MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 63182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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58002	NC_016633	GAA	2	6	3291450	3291455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317353
58003	NC_016633	TCC	2	6	3291503	3291508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374317353
58004	NC_016633	A	6	6	3291548	3291553	100 %	0 %	0 %	0 %	374317353
58005	NC_016633	GGCC	2	8	3291573	3291580	0 %	0 %	50 %	50 %	374317353
58006	NC_016633	CGAG	2	8	3291678	3291685	25 %	0 %	50 %	25 %	374317353
58007	NC_016633	ACC	2	6	3291778	3291783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374317353
58008	NC_016633	GTT	2	6	3291891	3291896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374317353
58009	NC_016633	TGA	2	6	3291933	3291938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317353
58010	NC_016633	TGA	2	6	3291954	3291959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317353
58011	NC_016633	AGA	2	6	3291968	3291973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317353
58012	NC_016633	TTCT	2	8	3292007	3292014	0 %	75 %	0 %	25 %	374317353
58013	NC_016633	AGA	2	6	3292121	3292126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317353
58014	NC_016633	GAA	2	6	3292135	3292140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317353
58015	NC_016633	GAA	2	6	3292168	3292173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317353
58016	NC_016633	GAA	2	6	3292183	3292188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317353
58017	NC_016633	GGCCCA	2	12	3292191	3292202	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374317353
58018	NC_016633	TTC	2	6	3292289	3292294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374317354
58019	NC_016633	TAT	2	6	3292313	3292318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374317354
58020	NC_016633	AG	4	8	3292430	3292437	50 %	0 %	50 %	0 %	374317354
58021	NC_016633	TTG	2	6	3292587	3292592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374317354
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58025	NC_016633	TGT	2	6	3293171	3293176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374317354
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58027	NC_016633	ATG	2	6	3293251	3293256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317354
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58032	NC_016633	CAG	2	6	3293859	3293864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374317354
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58038	NC_016633	CCT	2	6	3294085	3294090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374317354
58039	NC_016633	TTG	2	6	3294116	3294121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58040	NC_016633	TGAAT	2	10	3294152	3294161	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58041	NC_016633	GTG	2	6	3294176	3294181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58042	NC_016633	AGA	2	6	3294221	3294226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317355
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58050	NC_016633	GTT	2	6	3294921	3294926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374317355
58051	NC_016633	CAGG	2	8	3294979	3294986	25 %	0 %	50 %	25 %	374317355
58052	NC_016633	CTG	2	6	3295012	3295017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317355
58053	NC_016633	ATC	2	6	3295132	3295137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374317355
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58057	NC_016633	TAC	2	6	3295258	3295263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374317356
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58060	NC_016633	CATGC	2	10	3295374	3295383	20 %	20 %	20 %	40 %	374317356
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58067	NC_016633	GCG	2	6	3295659	3295664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374317356
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58082	NC_016633	GC	3	6	3296687	3296692	0 %	0 %	50 %	50 %	374317358
58083	NC_016633	ATT	2	6	3296700	3296705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374317358
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58088	NC_016633	GTT	2	6	3296908	3296913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58089	NC_016633	A	8	8	3296926	3296933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58090	NC_016633	A	6	6	3297137	3297142	100 %	0 %	0 %	0 %	374317359
58091	NC_016633	CGCA	2	8	3297153	3297160	25 %	0 %	25 %	50 %	374317359
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58093	NC_016633	ATT	3	9	3297218	3297226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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58473	NC_016633	GTCGAT	2	12	3318350	3318361	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	374317375
58474	NC_016633	A	6	6	3318473	3318478	100 %	0 %	0 %	0 %	374317375
58475	NC_016633	TTGA	2	8	3318525	3318532	25 %	50 %	25 %	0 %	374317376
58476	NC_016633	TTC	2	6	3318557	3318562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374317376
58477	NC_016633	CCA	2	6	3318616	3318621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374317376
58478	NC_016633	T	7	7	3318641	3318647	0 %	100 %	0 %	0 %	374317376
58479	NC_016633	GTTTG	2	10	3318668	3318677	0 %	60 %	40 %	0 %	374317376
58480	NC_016633	CTTC	2	8	3318741	3318748	0 %	50 %	0 %	50 %	374317376
58481	NC_016633	TGA	2	6	3318770	3318775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317376
58482	NC_016633	CTG	2	6	3318843	3318848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317376
58483	NC_016633	CA	3	6	3318864	3318869	50 %	0 %	0 %	50 %	374317376
58484	NC_016633	ATT	2	6	3319059	3319064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374317376
58485	NC_016633	TTG	3	9	3319083	3319091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374317376
58486	NC_016633	TTC	2	6	3319145	3319150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374317376
58487	NC_016633	GCA	2	6	3319180	3319185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374317376
58488	NC_016633	ATC	2	6	3319224	3319229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374317376
58489	NC_016633	CGGT	2	8	3319249	3319256	0 %	25 %	50 %	25 %	374317376
58490	NC_016633	GCT	2	6	3319392	3319397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317376
58491	NC_016633	TCC	2	6	3319427	3319432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374317376
58492	NC_016633	TCA	2	6	3319476	3319481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58493	NC_016633	CTG	2	6	3319483	3319488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58494	NC_016633	GTA	2	6	3319548	3319553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317377
58495	NC_016633	TGCAT	2	10	3319575	3319584	20 %	40 %	20 %	20 %	374317377
58496	NC_016633	AGTG	2	8	3319619	3319626	25 %	25 %	50 %	0 %	374317377
58497	NC_016633	TC	3	6	3319691	3319696	0 %	50 %	0 %	50 %	374317377
58498	NC_016633	CCT	2	6	3319768	3319773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374317377
58499	NC_016633	TAA	2	6	3319823	3319828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374317377
58500	NC_016633	CCT	2	6	3319870	3319875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374317377

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