MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces bingchenggensis BCW-1 chromosome

Total Repeats: 337250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_016582	CCGT	2	8	551722	551729	0 %	25 %	25 %	50 %	374983232
15002	NC_016582	TGA	2	6	551780	551785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374983232
15003	NC_016582	TCG	2	6	551818	551823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983232
15004	NC_016582	GTC	2	6	551841	551846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983232
15005	NC_016582	TCC	2	6	551854	551859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374983232
15006	NC_016582	CGCGA	2	10	551871	551880	20 %	0 %	40 %	40 %	374983232
15007	NC_016582	GTG	2	6	551991	551996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_016582	GTA	2	6	552053	552058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374983233
15009	NC_016582	GGCGAC	2	12	552089	552100	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374983233
15010	NC_016582	CCG	2	6	552151	552156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983233
15011	NC_016582	CTT	2	6	552209	552214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374983233
15012	NC_016582	AGT	2	6	552241	552246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374983233
15013	NC_016582	GGT	2	6	552319	552324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374983233
15014	NC_016582	GGC	2	6	552338	552343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983233
15015	NC_016582	CGG	2	6	552388	552393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983233
15016	NC_016582	CTG	2	6	552431	552436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983233
15017	NC_016582	GAT	2	6	552437	552442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374983233
15018	NC_016582	GGC	2	6	552443	552448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983233
15019	NC_016582	GCCTTG	2	12	552534	552545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983233
15020	NC_016582	GGC	2	6	552566	552571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983233
15021	NC_016582	CTG	2	6	552617	552622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983233
15022	NC_016582	CGC	2	6	552668	552673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983233
15023	NC_016582	T	6	6	552713	552718	0 %	100 %	0 %	0 %	374983233
15024	NC_016582	GTT	2	6	552719	552724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374983233
15025	NC_016582	GTT	2	6	552751	552756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374983233
15026	NC_016582	GGA	2	6	552773	552778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374983233
15027	NC_016582	CGG	2	6	552889	552894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983233
15028	NC_016582	ACGGA	2	10	552974	552983	40 %	0 %	40 %	20 %	374983233
15029	NC_016582	CGA	2	6	553010	553015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983233
15030	NC_016582	GCG	2	6	553056	553061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983233
15031	NC_016582	GCA	2	6	553072	553077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983233
15032	NC_016582	CGGGGG	2	12	553084	553095	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	374983233
15033	NC_016582	GCG	2	6	553134	553139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983233
15034	NC_016582	GTC	2	6	553272	553277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983233
15035	NC_016582	AGG	2	6	553294	553299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374983233
15036	NC_016582	GTC	2	6	553382	553387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983233
15037	NC_016582	GGC	2	6	553406	553411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983233
15038	NC_016582	TCG	2	6	553425	553430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983233
15039	NC_016582	GCC	3	9	553457	553465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983233
15040	NC_016582	GCC	2	6	553478	553483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983233
15041	NC_016582	GCG	2	6	553659	553664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15042	NC_016582	ATG	2	6	553665	553670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_016582	GAT	2	6	553690	553695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_016582	AAC	2	6	553704	553709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15045	NC_016582	GCGG	2	8	553750	553757	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15046	NC_016582	GGC	2	6	553836	553841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15047	NC_016582	ATGTC	2	10	553866	553875	20 %	40 %	20 %	20 %	374983234
15048	NC_016582	TGG	2	6	553879	553884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374983234
15049	NC_016582	GTC	2	6	553902	553907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983234
15050	NC_016582	GCG	2	6	553945	553950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983234
15051	NC_016582	GC	3	6	554053	554058	0 %	0 %	50 %	50 %	374983234
15052	NC_016582	CTCA	2	8	554088	554095	25 %	25 %	0 %	50 %	374983234
15053	NC_016582	CGA	2	6	554141	554146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983234
15054	NC_016582	GGC	2	6	554171	554176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983234
15055	NC_016582	TGA	2	6	554225	554230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374983234
15056	NC_016582	GCG	2	6	554269	554274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983234
15057	NC_016582	CCG	2	6	554275	554280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983234
15058	NC_016582	CAG	2	6	554286	554291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983234
15059	NC_016582	GA	3	6	554298	554303	50 %	0 %	50 %	0 %	374983234
15060	NC_016582	GCC	2	6	554347	554352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983234
15061	NC_016582	CATT	2	8	554395	554402	25 %	50 %	0 %	25 %	374983234
15062	NC_016582	CGA	2	6	554414	554419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983234
15063	NC_016582	CCG	2	6	554420	554425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983234
15064	NC_016582	CG	3	6	554456	554461	0 %	0 %	50 %	50 %	374983234
15065	NC_016582	TCA	2	6	554465	554470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374983234
15066	NC_016582	GGC	2	6	554490	554495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983234
15067	NC_016582	GCC	2	6	554500	554505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983234
15068	NC_016582	GGC	2	6	554508	554513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983234
15069	NC_016582	GACGAT	2	12	554523	554534	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374983234
15070	NC_016582	GCCC	2	8	554551	554558	0 %	0 %	25 %	75 %	374983234
15071	NC_016582	CGC	2	6	554590	554595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983234
15072	NC_016582	CAG	2	6	554664	554669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983234
15073	NC_016582	GAC	2	6	554691	554696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983234
15074	NC_016582	GC	3	6	554749	554754	0 %	0 %	50 %	50 %	374983234
15075	NC_016582	CGG	2	6	554762	554767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983234
15076	NC_016582	CCG	2	6	554795	554800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983234
15077	NC_016582	GTGGCT	3	18	554868	554885	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15078	NC_016582	CGTGGT	4	24	554909	554932	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15079	NC_016582	CGC	2	6	555042	555047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15080	NC_016582	TAT	2	6	555077	555082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15081	NC_016582	CA	3	6	555116	555121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15082	NC_016582	GCT	2	6	555184	555189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983235
15083	NC_016582	CGA	3	9	555270	555278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983235
15084	NC_016582	GGA	2	6	555283	555288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374983235
15085	NC_016582	GCC	2	6	555292	555297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983235
15086	NC_016582	CGATGG	2	12	555309	555320	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374983235
15087	NC_016582	TGA	2	6	555375	555380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374983235
15088	NC_016582	GCCGAG	2	12	555412	555423	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374983235
15089	NC_016582	CAGGGC	2	12	555424	555435	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374983235
15090	NC_016582	GAG	2	6	555442	555447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374983235
15091	NC_016582	GGC	2	6	555472	555477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983235
15092	NC_016582	CGG	2	6	555486	555491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983235
15093	NC_016582	AGG	2	6	555494	555499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374983235
15094	NC_016582	CGG	2	6	555513	555518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983235
15095	NC_016582	CGG	2	6	555526	555531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983235
15096	NC_016582	CGA	2	6	555543	555548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983235
15097	NC_016582	GGC	2	6	555613	555618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983235
15098	NC_016582	GC	3	6	555702	555707	0 %	0 %	50 %	50 %	374983235
15099	NC_016582	GCG	2	6	555737	555742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983235
15100	NC_016582	CGG	3	9	555786	555794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983235
15101	NC_016582	AGC	2	6	555812	555817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983235
15102	NC_016582	GGGTC	2	10	555818	555827	0 %	20 %	60 %	20 %	374983235
15103	NC_016582	GGC	2	6	555865	555870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983235
15104	NC_016582	GGCC	2	8	555888	555895	0 %	0 %	50 %	50 %	374983235
15105	NC_016582	GGTG	2	8	555931	555938	0 %	25 %	75 %	0 %	374983235
15106	NC_016582	CGC	2	6	555960	555965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983235
15107	NC_016582	GTG	2	6	555971	555976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374983235
15108	NC_016582	GGCGCG	2	12	555997	556008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983235
15109	NC_016582	TGG	2	6	556056	556061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374983235
15110	NC_016582	AAC	2	6	556094	556099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374983235
15111	NC_016582	CGG	3	9	556119	556127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983235
15112	NC_016582	TGA	2	6	556128	556133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374983235
15113	NC_016582	GCG	2	6	556183	556188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983235
15114	NC_016582	CGAC	2	8	556208	556215	25 %	0 %	25 %	50 %	374983235
15115	NC_016582	CGG	2	6	556221	556226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983235
15116	NC_016582	CGG	2	6	556239	556244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983235
15117	NC_016582	GCT	2	6	556273	556278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983235
15118	NC_016582	CAG	2	6	556300	556305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374983235
15119	NC_016582	CGG	2	6	556323	556328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983235
15120	NC_016582	GCG	2	6	556378	556383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983235
15121	NC_016582	GTGG	2	8	556399	556406	0 %	25 %	75 %	0 %	374983235
15122	NC_016582	GTG	2	6	556442	556447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374983235
15123	NC_016582	CGGTGG	2	12	556482	556493	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	374983235
15124	NC_016582	GCG	2	6	556515	556520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983235
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15128	NC_016582	CCG	2	6	556676	556681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15215	NC_016582	CTC	2	6	559832	559837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15223	NC_016582	ATC	2	6	560218	560223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15225	NC_016582	CCG	2	6	560240	560245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15226	NC_016582	TAC	2	6	560276	560281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15228	NC_016582	CGC	2	6	560367	560372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983239
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15240	NC_016582	CCG	3	9	560800	560808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983239
15241	NC_016582	GAG	2	6	560831	560836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374983239
15242	NC_016582	TGA	2	6	560874	560879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374983239
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15244	NC_016582	CGG	2	6	560954	560959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983239
15245	NC_016582	CTG	2	6	561044	561049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983239
15246	NC_016582	CGG	2	6	561064	561069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983239
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15251	NC_016582	TCG	2	6	561366	561371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983239
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15253	NC_016582	CTG	3	9	561407	561415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983239
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15274	NC_016582	G	8	8	562181	562188	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15275	NC_016582	GAG	3	9	562190	562198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15276	NC_016582	CTG	2	6	562201	562206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983240
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15281	NC_016582	CTCG	2	8	562403	562410	0 %	25 %	25 %	50 %	374983240
15282	NC_016582	CG	3	6	562421	562426	0 %	0 %	50 %	50 %	374983240
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15322	NC_016582	CCGG	2	8	564168	564175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15323	NC_016582	TCC	2	6	564204	564209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15353	NC_016582	GAA	2	6	565107	565112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374983241
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15355	NC_016582	GCC	3	9	565153	565161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983241
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15361	NC_016582	AGAGA	2	10	565354	565363	60 %	0 %	40 %	0 %	374983241
15362	NC_016582	GGC	2	6	565365	565370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983241
15363	NC_016582	CCG	2	6	565385	565390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983241
15364	NC_016582	GGA	2	6	565407	565412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374983241
15365	NC_016582	CGG	2	6	565423	565428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983241
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15370	NC_016582	CCG	2	6	565530	565535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983241
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15392	NC_016582	GAA	2	6	566301	566306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374983241
15393	NC_016582	CTG	2	6	566311	566316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983241
15394	NC_016582	TCG	3	9	566348	566356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983241
15395	NC_016582	GCT	2	6	566379	566384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983241
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15404	NC_016582	GCCG	2	8	566777	566784	0 %	0 %	50 %	50 %	374983241
15405	NC_016582	CGT	2	6	566809	566814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983241
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15454	NC_016582	ATC	2	6	568588	568593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374983241
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15459	NC_016582	CG	3	6	568762	568767	0 %	0 %	50 %	50 %	374983242
15460	NC_016582	GT	3	6	568918	568923	0 %	50 %	50 %	0 %	374983242
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15465	NC_016582	CCAC	2	8	568987	568994	25 %	0 %	0 %	75 %	374983242
15466	NC_016582	CTC	2	6	569011	569016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374983242
15467	NC_016582	AGG	2	6	569084	569089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374983242
15468	NC_016582	CGC	2	6	569115	569120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983242
15469	NC_016582	TCG	2	6	569160	569165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983242
15470	NC_016582	GCG	2	6	569178	569183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983242
15471	NC_016582	TGA	2	6	569195	569200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374983242
15472	NC_016582	GGA	2	6	569208	569213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374983242
15473	NC_016582	GGA	2	6	569223	569228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374983242
15474	NC_016582	GAG	3	9	569275	569283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374983242
15475	NC_016582	GAG	2	6	569320	569325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374983242
15476	NC_016582	GCG	2	6	569328	569333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983242
15477	NC_016582	GGC	2	6	569340	569345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374983242
15478	NC_016582	GCC	2	6	569384	569389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15479	NC_016582	CGG	2	6	569396	569401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15480	NC_016582	TCC	2	6	569454	569459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374983243
15481	NC_016582	GAA	2	6	569480	569485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374983243
15482	NC_016582	GCC	2	6	569502	569507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374983243
15483	NC_016582	GCGG	2	8	569556	569563	0 %	0 %	75 %	25 %	374983243
15484	NC_016582	TCG	2	6	569599	569604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374983243
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15487	NC_016582	CCA	2	6	569689	569694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374983243
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15491	NC_016582	TCGG	2	8	569783	569790	0 %	25 %	50 %	25 %	374983244
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15497	NC_016582	AGGCG	2	10	569988	569997	20 %	0 %	60 %	20 %	374983244
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15500	NC_016582	CGGG	2	8	570025	570032	0 %	0 %	75 %	25 %	374983244

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