MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 63182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10005	NC_016633	CCTA	2	8	570401	570408	25 %	25 %	0 %	50 %	374314959
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10010	NC_016633	GCTT	2	8	570722	570729	0 %	50 %	25 %	25 %	374314959
10011	NC_016633	GACC	2	8	570734	570741	25 %	0 %	25 %	50 %	374314959
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10019	NC_016633	TG	3	6	571171	571176	0 %	50 %	50 %	0 %	374314960
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10022	NC_016633	GT	3	6	571328	571333	0 %	50 %	50 %	0 %	374314960
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10109	NC_016633	TC	3	6	576322	576327	0 %	50 %	0 %	50 %	374314964
10110	NC_016633	GCA	2	6	576345	576350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314964
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10113	NC_016633	ATC	3	9	576421	576429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314965
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10119	NC_016633	AGC	2	6	576792	576797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10121	NC_016633	T	6	6	576886	576891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10244	NC_016633	ATG	2	6	583069	583074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314971
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10348	NC_016633	TGAT	2	8	588878	588885	25 %	50 %	25 %	0 %	374314975
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10350	NC_016633	A	7	7	588978	588984	100 %	0 %	0 %	0 %	374314975
10351	NC_016633	ACT	2	6	589013	589018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314975
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10353	NC_016633	AAG	2	6	589177	589182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10354	NC_016633	T	6	6	589199	589204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10355	NC_016633	TAGGTA	2	12	589209	589220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10356	NC_016633	TCA	2	6	589223	589228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10357	NC_016633	TTA	2	6	589243	589248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10358	NC_016633	A	8	8	589259	589266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10359	NC_016633	AAAG	2	8	589277	589284	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10360	NC_016633	GCA	2	6	589363	589368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314976
10361	NC_016633	GCA	2	6	589384	589389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314976
10362	NC_016633	ATTG	2	8	589441	589448	25 %	50 %	25 %	0 %	374314976
10363	NC_016633	CCA	2	6	589474	589479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314976
10364	NC_016633	GTCATA	2	12	589587	589598	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374314976
10365	NC_016633	GCA	2	6	589642	589647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314976
10366	NC_016633	TCA	2	6	589648	589653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314976
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10377	NC_016633	GGCA	2	8	590145	590152	25 %	0 %	50 %	25 %	374314976
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10413	NC_016633	T	6	6	592282	592287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10485	NC_016633	AGC	2	6	596133	596138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314980
10486	NC_016633	ATCA	2	8	596147	596154	50 %	25 %	0 %	25 %	374314980
10487	NC_016633	TCA	2	6	596179	596184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314980
10488	NC_016633	AAC	2	6	596202	596207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314980
10489	NC_016633	GAT	3	9	596216	596224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314980
10490	NC_016633	AGGA	3	12	596268	596279	50 %	0 %	50 %	0 %	374314980
10491	NC_016633	A	7	7	596346	596352	100 %	0 %	0 %	0 %	374314980
10492	NC_016633	ATT	2	6	596385	596390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314980
10493	NC_016633	TCC	2	6	596392	596397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374314981
10494	NC_016633	ATC	2	6	596425	596430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314981
10495	NC_016633	ATACT	2	10	596472	596481	40 %	40 %	0 %	20 %	374314981
10496	NC_016633	A	6	6	596493	596498	100 %	0 %	0 %	0 %	374314981
10497	NC_016633	TAA	2	6	596502	596507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314981
10498	NC_016633	A	7	7	596506	596512	100 %	0 %	0 %	0 %	374314981
10499	NC_016633	GTA	2	6	596520	596525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314981
10500	NC_016633	ATT	2	6	596588	596593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314981

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