MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces bingchenggensis BCW-1 chromosome

Total Repeats: 337250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_016582	CTC	2	6	640148	640153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17502	NC_016582	TGA	2	6	640191	640196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17503	NC_016582	TCGGGC	2	12	640307	640318	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374983299
17504	NC_016582	TCGG	2	8	640323	640330	0 %	25 %	50 %	25 %	374983299
17505	NC_016582	CGCA	2	8	640354	640361	25 %	0 %	25 %	50 %	374983299
17506	NC_016582	CGC	2	6	640367	640372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983299
17507	NC_016582	CGAG	2	8	640422	640429	25 %	0 %	50 %	25 %	374983299
17508	NC_016582	CGGG	2	8	640435	640442	0 %	0 %	75 %	25 %	374983299
17509	NC_016582	CGT	2	6	640449	640454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983299
17510	NC_016582	TGCCG	2	10	640592	640601	0 %	20 %	40 %	40 %	374983299
17511	NC_016582	CG	4	8	640600	640607	0 %	0 %	50 %	50 %	374983299
17512	NC_016582	TCC	2	6	640610	640615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374983299
17513	NC_016582	GGC	2	6	640648	640653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983299
17514	NC_016582	GA	3	6	640666	640671	50 %	0 %	50 %	0 %	374983299
17515	NC_016582	CGC	2	6	640697	640702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983299
17516	NC_016582	CGCCCG	2	12	640717	640728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983299
17517	NC_016582	CTCG	2	8	640731	640738	0 %	25 %	25 %	50 %	374983299
17518	NC_016582	CAG	2	6	640786	640791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983299
17519	NC_016582	ACC	2	6	640811	640816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374983299
17520	NC_016582	ACC	2	6	640820	640825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374983299
17521	NC_016582	GCACCC	2	12	640838	640849	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	374983299
17522	NC_016582	CAG	2	6	640994	640999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983300
17523	NC_016582	TCCG	2	8	641008	641015	0 %	25 %	25 %	50 %	374983300
17524	NC_016582	GTT	2	6	641023	641028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374983300
17525	NC_016582	GCT	2	6	641047	641052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983300
17526	NC_016582	GTC	2	6	641089	641094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983300
17527	NC_016582	GCC	2	6	641117	641122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17528	NC_016582	CCG	2	6	641163	641168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17529	NC_016582	GGC	2	6	641176	641181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17530	NC_016582	GTG	2	6	641182	641187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17531	NC_016582	GAC	2	6	641215	641220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983301
17532	NC_016582	GCT	2	6	641242	641247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983301
17533	NC_016582	CTG	2	6	641249	641254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983301
17534	NC_016582	GAG	2	6	641285	641290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374983301
17535	NC_016582	CCCGGG	2	12	641316	641327	0 %	0 %	50 %	50 %	374983301
17536	NC_016582	CGC	2	6	641385	641390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983301
17537	NC_016582	CGG	3	9	641443	641451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983301
17538	NC_016582	CCG	2	6	641490	641495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983301
17539	NC_016582	CG	4	8	641596	641603	0 %	0 %	50 %	50 %	374983301
17540	NC_016582	AGG	2	6	641604	641609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374983301
17541	NC_016582	CGA	2	6	641695	641700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983301
17542	NC_016582	GCG	2	6	641742	641747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983301
17543	NC_016582	GCG	2	6	641766	641771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983301
17544	NC_016582	GC	3	6	641793	641798	0 %	0 %	50 %	50 %	374983301
17545	NC_016582	CCGG	2	8	641807	641814	0 %	0 %	50 %	50 %	374983301
17546	NC_016582	CGG	2	6	641868	641873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983302
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17549	NC_016582	GCCA	2	8	641918	641925	25 %	0 %	25 %	50 %	374983302
17550	NC_016582	GAA	2	6	641926	641931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374983302
17551	NC_016582	CGG	2	6	641935	641940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983302
17552	NC_016582	CGC	2	6	641956	641961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983302
17553	NC_016582	GCGA	2	8	641999	642006	25 %	0 %	50 %	25 %	374983302
17554	NC_016582	AGC	2	6	642008	642013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983302
17555	NC_016582	CAG	2	6	642028	642033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983302
17556	NC_016582	GCCA	2	8	642044	642051	25 %	0 %	25 %	50 %	374983302
17557	NC_016582	CG	3	6	642083	642088	0 %	0 %	50 %	50 %	374983302
17558	NC_016582	GCCAG	2	10	642096	642105	20 %	0 %	40 %	40 %	374983302
17559	NC_016582	CGG	2	6	642162	642167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983302
17560	NC_016582	CGC	2	6	642184	642189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983302
17561	NC_016582	GCCCA	2	10	642230	642239	20 %	0 %	20 %	60 %	374983302
17562	NC_016582	ACAT	2	8	642308	642315	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17563	NC_016582	CTA	2	6	642316	642321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17564	NC_016582	GC	3	6	642328	642333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17565	NC_016582	TAG	2	6	642334	642339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17566	NC_016582	TTCG	2	8	642357	642364	0 %	50 %	25 %	25 %	374983303
17567	NC_016582	CCT	2	6	642367	642372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374983303
17568	NC_016582	CCG	2	6	642396	642401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983303
17569	NC_016582	CTC	2	6	642409	642414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374983303
17570	NC_016582	CGC	2	6	642435	642440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983303
17571	NC_016582	GGA	2	6	642465	642470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374983303
17572	NC_016582	AGCA	2	8	642523	642530	50 %	0 %	25 %	25 %	374983303
17573	NC_016582	CAG	2	6	642553	642558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983303
17574	NC_016582	GCG	2	6	642559	642564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983303
17575	NC_016582	TGG	2	6	642608	642613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374983303
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17577	NC_016582	ACT	2	6	642647	642652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374983303
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17579	NC_016582	GGCG	2	8	642696	642703	0 %	0 %	75 %	25 %	374983303
17580	NC_016582	ACGA	2	8	642727	642734	50 %	0 %	25 %	25 %	374983303
17581	NC_016582	GCT	2	6	642756	642761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983303
17582	NC_016582	GCTG	2	8	642821	642828	0 %	25 %	50 %	25 %	374983303
17583	NC_016582	GCACCC	2	12	642875	642886	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	374983303
17584	NC_016582	GCT	2	6	642933	642938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983303
17585	NC_016582	GCC	2	6	642963	642968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983303
17586	NC_016582	G	6	6	643045	643050	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17587	NC_016582	CGC	2	6	643136	643141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983304
17588	NC_016582	GC	3	6	643140	643145	0 %	0 %	50 %	50 %	374983304
17589	NC_016582	CG	3	6	643156	643161	0 %	0 %	50 %	50 %	374983304
17590	NC_016582	CCA	2	6	643162	643167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374983304
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17592	NC_016582	ACT	3	9	643360	643368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374983304
17593	NC_016582	GTC	2	6	643377	643382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983304
17594	NC_016582	GCG	2	6	643411	643416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983304
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17598	NC_016582	GCT	2	6	643502	643507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983304
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17600	NC_016582	ACG	2	6	643592	643597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983304
17601	NC_016582	CAG	2	6	643644	643649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983304
17602	NC_016582	GCCTC	2	10	643774	643783	0 %	20 %	20 %	60 %	374983304
17603	NC_016582	TCA	2	6	643855	643860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374983304
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17605	NC_016582	GCG	2	6	643928	643933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983304
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17610	NC_016582	GCT	3	9	644069	644077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983304
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17612	NC_016582	CG	3	6	644201	644206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17613	NC_016582	GCC	2	6	644239	644244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17614	NC_016582	GCA	2	6	644249	644254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17616	NC_016582	CCTG	2	8	644328	644335	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17617	NC_016582	GCT	2	6	644351	644356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17618	NC_016582	GA	3	6	644386	644391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17619	NC_016582	GGT	2	6	644435	644440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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17860	NC_016582	CG	4	8	653252	653259	0 %	0 %	50 %	50 %	374983311
17861	NC_016582	CGA	2	6	653262	653267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983311
17862	NC_016582	CGACCA	2	12	653342	653353	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	374983312
17863	NC_016582	GCT	2	6	653375	653380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983312
17864	NC_016582	CACG	2	8	653393	653400	25 %	0 %	25 %	50 %	374983312
17865	NC_016582	GGC	2	6	653438	653443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983312
17866	NC_016582	GAG	2	6	653445	653450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374983312
17867	NC_016582	CGG	2	6	653504	653509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983312
17868	NC_016582	CGC	2	6	653513	653518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983312
17869	NC_016582	CTG	2	6	653523	653528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983312
17870	NC_016582	GCC	2	6	653546	653551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983312
17871	NC_016582	GGT	2	6	653552	653557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374983312
17872	NC_016582	TCA	2	6	653596	653601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374983312
17873	NC_016582	GGC	2	6	653614	653619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983312
17874	NC_016582	GCG	2	6	653747	653752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983312
17875	NC_016582	CGA	2	6	653780	653785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983312
17876	NC_016582	CGC	2	6	653789	653794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983312
17877	NC_016582	CGC	2	6	653810	653815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983312
17878	NC_016582	CTG	2	6	653838	653843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983312
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17880	NC_016582	CTC	2	6	653910	653915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374983313
17881	NC_016582	GGC	2	6	653918	653923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983313
17882	NC_016582	CGC	2	6	653930	653935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983313
17883	NC_016582	CGCGTT	2	12	653960	653971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983313
17884	NC_016582	TGC	2	6	653974	653979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983313
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17889	NC_016582	GGC	2	6	654071	654076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983313
17890	NC_016582	GAT	2	6	654080	654085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374983313
17891	NC_016582	GGA	2	6	654122	654127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374983313
17892	NC_016582	TCG	2	6	654160	654165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983313
17893	NC_016582	CGG	2	6	654170	654175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983313
17894	NC_016582	CCGG	2	8	654179	654186	0 %	0 %	50 %	50 %	374983313
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17900	NC_016582	CGG	3	9	654489	654497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983313
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17902	NC_016582	GCT	2	6	654563	654568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983313
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17909	NC_016582	CTG	2	6	654717	654722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983313
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17915	NC_016582	CGTA	2	8	655120	655127	25 %	25 %	25 %	25 %	374983313
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17918	NC_016582	ACA	2	6	655189	655194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17919	NC_016582	GAGC	2	8	655206	655213	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17920	NC_016582	CGT	2	6	655246	655251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17921	NC_016582	TCC	2	6	655256	655261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374983314
17922	NC_016582	CCG	2	6	655268	655273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983314
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17924	NC_016582	TACG	2	8	655354	655361	25 %	25 %	25 %	25 %	374983314
17925	NC_016582	GCT	2	6	655365	655370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983314
17926	NC_016582	ATC	2	6	655408	655413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374983314
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17928	NC_016582	CTA	2	6	655464	655469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374983314
17929	NC_016582	CTA	2	6	655473	655478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374983314
17930	NC_016582	ACG	2	6	655487	655492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983314
17931	NC_016582	CGG	2	6	655497	655502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983314
17932	NC_016582	ACT	2	6	655589	655594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374983314
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17935	NC_016582	GGT	2	6	655728	655733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374983314
17936	NC_016582	ATG	2	6	655747	655752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374983314
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17939	NC_016582	CAC	2	6	655848	655853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374983314
17940	NC_016582	ACC	2	6	655856	655861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374983314
17941	NC_016582	CTG	2	6	655869	655874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983314
17942	NC_016582	CCG	2	6	655883	655888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983314
17943	NC_016582	GGACCT	2	12	655895	655906	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374983314
17944	NC_016582	CGC	2	6	655916	655921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983314
17945	NC_016582	CGG	2	6	655956	655961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983314
17946	NC_016582	ACA	2	6	656003	656008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374983314
17947	NC_016582	GCG	3	9	656021	656029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983314
17948	NC_016582	CAT	2	6	656031	656036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374983314
17949	NC_016582	TCT	2	6	656084	656089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374983314
17950	NC_016582	CTC	2	6	656100	656105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374983314
17951	NC_016582	GGCCG	2	10	656119	656128	0 %	0 %	60 %	40 %	374983314
17952	NC_016582	CCT	2	6	656135	656140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374983314
17953	NC_016582	ACGG	2	8	656146	656153	25 %	0 %	50 %	25 %	374983314
17954	NC_016582	CACC	2	8	656228	656235	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17955	NC_016582	CTCGC	2	10	656331	656340	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17956	NC_016582	GT	3	6	656452	656457	0 %	50 %	50 %	0 %	374983315
17957	NC_016582	CAC	2	6	656504	656509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374983315
17958	NC_016582	CTG	2	6	656544	656549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983315
17959	NC_016582	GGCT	2	8	656577	656584	0 %	25 %	50 %	25 %	374983315
17960	NC_016582	GGCA	2	8	656685	656692	25 %	0 %	50 %	25 %	374983315
17961	NC_016582	GAT	2	6	656750	656755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374983315
17962	NC_016582	CAGCG	2	10	656862	656871	20 %	0 %	40 %	40 %	374983315
17963	NC_016582	TGG	2	6	656929	656934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374983315
17964	NC_016582	GCA	2	6	656936	656941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983315
17965	NC_016582	GGCC	2	8	656942	656949	0 %	0 %	50 %	50 %	374983315
17966	NC_016582	CGG	2	6	656975	656980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983315
17967	NC_016582	AGC	2	6	657022	657027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983315
17968	NC_016582	TACGCC	2	12	657090	657101	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374983315
17969	NC_016582	ACC	2	6	657127	657132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374983315
17970	NC_016582	CTG	2	6	657177	657182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17971	NC_016582	CTG	2	6	657198	657203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983316
17972	NC_016582	TGC	2	6	657214	657219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983316
17973	NC_016582	GCCCG	2	10	657246	657255	0 %	0 %	40 %	60 %	374983316
17974	NC_016582	TGC	2	6	657310	657315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983316
17975	NC_016582	CT	3	6	657319	657324	0 %	50 %	0 %	50 %	374983316
17976	NC_016582	CCG	2	6	657326	657331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983316
17977	NC_016582	GCC	2	6	657367	657372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983316
17978	NC_016582	GCG	3	9	657410	657418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983316
17979	NC_016582	CGC	2	6	657434	657439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983316
17980	NC_016582	CGG	2	6	657460	657465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983316
17981	NC_016582	CG	3	6	657474	657479	0 %	0 %	50 %	50 %	374983316
17982	NC_016582	CCGCG	2	10	657482	657491	0 %	0 %	40 %	60 %	374983316
17983	NC_016582	GGC	2	6	657521	657526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983316
17984	NC_016582	CCG	2	6	657537	657542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983316
17985	NC_016582	GC	5	10	657605	657614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17986	NC_016582	CGC	2	6	657624	657629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17987	NC_016582	CGCC	2	8	657652	657659	0 %	0 %	25 %	75 %	374983317
17988	NC_016582	CGC	2	6	657682	657687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983317
17989	NC_016582	CGA	2	6	657736	657741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983317
17990	NC_016582	CCA	2	6	657748	657753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374983317
17991	NC_016582	CAG	2	6	657830	657835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983317
17992	NC_016582	TTC	2	6	657906	657911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374983317
17993	NC_016582	CCT	2	6	657934	657939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374983317
17994	NC_016582	TCG	2	6	657940	657945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983317
17995	NC_016582	GGA	2	6	657949	657954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374983317
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17997	NC_016582	AC	3	6	658046	658051	50 %	0 %	0 %	50 %	374983317
17998	NC_016582	GTG	2	6	658061	658066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374983317
17999	NC_016582	GTC	2	6	658070	658075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983317
18000	NC_016582	CGA	2	6	658162	658167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983317

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