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11302	NC_016633	G	6	6	641893	641898	0 %	0 %	100 %	0 %	374315018
11303	NC_016633	CCCG	2	8	641975	641982	0 %	0 %	25 %	75 %	374315018
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11310	NC_016633	CCAT	2	8	642451	642458	25 %	25 %	0 %	50 %	374315018
11311	NC_016633	A	7	7	642463	642469	100 %	0 %	0 %	0 %	374315018
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11331	NC_016633	CAG	2	6	643998	644003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315020
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11336	NC_016633	GA	3	6	644268	644273	50 %	0 %	50 %	0 %	374315020
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11354	NC_016633	GGC	2	6	645309	645314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374315021
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11356	NC_016633	ATC	2	6	645463	645468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315021
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11359	NC_016633	CCA	2	6	645593	645598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11360	NC_016633	A	6	6	645622	645627	100 %	0 %	0 %	0 %	374315022
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11366	NC_016633	C	6	6	646012	646017	0 %	0 %	0 %	100 %	374315022
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11492	NC_016633	TGGC	2	8	654145	654152	0 %	25 %	50 %	25 %	374315030
11493	NC_016633	GTG	2	6	654346	654351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374315030
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11495	NC_016633	GTT	2	6	654485	654490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315030
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