MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 63182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57001	NC_016633	A	8	8	3232667	3232674	100 %	0 %	0 %	0 %	374317295
57002	NC_016633	CTTC	2	8	3232693	3232700	0 %	50 %	0 %	50 %	374317295
57003	NC_016633	CAA	2	6	3232729	3232734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374317295
57004	NC_016633	AG	3	6	3232766	3232771	50 %	0 %	50 %	0 %	374317295
57005	NC_016633	TGG	2	6	3232795	3232800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374317295
57006	NC_016633	TTC	2	6	3232805	3232810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374317295
57007	NC_016633	AGC	2	6	3232828	3232833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374317295
57008	NC_016633	CT	4	8	3232842	3232849	0 %	50 %	0 %	50 %	374317295
57009	NC_016633	T	7	7	3232925	3232931	0 %	100 %	0 %	0 %	374317295
57010	NC_016633	GCA	2	6	3232939	3232944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374317295
57011	NC_016633	AT	3	6	3233030	3233035	50 %	50 %	0 %	0 %	374317295
57012	NC_016633	AGCCGT	2	12	3233091	3233102	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374317295
57013	NC_016633	ATG	2	6	3233112	3233117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317295
57014	NC_016633	TGC	2	6	3233119	3233124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317295
57015	NC_016633	AGT	2	6	3233133	3233138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317295
57016	NC_016633	GAT	2	6	3233139	3233144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317295
57017	NC_016633	A	6	6	3233157	3233162	100 %	0 %	0 %	0 %	374317295
57018	NC_016633	TTC	2	6	3233220	3233225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374317295
57019	NC_016633	CTTC	2	8	3233236	3233243	0 %	50 %	0 %	50 %	374317295
57020	NC_016633	CGG	2	6	3233268	3233273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374317295
57021	NC_016633	CCTT	2	8	3233331	3233338	0 %	50 %	0 %	50 %	374317295
57022	NC_016633	CTG	2	6	3233514	3233519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317295
57023	NC_016633	TTC	2	6	3233555	3233560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374317295
57024	NC_016633	CTC	2	6	3233621	3233626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374317295
57025	NC_016633	T	7	7	3233673	3233679	0 %	100 %	0 %	0 %	374317295
57026	NC_016633	TTC	2	6	3233694	3233699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374317295
57027	NC_016633	GT	3	6	3233701	3233706	0 %	50 %	50 %	0 %	374317295
57028	NC_016633	CT	3	6	3233749	3233754	0 %	50 %	0 %	50 %	374317295
57029	NC_016633	ACT	2	6	3233934	3233939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374317295
57030	NC_016633	TGA	2	6	3234033	3234038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317296
57031	NC_016633	AAGC	2	8	3234100	3234107	50 %	0 %	25 %	25 %	374317296
57032	NC_016633	TTCT	2	8	3234149	3234156	0 %	75 %	0 %	25 %	374317296
57033	NC_016633	GTT	2	6	3234225	3234230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374317296
57034	NC_016633	AAG	2	6	3234236	3234241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317296
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57036	NC_016633	CAGA	2	8	3234421	3234428	50 %	0 %	25 %	25 %	374317296
57037	NC_016633	TA	3	6	3234430	3234435	50 %	50 %	0 %	0 %	374317296
57038	NC_016633	GCG	2	6	3234461	3234466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374317296
57039	NC_016633	TGC	2	6	3234537	3234542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317296
57040	NC_016633	GCG	2	6	3234588	3234593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374317296
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57043	NC_016633	ATTGG	2	10	3234708	3234717	20 %	40 %	40 %	0 %	374317296
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57047	NC_016633	TCA	2	6	3235105	3235110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374317297
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57049	NC_016633	GTG	2	6	3235158	3235163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374317297
57050	NC_016633	G	7	7	3235220	3235226	0 %	0 %	100 %	0 %	374317297
57051	NC_016633	TAG	4	12	3235448	3235459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317297
57052	NC_016633	GA	3	6	3235479	3235484	50 %	0 %	50 %	0 %	374317297
57053	NC_016633	CAG	2	6	3235577	3235582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374317297
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57055	NC_016633	GCG	2	6	3235618	3235623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374317297
57056	NC_016633	ATC	2	6	3235665	3235670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374317297
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57059	NC_016633	CATC	2	8	3235916	3235923	25 %	25 %	0 %	50 %	374317297
57060	NC_016633	CCAG	2	8	3235930	3235937	25 %	0 %	25 %	50 %	374317297
57061	NC_016633	GTT	2	6	3235946	3235951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374317297
57062	NC_016633	GGTAAC	2	12	3236012	3236023	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374317297
57063	NC_016633	CAA	2	6	3236183	3236188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57064	NC_016633	A	6	6	3236200	3236205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57065	NC_016633	CTT	3	9	3236226	3236234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57066	NC_016633	CGT	2	6	3236242	3236247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57067	NC_016633	GTC	2	6	3236310	3236315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317298
57068	NC_016633	AAC	2	6	3236321	3236326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374317298
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57083	NC_016633	ATA	2	6	3237006	3237011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374317298
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57088	NC_016633	CTT	2	6	3237323	3237328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57089	NC_016633	TAT	2	6	3237401	3237406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57090	NC_016633	GTA	2	6	3237418	3237423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317299
57091	NC_016633	TAT	2	6	3237504	3237509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374317299
57092	NC_016633	TGAGCC	2	12	3237512	3237523	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374317299
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57099	NC_016633	TC	3	6	3237977	3237982	0 %	50 %	0 %	50 %	374317299
57100	NC_016633	TC	3	6	3238002	3238007	0 %	50 %	0 %	50 %	374317299
57101	NC_016633	T	6	6	3238008	3238013	0 %	100 %	0 %	0 %	374317299
57102	NC_016633	T	7	7	3238025	3238031	0 %	100 %	0 %	0 %	374317299
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57112	NC_016633	TTC	2	6	3238552	3238557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374317300
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57116	NC_016633	TG	3	6	3238758	3238763	0 %	50 %	50 %	0 %	374317300
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57225	NC_016633	TCGG	2	8	3246196	3246203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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57234	NC_016633	TTTC	2	8	3247012	3247019	0 %	75 %	0 %	25 %	374317310
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57238	NC_016633	GGC	2	6	3247074	3247079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374317310
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57252	NC_016633	GGT	2	6	3247968	3247973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374317310
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57323	NC_016633	GAGAA	2	10	3251564	3251573	60 %	0 %	40 %	0 %	374317316
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57330	NC_016633	CGG	2	6	3252046	3252051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374317316
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57332	NC_016633	GA	3	6	3252125	3252130	50 %	0 %	50 %	0 %	374317316
57333	NC_016633	GAC	2	6	3252151	3252156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374317316
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57336	NC_016633	CTGA	2	8	3252325	3252332	25 %	25 %	25 %	25 %	374317316
57337	NC_016633	AAG	2	6	3252337	3252342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317316
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57339	NC_016633	TTTG	2	8	3252429	3252436	0 %	75 %	25 %	0 %	374317317
57340	NC_016633	TTTG	2	8	3252441	3252448	0 %	75 %	25 %	0 %	374317317
57341	NC_016633	ATT	2	6	3252466	3252471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374317317
57342	NC_016633	TTCA	2	8	3252519	3252526	25 %	50 %	0 %	25 %	374317317
57343	NC_016633	TCC	2	6	3252598	3252603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374317317
57344	NC_016633	TTGA	2	8	3252609	3252616	25 %	50 %	25 %	0 %	374317317
57345	NC_016633	TCG	2	6	3252667	3252672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317317
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57350	NC_016633	ATA	2	6	3252896	3252901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374317317
57351	NC_016633	CTTC	2	8	3252980	3252987	0 %	50 %	0 %	50 %	374317317
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