MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 63182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_016633	GTC	2	6	542169	542174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9502	NC_016633	TTCT	2	8	542206	542213	0 %	75 %	0 %	25 %	374314932
9503	NC_016633	TCT	2	6	542309	542314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314932
9504	NC_016633	TC	3	6	542343	542348	0 %	50 %	0 %	50 %	374314932
9505	NC_016633	ACG	2	6	542388	542393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314932
9506	NC_016633	CGTT	2	8	542443	542450	0 %	50 %	25 %	25 %	374314932
9507	NC_016633	GTC	2	6	542627	542632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314933
9508	NC_016633	CCGG	2	8	542643	542650	0 %	0 %	50 %	50 %	374314933
9509	NC_016633	ATG	2	6	542704	542709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314933
9510	NC_016633	AAT	2	6	542717	542722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314933
9511	NC_016633	AGC	2	6	542780	542785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314933
9512	NC_016633	CT	3	6	542798	542803	0 %	50 %	0 %	50 %	374314933
9513	NC_016633	TCA	2	6	542804	542809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314933
9514	NC_016633	TA	3	6	542844	542849	50 %	50 %	0 %	0 %	374314933
9515	NC_016633	GCT	2	6	542884	542889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314933
9516	NC_016633	TCA	2	6	542918	542923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314933
9517	NC_016633	TTC	3	9	542983	542991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314933
9518	NC_016633	CTG	2	6	543013	543018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314933
9519	NC_016633	GAAGGA	2	12	543035	543046	50 %	0 %	50 %	0 %	374314933
9520	NC_016633	TAC	2	6	543049	543054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314933
9521	NC_016633	CAT	2	6	543141	543146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314933
9522	NC_016633	ATG	2	6	543154	543159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314933
9523	NC_016633	AATTG	2	10	543232	543241	40 %	40 %	20 %	0 %	374314933
9524	NC_016633	A	6	6	543245	543250	100 %	0 %	0 %	0 %	374314933
9525	NC_016633	CAGAAA	2	12	543392	543403	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	374314934
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9528	NC_016633	CCA	2	6	543542	543547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314934
9529	NC_016633	TCA	2	6	543605	543610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314934
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9532	NC_016633	GCACG	2	10	543817	543826	20 %	0 %	40 %	40 %	374314935
9533	NC_016633	CTTG	2	8	543886	543893	0 %	50 %	25 %	25 %	374314935
9534	NC_016633	CAA	2	6	544015	544020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314935
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9538	NC_016633	TCT	2	6	544275	544280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314936
9539	NC_016633	TCC	2	6	544324	544329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9540	NC_016633	T	6	6	544381	544386	0 %	100 %	0 %	0 %	374314937
9541	NC_016633	T	6	6	544388	544393	0 %	100 %	0 %	0 %	374314937
9542	NC_016633	CTT	2	6	544399	544404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314937
9543	NC_016633	GTTC	2	8	544520	544527	0 %	50 %	25 %	25 %	374314937
9544	NC_016633	TTTC	2	8	544569	544576	0 %	75 %	0 %	25 %	374314937
9545	NC_016633	ATC	2	6	544585	544590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314937
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9551	NC_016633	TGC	2	6	545152	545157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314937
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9554	NC_016633	GCA	2	6	545267	545272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314937
9555	NC_016633	CCTT	2	8	545291	545298	0 %	50 %	0 %	50 %	374314937
9556	NC_016633	GGC	2	6	545308	545313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374314937
9557	NC_016633	GGT	2	6	545326	545331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314937
9558	NC_016633	CAT	2	6	545356	545361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314937
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9563	NC_016633	TTCA	2	8	545698	545705	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9564	NC_016633	GCAA	2	8	545722	545729	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9565	NC_016633	GTC	2	6	545791	545796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314938
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9567	NC_016633	TAC	3	9	545889	545897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314938
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9573	NC_016633	C	6	6	546199	546204	0 %	0 %	0 %	100 %	374314938
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9619	NC_016633	CGACC	2	10	549018	549027	20 %	0 %	20 %	60 %	374314939
9620	NC_016633	A	6	6	549138	549143	100 %	0 %	0 %	0 %	374314939
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