MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 chromosome

Total Repeats: 297766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_015957	GCG	2	6	541471	541476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008434
15002	NC_015957	CGG	2	6	541496	541501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008434
15003	NC_015957	GC	3	6	541502	541507	0 %	0 %	50 %	50 %	345008434
15004	NC_015957	CGGC	2	8	541531	541538	0 %	0 %	50 %	50 %	345008434
15005	NC_015957	GCT	2	6	541607	541612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008434
15006	NC_015957	GAC	2	6	541614	541619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008434
15007	NC_015957	GCG	2	6	541620	541625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008434
15008	NC_015957	GGCG	2	8	541688	541695	0 %	0 %	75 %	25 %	345008434
15009	NC_015957	TCT	2	6	541735	541740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008434
15010	NC_015957	CGA	2	6	541748	541753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008434
15011	NC_015957	CTT	2	6	541805	541810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008434
15012	NC_015957	CCG	2	6	541842	541847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008434
15013	NC_015957	ACG	2	6	541875	541880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008434
15014	NC_015957	GCG	2	6	541926	541931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008434
15015	NC_015957	GCC	3	9	541935	541943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008434
15016	NC_015957	ATG	2	6	541955	541960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008434
15017	NC_015957	TGACA	2	10	541963	541972	40 %	20 %	20 %	20 %	345008435
15018	NC_015957	CGT	2	6	541993	541998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008435
15019	NC_015957	ACC	2	6	542064	542069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008435
15020	NC_015957	GGC	2	6	542082	542087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008435
15021	NC_015957	GTC	2	6	542138	542143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008435
15022	NC_015957	CGG	2	6	542172	542177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008435
15023	NC_015957	GGC	2	6	542233	542238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008435
15024	NC_015957	TCGGCG	2	12	542262	542273	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345008435
15025	NC_015957	GC	3	6	542277	542282	0 %	0 %	50 %	50 %	345008435
15026	NC_015957	GGT	2	6	542356	542361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008435
15027	NC_015957	GAT	2	6	542365	542370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008435
15028	NC_015957	GGC	2	6	542371	542376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008435
15029	NC_015957	CGC	2	6	542395	542400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008435
15030	NC_015957	GC	3	6	542399	542404	0 %	0 %	50 %	50 %	345008435
15031	NC_015957	GCG	3	9	542467	542475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008435
15032	NC_015957	TCG	2	6	542550	542555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008435
15033	NC_015957	GC	3	6	542602	542607	0 %	0 %	50 %	50 %	345008435
15034	NC_015957	GCG	2	6	542720	542725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15035	NC_015957	TTCGC	2	10	542848	542857	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15036	NC_015957	GCG	2	6	542965	542970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008436
15037	NC_015957	GAA	2	6	543024	543029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345008436
15038	NC_015957	AGC	2	6	543077	543082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008436
15039	NC_015957	CGG	2	6	543086	543091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008436
15040	NC_015957	GCC	2	6	543126	543131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008436
15041	NC_015957	TCT	2	6	543143	543148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008436
15042	NC_015957	CTT	2	6	543231	543236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008436
15043	NC_015957	GAA	2	6	543267	543272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345008436
15044	NC_015957	GCC	2	6	543285	543290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008436
15045	NC_015957	AAC	2	6	543292	543297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345008436
15046	NC_015957	TGC	2	6	543605	543610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008436
15047	NC_015957	CGG	2	6	543654	543659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008436
15048	NC_015957	GAA	2	6	543678	543683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345008436
15049	NC_015957	GCA	2	6	543708	543713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008436
15050	NC_015957	ACA	2	6	543758	543763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345008436
15051	NC_015957	CCA	2	6	543788	543793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008436
15052	NC_015957	CCCG	2	8	543798	543805	0 %	0 %	25 %	75 %	345008436
15053	NC_015957	CGG	2	6	543921	543926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008436
15054	NC_015957	CGA	2	6	543969	543974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008436
15055	NC_015957	TGGA	2	8	544021	544028	25 %	25 %	50 %	0 %	345008436
15056	NC_015957	CGG	2	6	544111	544116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15057	NC_015957	CGA	2	6	544149	544154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15058	NC_015957	G	6	6	544166	544171	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_015957	TGCC	2	8	544216	544223	0 %	25 %	25 %	50 %	345008437
15060	NC_015957	CGT	2	6	544247	544252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008437
15061	NC_015957	CGC	2	6	544285	544290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008437
15062	NC_015957	GCG	2	6	544308	544313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008437
15063	NC_015957	GGC	2	6	544316	544321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008437
15064	NC_015957	GGC	2	6	544328	544333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008437
15065	NC_015957	GCG	2	6	544365	544370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008437
15066	NC_015957	GGA	2	6	544429	544434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008437
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15068	NC_015957	CG	3	6	544511	544516	0 %	0 %	50 %	50 %	345008437
15069	NC_015957	GGC	2	6	544519	544524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008437
15070	NC_015957	CCAAGG	2	12	544551	544562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008437
15071	NC_015957	TCG	2	6	544572	544577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008437
15072	NC_015957	TGC	2	6	544677	544682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008437
15073	NC_015957	CGA	2	6	544722	544727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008437
15074	NC_015957	CGC	2	6	544770	544775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008437
15075	NC_015957	GAG	2	6	544781	544786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008437
15076	NC_015957	GAT	2	6	544798	544803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008437
15077	NC_015957	GCC	3	9	544846	544854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008438
15078	NC_015957	GCT	3	9	544887	544895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008438
15079	NC_015957	CGG	2	6	544917	544922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008438
15080	NC_015957	CTT	2	6	544932	544937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008438
15081	NC_015957	TG	3	6	544945	544950	0 %	50 %	50 %	0 %	345008438
15082	NC_015957	GC	3	6	545087	545092	0 %	0 %	50 %	50 %	345008438
15083	NC_015957	GTC	2	6	545155	545160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008438
15084	NC_015957	G	6	6	545196	545201	0 %	0 %	100 %	0 %	345008438
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15087	NC_015957	GTG	2	6	545410	545415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008438
15088	NC_015957	CCG	2	6	545430	545435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008438
15089	NC_015957	GGC	2	6	545494	545499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008438
15090	NC_015957	TCC	2	6	545507	545512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008438
15091	NC_015957	TGC	3	9	545519	545527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008438
15092	NC_015957	ATG	2	6	545548	545553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008438
15093	NC_015957	CTGA	2	8	545595	545602	25 %	25 %	25 %	25 %	345008438
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15095	NC_015957	CGGC	2	8	545627	545634	0 %	0 %	50 %	50 %	345008439
15096	NC_015957	AGG	2	6	545636	545641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008439
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15101	NC_015957	GGT	2	6	545762	545767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008439
15102	NC_015957	GGC	2	6	545771	545776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008439
15103	NC_015957	GCT	4	12	545799	545810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008439
15104	NC_015957	CTG	2	6	545812	545817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008439
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15106	NC_015957	CTG	2	6	545980	545985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008439
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15109	NC_015957	CCG	2	6	546066	546071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008439
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15111	NC_015957	GCC	2	6	546136	546141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008439
15112	NC_015957	GCG	2	6	546156	546161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008439
15113	NC_015957	TGC	2	6	546257	546262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008439
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15115	NC_015957	GCA	2	6	546302	546307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008439
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15119	NC_015957	GTC	2	6	546601	546606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008439
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15121	NC_015957	TCA	2	6	546695	546700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345008439
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15124	NC_015957	CGG	3	9	546987	546995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008439
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15151	NC_015957	GGTCGC	2	12	547898	547909	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345008440
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15168	NC_015957	GCC	2	6	548610	548615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15191	NC_015957	AAGG	2	8	549254	549261	50 %	0 %	50 %	0 %	345008442
15192	NC_015957	TCG	2	6	549315	549320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008442
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15223	NC_015957	GGGC	2	8	550184	550191	0 %	0 %	75 %	25 %	345008442
15224	NC_015957	TTC	2	6	550202	550207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008442
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15229	NC_015957	TCGA	2	8	550292	550299	25 %	25 %	25 %	25 %	345008442
15230	NC_015957	AAG	2	6	550301	550306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345008442
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15232	NC_015957	TCG	2	6	550377	550382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008442
15233	NC_015957	GC	3	6	550429	550434	0 %	0 %	50 %	50 %	345008442
15234	NC_015957	ACC	2	6	550488	550493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008442
15235	NC_015957	CAG	2	6	550511	550516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008442
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15237	NC_015957	GAG	2	6	550562	550567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008442
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15239	NC_015957	CGG	2	6	550582	550587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008442
15240	NC_015957	GCC	2	6	550707	550712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008443
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15243	NC_015957	CTG	2	6	550840	550845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008443
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15254	NC_015957	GC	3	6	551338	551343	0 %	0 %	50 %	50 %	345008443
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15259	NC_015957	TCG	2	6	551429	551434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008443
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15262	NC_015957	CCG	2	6	551587	551592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15263	NC_015957	CGC	2	6	551615	551620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008444
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15291	NC_015957	CGGT	2	8	552430	552437	0 %	25 %	50 %	25 %	345008445
15292	NC_015957	AAT	2	6	552617	552622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15293	NC_015957	GCC	2	6	552766	552771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008446
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15330	NC_015957	ATC	2	6	554262	554267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345008447
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15333	NC_015957	CCG	2	6	554352	554357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15334	NC_015957	GCC	2	6	554365	554370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15354	NC_015957	CGC	2	6	555081	555086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15355	NC_015957	GCC	2	6	555106	555111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15356	NC_015957	GCC	2	6	555130	555135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15357	NC_015957	GCC	2	6	555154	555159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15358	NC_015957	GCC	2	6	555178	555183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15360	NC_015957	GCT	2	6	555285	555290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008449
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15481	NC_015957	GGGCG	2	10	559525	559534	0 %	0 %	80 %	20 %	345008454
15482	NC_015957	AGC	2	6	559569	559574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008454
15483	NC_015957	CG	3	6	559603	559608	0 %	0 %	50 %	50 %	345008454
15484	NC_015957	GAC	2	6	559634	559639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008454
15485	NC_015957	TCTATC	2	12	559674	559685	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	345008454
15486	NC_015957	CGG	2	6	559721	559726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008454
15487	NC_015957	GC	3	6	559753	559758	0 %	0 %	50 %	50 %	345008454
15488	NC_015957	CGCC	2	8	559776	559783	0 %	0 %	25 %	75 %	345008454
15489	NC_015957	CTT	2	6	559813	559818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008454
15490	NC_015957	CG	4	8	559891	559898	0 %	0 %	50 %	50 %	345008454
15491	NC_015957	GCGG	2	8	559912	559919	0 %	0 %	75 %	25 %	345008454
15492	NC_015957	GCG	3	9	559952	559960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008454
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15496	NC_015957	TCGC	2	8	560051	560058	0 %	25 %	25 %	50 %	345008454
15497	NC_015957	GGGC	2	8	560083	560090	0 %	0 %	75 %	25 %	345008454
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